大规模蛋白质相互作用研究方法进展（一）
来源：生命科学 关 薇, 王 建, 贺福初*（军事医学科学院放射与辐射医学研究所，北京 100850） 摘 要：随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘，蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果蝇、线虫以及人类蛋白的大规模相互作用图谱的相继完成，不仅对系统研究细胞内各种生命活动有着重要意义，也标志着蛋白质相互作用研究方法的不断发展和完善。本文综述了当前大规模研究蛋白质相互作用的技术方法并进行了比较分析。每种技术都有其各自的优缺点，在实验中要根据不同的要求和目的选择适宜的方法。 关键词：蛋白质相互作用；酵母双杂交；串联亲和纯化 The advance in research methods for large-scale protein-protein interactions GUAN W......阅读全文
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（一）
来源：生命科学 关 薇, 王 建, 贺福初*（军事医学科学院放射与辐射医学研究所，北京 100850） 摘 要：随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘，蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果蝇、线虫以及人类蛋白的大规模相
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（二）
这一经典的蛋白相互作用研究方法接近于体内环境，那些瞬时、不稳定的两两相互作用也可以被检测到，并且与内源蛋白的表达无关[6]。鉴于这些优点并结合简便高效的Gateway表达载体构建方法[7]，在大规模的蛋白质－蛋白质相互作用研究中酵母双杂交系统得到了最为广泛的应用。Rain 等[8]用该法绘制了人类胃
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（三）
图1 TAP亲和层析纯化原理[14] 注：A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白，TEV 酶切分离ProteinA 和靶蛋白；B:利用CBP(Calmodulin binding peptide)-Calmodulin 的相互
大规模蛋白质相互作用研究方法进展（四）
表1 蛋白质相互作用分析相关数据库及网站 网站 资源类型 网址 DIP 蛋白质相互作用http: //dip.doe-mbi.uda.edu INTERACT 蛋白质相互作用http: //bioinf.man.ac.uk/interactpr.htm ProNet 蛋白质相互作用ht
蛋白质相互作用组研究获进展
蛋白质相互作用组是指蛋白质之间的基本相互作用，对于大多数物种而言，其在很大程度上都是未知的。因而，研究探索膜蛋白潜在的相互作用组必然是一项极具挑战性的工作。 美国斯坦福大学卡耐基科学研究所Jones等研究人员，使用构建好的分裂泛素化酵母试验系统，从拟南芥中筛选鉴定出超过3000个膜蛋白之间的相
质谱研究蛋白质相互作用（一）
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽，从而帮助研究人员识别并测序多肽分子，分析它们的特征，了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的，一些关键的生物学过程，如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为，这些蛋白复合
蛋白质间相互作用研究方法1
LY: 宋体; mso-ascii-font-family: 'Times New Roman'; mso-hansi-font-family: 'Times New Roman'">融合蛋白进行Far Western印迹来检测蛋白质-蛋白质相互作用 放射标记蛋白探
蛋白质间相互作用研究方法1
确定各种可能与目标蛋白相互作用的蛋白质，“撒大网”l 双杂交和其他双成分系统第一阶段：诱饵-LexA融合蛋白的鉴定诱饵-LexA融合蛋白的构建1．将编码诱饵蛋白的靶DNA克隆到LexA融合载体的多聚接头处，以合成一种框架内的LexA融合基因。确定诱饵序列的羧基端存在翻译终止序列。形成的
蛋白质间相互作用研究方法3：BIAcore
快速分析过去已确定的相互作用l 利用BIAcore通过表面胞质基因共振光谱学分析相互作用的蛋白质RAMc通过伯氨基与CM-5传感芯片表面的结合1．将CM-5传感芯片模块嵌入BIAcore仪器。2．全部采用过滤并除气的HEPES缓冲盐溶液。3．将分别含有NHS、EDC、乙醇胺和RAM Fc以
蛋白质组技术的研究进展（一）
大规模基因组测序计划的实施已改变生命科学的重心，在相当短的时期内，一些原核生物和某些低等真核生物的基因组序列已被测定. 1995年，流感嗜血杆菌基因组序列首次被破译，在此后不到两年的时间，近50个细菌的基因组序列已被完成. 然而，这仅仅是理解有机物功能的一个起点. 在基因组时代，许多DNA序列信
蛋白质间相互作用研究方法：免疫共沉淀
相互作用在生理上的证实和探索l 通过免疫共沉淀确定结合蛋白1．用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。2．将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中，在微量离心机上4℃以最大速度离心15 min。3．收集上清（约30 ml）并加入3
