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DNA骨架硫修饰研究又获新成果

上海交通大学、武汉大学与美国麻省理工学院共同合作,以王连荣为第一作者、陈实和彼得·帝丹为共同通讯作者联合完成的论文《DNA磷硫酰化修饰在细菌基因组中广泛分布且量化存在》日前在美国《国家科学院院刊》上发表,这是DNA骨架上硫修饰研究领域又一个新的重大进展,也是邓子新团队与彼得·帝丹合作报道了DNA骨架上硫修饰化学本质后持续合作的新成果。 该论文集高敏检测与精细量化于一体,从飞摩尔水平(10-12摩尔)对16种不同序列的磷硫酰化DNA双核苷酸及其在染色体上的修饰频率进行同步鉴定,实现了硫修饰DNA快速、高效、高通量、可定量的化学检测。在此基础上,从栖息于多样化生态环境的多种代表性微生物中发现了新型硫修饰DNA上前所未见的修饰方式包括d(GPST)、d(CPSA)、d(TPSA)、d(APSA)和d(CPSC),阐明了DNA硫修饰在从土壤微生物到海洋微生物,从植物致病菌到人类病原菌,从好氧菌到厌氧菌,甚至在最小......阅读全文

揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性

   DNA是重要的遗传物质,储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息,影响生命活动,如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定,调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的,DNA骨架上硫原子取代磷原子上

上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱

  近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破,《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modif

由德林等破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱

  记者日前从上海交通大学获悉,该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。  DNA是生命的遗传物质,由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化

邓子新团队DNA骨架硫修饰研究获新突破

  近日,上海交通大学邓子新院士团队对DNA骨架硫修饰生物学意义的研究又获得两项突破。   聚焦核酸研究的著名国际学术刊物《核酸研究》(Nucleic Acids Research)以特写文章(Featured article)发表了由该团队由德林副教授主持,博士生徐铁刚和姚芬为共同第一作者的

上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制

细菌DNA新型限制修饰机制  近日,上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展,由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作,以博士生曹博为第一作者,在微生物领域顶级期刊《Molecular Mi

国际化学生物学年会首次在中国举办

  10月18日上海讯 我们的衣食住行无不与化学息息相关,我们生活在化学的世界里。化学和化学品给我们的生活锦上添花,却也带来了环境污染等社会问题,如何通过化学创新,让我们的生活更加美好,是化学生物学领域科学家们致力研究的方向。17日下午在上海开幕的第六届国际化学生物学会年会,就有包括诺贝尔化学奖获得

邓子新团队发现DNA第六元素硫

找到对抗艾滋病新方法,新成果将发表于《自然—化学生物学》  DNA是生命的物质基础,科学界以往认为,它是由五种元素——碳、氢、氧、氮、磷构成的四种核苷酸序列。如今,上海交大科研人员发现了DNA的第六元素——硫,硫的“自我修饰”改变了遗传特性。通过“基因药物”干扰病菌DNA的“硫修饰”,有望

邓子新院士:实验室要营造利于创新的文化

5月29日下午,上海交大生命学院召开推进学院文化建设动员会。学院院长邓子新院士在讲话中,就如何开展实验室文化建设和学院教师分享了他多年的心得。邓院士认为,学校开展校园精神文化建设,生命学院应趁势而上,积极推进学院精神文化建设,无论把这个活动纳入全国的大框架,还是小到一个研究组,一个办公室,都是一个及

上海有机化学所硫肽类抗生素生物合成研究取得进展

  经过近6年的不懈努力,中国科学院上海有机化学研究所刘文课题组的专家通过最为典型的硫链丝菌素及其类似物盐屋霉素A的比较研究,发现硫肽类抗生素起源于一条核糖体编码的前体肽,经过包括环化脱水/脱氢形成噻唑/咪唑环、脱水形成脱水氨基酸以及【4 + 2】环合反应等后修饰步骤构建了这一家族化合物所共有的特征

肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用

  人类肠道中含有极其丰富的微生物,其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同,构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上,肠道微生物各组分间相对平衡,保持稳态,从而实现其与宿主互利共生。对于宿主,其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括

肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用

  人类肠道中含有极其丰富的微生物,其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同,构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上,肠道微生物各组分间相对平衡,保持稳态,从而实现其与宿主互利共生。对于宿主,其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括

肠道糖基化在维护肠道微生物稳态中的作用

  人类肠道中含有极其丰富的微生物,其所含基因总数是人类基因组的150余倍。这些微生物通过相互竞争、互补和协同,构成了微生物-微生物和微生物-宿主关系的复杂网络。在此基础上,肠道微生物各组分间相对平衡,保持稳态,从而实现其与宿主互利共生。对于宿主,其肠道内存在多种屏障以维持肠内微生物的稳态。其中包括

质谱沙龙第十九期活动报道

  2009年5月23日,质谱沙龙第十九期活动在清华大学生物医学测试中心举行。此次到会者除了来自二炮总医院、西苑医院、清华大学医学院、发酵研究院、中科院微生物研究所、空军总医院、天津博纳艾杰尔科技、AB公司等老朋友外,还有来自戴安公司、东西电子的新朋友。报告后的讨论一直洋溢着热烈的气氛。   

国家重点基础研究发展计划09申报指南发布

  科技部基础研究司日前发布了《关于发布国家重点基础研究发展计划(含重大科学研究计划)2009年度项目申报指南的通知》。   国家重点基础研究发展计划是以国家重大需求为导向,对我国未来发展和科学技术进步具有战略性、前瞻性、全局性和带动性的基础研究发展计划,主要支持面向国家重大需求的基础研究领域和重

