自然通讯:lncRNAHULC结合代谢酶促进肝癌细胞有氧糖酵解

Nat Comm :陈瑞冰/张宁团队合作发现lncRNA HULC结合代谢酶促进肝癌细胞有氧糖酵解 长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA,它们不翻译成蛋白质而是以RNA的形式在众多生理过程中发挥重要功能。研究真核细胞中lncRNA的功能可能发掘调控生理过程的新规律和新机制,将从不同于蛋白质编码基因的角度注释和阐明基因组的结构与功能。lncRNA与蛋白质相互作用是其发挥功能的重要分子基础,研究lncRNA与蛋白质相互作用是探索其未知功能和机制的重要途径,对了解lncRNA未知的生理功能和相关分子机制至关重要。进日, Nature Communications杂志在线发表了天津大学 陈瑞冰教授与北京大学医学部 张宁教授合作团队题为: Interactome Analysis Reveals that LncR......阅读全文

自然通讯:lncRNA-HULC结合代谢酶促进肝癌细胞有氧糖酵解

Nat Comm :陈瑞冰/张宁团队合作发现lncRNA HULC结合代谢酶促进肝癌细胞有氧糖酵解 长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是一类长度大于200 nt的非编码RNA,它们不翻译成蛋白质而是以RNA的形式在众多生理过程中发挥重要功能。研究真核细胞中lnc

质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)   作者:Nathan Blow   分析测试百科  译     近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。     在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

  靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。   岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。  岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan speed≤3

Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行

  【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节,第一个是样品的处理阶段,这是最简单,也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分,使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分,这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的

2022天津质谱交流会-质谱大咖汇聚-推进质谱发展

——2022年第六届天津市质谱学术技术交流会2022年8月13日至14日,由天津市色谱研究会主办,布鲁克(北京)科技有限公司独家赞助的《2022年第六届天津市质谱学术技术交流会》在天津市蓟州区召开。分析测试百科网作为大会支持媒体为您带来大会的报导。本次学术技术交流会秉承以往各届会议的精神,邀请南开大

2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会第二日顺利召开

2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会——仪器研发新技术与生物质谱专场  分析测试百科网讯 2016年11月2日上午,2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会——仪器研发新技术专场共有五位专家学者为大家带来精彩的报告。Excellims公司创始人和CEO 吴青博士  Excellims公司创始

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)

无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)

摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋

蛋白质组质谱新方法一览

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)

然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(二)

同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,

高分辨质谱Orbitrap直击靶标代谢组学新热点

在生命科学奇妙世界里,基因、核酸、蛋白和小分子代谢产物构成了细胞生命活动的基本要素,以这些物质为基础的诸多组学技术的发展,推动着生命科学研究不断向前。 基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命科学研究中研究的范式⁽¹⁾,研究成果可谓精妙纷呈、大放异彩。 图1:基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命

安捷伦与贝勒医学院建立代谢组学质谱中心

  近日,安捷伦和贝勒医学院表示,他们已在BCM's Alkek Center for Molecular Discovery开启安捷伦卓越质谱中心。  安捷伦将为中心提供两个质谱代谢工作系统:6495 三重四极杆 LC/MS和6550 iFunnel QTOF LC / MS系统,具有可切换的GC

2015年第三届天津质谱学会——聚焦质谱-引领未来

  分析测试百科网讯2015年9月11日, 2015年第三届天津市质谱学术报告会在风景秀丽的北京怀柔召开,此次会议由天津色谱研究会和天津市分析测试协会共同主办,由赛默飞世尔科技(中国)有限公司和绿绵科技有限公司协办。此次会议吸引了来自科研院所,政府机

《自然》子刊专题:蛋白质组学中的质谱

涉及到蛋白质组学分析的研究人员都知道蛋白质组学研究的技术路线有两条,一条是以双向电泳加生物质谱的方法鉴定生物体系中各种蛋白的表达谱以及各蛋白表达程度的相对变化,另一条路线就是多维色谱与生物质谱相结合的称之为鸟枪法的技术路线。其中质谱分析技术(Mass spectrometry,MS)是蛋白质组学常用

