SNP位点的选择原则

1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及上下游邻近序列的SNP位点。2,至于挑选的原则,可以介绍一下Hap Map的正规化标准:SNP Selection CriteriaCategory 1 "verified"This contains all SNPs for which we have allele frequency or genotyping data. This includes SNPs from the TSC allele frequency project, as well as SNPs characterized by J......阅读全文

SNP位点的选择原则

1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及上

亚甲基四氢叶酸还原酶相关SNP位点

  (1)MTHFR C677T rs1801133;  (2)MTHFR A1298C rs1801131;  (3)MTRR A66G rs1801394;  研究认为,以上位点多态性与多种疾病相关:  (1)妇幼保健类:神经管缺陷、先天性心脏病、唇腭裂、妊娠期高血压疾病,自发性流产;  (2)

识别位点

中文名称识别位点英文名称recognition site定  义限制性内切酶特异结合的核苷酸序列。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

剪接位点

中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定  义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

进入位点

中文名称进入位点英文名称entry site定  义特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

加帽位点

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

nut-位点的定义

中文名称nut 位点英文名称nut site定  义噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

什么是活性位点

者一般用在大分子化学中,活性位点指的是可以发生化学反应的集团。活性位点少,发生有效碰撞的机率就少,也就是说反应比较单一,容易被控制

磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定

磷酸肽的化学测序 磷酸肽的质谱分析 源后衰变 用酶和化学方法去磷酸化             实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一

磷酸化位点分析实验磷酸化位点的确定

实验方法原理 磷酸化位点的确定也使用一些通用方法;磷酸化蛋白质被纯化,如果可能蛋白质要均一;磷蛋白被特异性的化学或酶反应切断、产生肽混合物,其中含有一到两个磷酸肽不同之处在干其分离磷酸肽的策略是为了确定氨基酸序列,定位肽段内磷酸化的残基。上面所述的分离方法, 2D-PP 作图、 HPLC 或 l

阴离子位点显示实验

实验方法原理 实验材料 组织样品试剂、试剂盒 磷酸缓冲液阳离子化铁蛋白液体戊二醛锇酸实验步骤 1. 0.1 mol/L磷酸缓冲液配制阳离子化铁蛋白,浓度为0.2~0.5 mg/ml。2. 组织样品悬浮于阳离子化铁蛋白液体中,室温下反应30 min。3. 0.1 mol/L磷酸缓冲液充分漂洗。4. 3

无碱基位点的定义

中文名称无碱基位点英文名称abasic site定  义核酸中失去碱基的部位。该部位碱基失去后,产生一个醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

序列标签位点的定义

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

加帽位点的概念

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

什么是序列标签位点?

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

无嘧啶位点的概念

中文名称无嘧啶位点英文名称apyrimidinic site定  义核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

无嘌呤位点的定义

中文名称无嘌呤位点英文名称apurinic site定  义核酸中脱去嘌呤碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

序列标签位点的简介

任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。这种序列在染色体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,STS适宜于作为人类基因组的一种

核糖体结合位点

核糖体结合位点(ribosomebinding site,简称RBS),是指mRNA的起始AUG上游约8~13核苷酸处,存在一段由4~9个核苷酸组成的共有序列-AGGAGG-,可被16SrRNA通过碱基互补精确识别的序列。

细胞化学词汇nut-位点

中文名称:nut 位点英文名称:nut site定  义:噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

降水监测降水采样点监测点位环境要求

①采样点应位于开阔、平坦的地区,测点周围的下垫面无裸露上壤,以免风沙扬尘的影响。②采样点应避开局地污染排放源,包括排放酸碱物质的烟尘、粉尘和生活排放源、废物堆积场、停车场以及交通T线等。③采样点周应无遮挡雨、雪的障碍物,其中包括房屋、桥梁、高大树木等。障碍物与采样器之间的水平距离不得小于该障碍物高度

SNP检测技术(测序、taqman探针和snp芯片)

snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼

SNP命名规则

一般写法是这样: dbSNP后面跟featureID. featureID一般是rs/ss后跟7-8位数字, 比如:rs12345678或者dbSNP|rs12345678以下是老鼠(Mus muculas)的1号染色体上SNP列表格式(部分):---------------------------

什么是位点专一诱变?

中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定  义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

位点专一诱变的定义

中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定  义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

位点专一诱变的定义

中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定  义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

土壤现状监测点位如何选择

  根据土壤导则要求污染影响型建设项目,二级要求监测柱状样和表层样,三级要求监测表层样。如果建设项目场地已经硬底化,该如何如何选取监测点?是需要把已经硬底化的场地破坏还是另外选取监测点?    根据建设项目实际情况,如果项目场地已经做了防腐防渗(包括硬化)处理无法取样,可不取样监测,但需要详细说明

大脑RNA编辑位点“辞典”发布

美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如

无嘌呤嘧啶位点的概念

所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。

基因插入位点和模式实验

实验材料dCTP试剂、试剂盒乙醇次氯酸钠β-葡萄糖醛酸酶基因活性测定液溴化乙锭仪器、耗材培养室MS 培养基实验步骤一、转基因插入位点的数目第一代( T0)转基因植株外源基因的插入位点数目,一般都是通过遗传方法进行鉴定。虽然遗传分析可以在任何世代进行,但是一般选择转基因植株自交,或与野生型测交后得到的