首届质谱论坛学术报道

  在2010年10月15日召开的首届质谱论坛(首届质谱论坛召开 质谱中心三年庆典)上,共有四位教授、专家做了学术报告,100余位关心质谱技术的专家、学生和几位报告人一起,分享了精彩的报告。       布鲁克

首届中国放线菌生物学与产业化研讨会召开

  由中国微生物学会分子微生物学及生物工程专业委员会、上海市微生物学会联合主办,中科院合成生物学重点实验室、上海交通大学微生物代谢国家重点实验室联合承办的“首届中国放线菌生物学与产业化研讨会”于12月1日至2日在中科院上海生命科学研究院召开。来自全国科研院所和制药企业的专家学者约240 人出席了

美发明可识别固氮细菌的选择剂

据《每日科学》网站8月25日报道,美国科学家发明了一种识别固氮细菌的方法,无需经过基因组测序或者遗传修饰,这将有利于更好地产生清洁能源氢气。 固氮细菌是以空气中的氮气为养料,形成自身蛋白质的微生物,它们生活在土壤以及某些植物的根部,把空气中的氮转化成化学养分来供植物生长。固氮细菌是氢的重要微生物来

国家基金委八大学部公布“优先发展领域及主要研究方向”

  “十三五”期间,通过支持我国优势学科和交叉学科的重要前沿方向,以及从国家重大需求中凝练可望取得重大原始创新的研究方向,进一步提升我国主要学科的国际地位,提高科学技术满足国家重大需求的能力。各科学部遴选优先发展领域及其主要研究方向的原则是:  (1)在重大前沿领域突出学科交叉,注重多学科协同攻关,

Roche 454(GS FLX Titanium System)超高通量测序技术原理

Roche 454(GS FLX Titanium System)超高通量测序技术原理2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System,被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序的先河。2007

梳理维生素B功能研究最新进展

  维生素B(Vitamin B)旧称维他命B,是B族维生素的总称,它们常常来自于相同的食物来源,如酵母等。属于水溶性维生素。  维生素B主要有维生素B1(硫胺素、抗脚气病维生素)、维生素B2(核黄素)、维生素PP(尼克酸或烟酸、抗癞皮病维生素)、维生素B6(吡哆醇、抗皮炎维生素),泛酸(遍多酸)、

科学仪器学科与技术进展的研究报告

  (八)电化学分析仪器   国际上以美国CH Instrument公司生产的CHI系列、美国Bio Analytical System公司生产的BAS系列、美国Princeton Applied Research生产的EG&G系列、荷兰Ecochemie的AutoLab系列,是电化学

南海海洋所环酯肽类抗生素的生物合成研究取得进展

  环酯肽类抗生素是一类结构复杂、生物活性活性显著的抗生素,是创新药物的重要源泉。黑莫他丁(himastatin)是由链霉菌产生的,组成其分子的六个结构单元以DL交替方式排列并且形成结构对称的二聚体。自其发现以来,以其新颖、复杂的结构特征和良好的抗菌、抗肿瘤活性引起了有机合成、药物化

南海海洋所环酯肽类抗生素生物合成研究取得重要进展

  环酯肽类抗生素是一类结构复杂、生物活性活性显著的抗生素,是创新药物的重要源泉。黑莫他丁(himastatin)是由链霉菌产生的,组成其分子的六个结构单元以DL交替方式排列并且形成结构对称的二聚体,自其发现以来,以其新颖、复杂的结构特征和良好的抗菌、抗肿瘤活性引起了有机合成、药物化学和药理学等领域

分子生物学常用实验技术(page 2)

一、RNA 制备   模板mRNA 的质量直接影响到cDNA 合成的效率。由于mRNA 分子的结构特点,容易受RNA 酶的攻击反应而降解,加上RNA 酶极为稳定且广泛存在,因而在提取过程中要严格防止RNA 酶的污染,并设法抑制其活性,这是本实验成败的关键。所有的组织中均存在RNA 酶,人

941项/人,教育部公布2019年度科技奖候选项目/候选人

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“合成生物学”重点专项年度共30个项目安排公示

关于国家重点研发计划“合成生物学”重点专项2019年度项目安排公示的通知  根据《国务院关于改进加强中央财政科研项目和资金管理的若干意见》(国发〔2014〕11号)、《国务院关于深化中央财政科技计划(专项、基金等)管理改革方案的通知》(国发〔2014〕64号)、《国家重点研发计划管理暂行办法》(国科

Nature 表观遗传学进展将遗传学、环境与疾病联系了起来!

  21世纪,表观遗传学的研究得到了快速发展,同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西,当然了,这其中也存在一些大肆宣传的成分,本文中,我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的,同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展;我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用,以及表观

2015国家自然科学基金:表观遗传学什么是重点

  来自国家自然科学基金委员会的消息,8月18日国家自然科学基金委员会公布了2015年国家自然科学基金申请项目评审结果,其中面上项目16709项、重点项目624项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16155项、地区科学基金项目2829项、海外及港澳学者合作研究基

教育部揭晓2014年度高校十大科技进展 鼓励创新科技

  由教育部科学技术委员会组织评选的2014年度“中国高等学校十大科技进展”,日前在京揭晓。经过形式审查、学部初评、主任办公(扩大)会终评和项目公示,北京大学主持的单个纳米颗粒光学检测新原理研究等10个高校科技项目,获评本年度高校科技十大进展。  据介绍,“中国高等学校十大科技进展”评选自1998年

质谱在生物医学领域的应用

1 新生儿疾病筛查质谱技术在该领域的发展已十分成熟。利用LC-MS 技术可同时筛查十几种新生儿疾病。质谱技术能做到筛查效率高、结果可靠,费用相对低廉,这是常用分析方法如细菌抑制法、放射免疫分析法、酶联免疫吸附试验、时间分辨荧光免疫分析法、荧光酶免疫分析法等不可企及的。以我国每年2