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展

  近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。   原发性肝癌是全球最

蛋白基因组学研究揭示肝癌发生和发展机制

  慢性乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是导致我国肝癌发生的最主要原因,约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程,受到机体的系统性调控,基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响,目前这方面的研究报道较少,亟待深入探究。同时,新药研

蛋白基因组学揭示肝癌发生发展机制和个性化诊治新策略

  慢性乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是导致我国肝癌发生的最主要原因,约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程,受到机体的系统性调控,基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响,目前这方面的研究报道较少,亟待深入探究。同时,新药研

蛋白质质谱测序

蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。

质谱组学,引领精准

  8月,上海。炎炎夏日,骄阳似火,正值生机盎然的季节,一场造福行业发展的合作协议今日于上海签订。赛默飞世尔科技(中国)有限公司和上海中科新生命生物科技有限公司在多组学及精准医疗领域,建立战略合作伙伴关系。出席本次签订协议的嘉宾有赛默飞世尔科技(中国)有限公司商务运营副总裁冯时瀚先生、上海中科新生命

2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会-大咖抢先看第二弹

  为进一步加强国内外质谱界学术交流,并采用更新颖的互联网形式组织交流活动,将质谱新技术和研究应用拓展和普及到更多的人,共同提高我国质谱研究及应用水平,中国质谱学会将在2016年11月1日-4日,组织“2016 CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会”。会议邀请30位质谱大咖与您在线对话,报告内容涵盖质

蛋白、测序、质谱全方位布局,达瑞生物参展临床质谱论坛

  2023年4月14-15日,“第四届北京临床质谱会”成功举办。广州市达瑞生物技术股份有限公司(以下简称“达瑞生物”) 在本次论坛带来了其标志性的串联质谱平台和飞行时间质谱平台产品。分析测试百科网邀请到达瑞生物华北大区销售总监贾广锋,为观众详细介绍产品。  关于达瑞生物:  广州市达瑞生物技术股份

基于质谱的空间蛋白质组学系统研究方法

  蛋白质亚细胞定位及其动态变化过程对于蛋白质功能至关重要。随着鸟枪法蛋白质组学的发展,通过亚细胞分离及质谱技术同时测定数千个蛋白质稳态定位的“蛋白质组学显微镜(proteomic microscope)”出现了。然而,表征因扰动导致的亚细胞定位变化的工具却一直局限在光学显微镜,每次仅能成像一个或几

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍

  2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人

AB-SCIEX三大质谱平台支撑蛋白质组学研究

  2010年10月18~19日,由国家自然科学基金委、中国化学会分析化学委员会主办,复旦大学、上海交通大学承办的2010年微纳尺度分离和分析技术学术会议暨第六届全国微全分析学术会议在上海复旦大学复宣大酒店隆重召开。来自全国高等院校、科研机构、企事业单位的300余名专家学者出席了本次会议。

多维液相色谱质谱技术用于代谢组深度覆盖研究获进展

  近日,中国科学院大连化学物理研究所高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)在利用多维液相色谱-质谱技术用于代谢组深度覆盖研究中取得新进展,相关研究结果被Analytical Chemistry杂志收录。  酰基辅酶A是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥作用。由于其性质差异较大,很难用一种

质谱综述:上交大吕海涛首次定义精准修饰代谢组学新法

近日,上海交通大学吕海涛研究员再次受邀在组学与质谱学领域著名杂志《Mass Spectrometry Reviews》(中科院分区1区TOP级杂志,影响因子9.526)发表评论文章“Mass spectrometry and associated technologies delineate the

大连化物所在多维液相色谱质谱技术用于代谢组深度覆盖

  近日,中国科学院大连化学物理研究所高分辨分离分析及代谢组学研究组(1808组)在利用多维液相色谱-质谱技术用于代谢组深度覆盖研究中取得新进展,相关研究结果被Analytical Chemistry杂志收录。   酰基辅酶A是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥作用。由于其性质差异较大,很难用