研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法
一、引言 在许多的细胞生命活动中，例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。 重组DNA技术的发展，人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要： a、鉴定分析
研究蛋白质之间相互作用的实验方法
白质与蛋白质之间相互作用构成了细胞生化反应网络的一个主要组成部分，蛋白-蛋白互作网络与转录调控网络对调控细胞及其信号有重要意义。把原来spaces空间上的一篇蛋白质与蛋白质间相互作用研究方法转来，算是实验技巧分类目录的首篇。一、酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重
研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法
一、引言在许多的细胞生命活动中，例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展，人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要：a、鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件
青岛能源所等在蛋白质相互作用研究中取得进展
日前，中国科学院青岛生物能源与过程研究所代谢物组学团队研究员冯银刚和中科院生物物理研究所研究员柯莎（Sarah Perrett）研究组在翻译控制肿瘤蛋白（TCTP）参与蛋白质相互作用研究中取得新进展，揭示了TCTP与翻译延伸因子的相互作用可能代表了TCTP的一个基本生物学功能，相关成果于1月2
青岛能源所在蛋白质五级相互作用研究中取得进展
蛋白质的结构层次通常被分为一到四级。但是在细胞拥挤环境下，胞内其它大分子和目标蛋白质形成瞬态复合物，也被称为蛋白质“五级结构”，而导致五级结构形成的作用力被称为五级作用力（quinary interaction）。但是关于该作用力的研究难度大，相关报道很少。中国科学院青岛生物能源与过程研究所仿真
蛋白质间相互作用研究方法2：免疫共沉淀
相互作用在生理上的证实和探索l 通过免疫共沉淀确定结合蛋白1．用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。2．将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中，在微量离心机上4℃以最大速度离心15 min。3．收集上清（约30 ml）并加入3
DNA与蛋白质相互作用的研究方法有哪些
在许多的细胞生命活动中，例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展，人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要：a、鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件；b、分
DNA与蛋白质相互作用的研究方法有哪些
研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法一、引言在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题.重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因.现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性.为此需要：a、
DNA与蛋白质相互作用的研究方法有哪些
研究蛋白质与DNA相互作用的主要方法一、引言在许多的细胞生命活动中，例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。重组DNA技术的发展，人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性。为此需要：a、
蛋白质药品冷冻干燥技术研究进展（一）
蛋白质药品冷冻干燥技术研究进展 1.引言 由于冻干药品呈多孔状、能长时间稳定贮存、并易重新复水而恢复活性，因此冷冻干燥技术广泛应用于制备固体蛋白质药物、口服速溶药物及药物包埋剂脂质体等药品。从国家药品监督管理局数据库得知，目前国内已有注射用重组人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子、注射用重组人干扰素α2
浅谈食品中蛋白质测定方法的研究进展
蛋白质是构成生物体细胞组织的重要成分。食物中的蛋白质是人体中氮的惟一来源, 具有糖类和脂肪不可替代的作用。蛋白质与营养代谢、细胞结构、酶、激素、病毒、免疫、物质运转和遗传等密切相关, 其分离与定性、定量分析是生物化学和其他生物学科、食品检验、临床检验、诊断疾病、生物药物分离提纯和质量检验中最重要的工
研究蛋白质相互作用的新技术
近期，来自多伦多大学Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (LTRI)和Donnelly中心的一组研究人员，开发出一种新技术，可以将细胞内的DNA条形码拼接在一起，以同时搜寻数百万个蛋白质配对，用以分析蛋白质相互作用。相关研究结果发表在4月22日的《Mol
深圳先进院大规模图查询研究取得新进展
近日，中国科学院深圳先进技术研究院高性能计算研究中心成杰峰博士关于大规模图查询的研究成果Top-k Graph Pattern Matching over Large Graphs，在第29届IEEE ICDE发表。ICDE是计算机领域最顶尖的学术会议之一，过去10年长文平均录用率仅为14%
蛋白质组的研究进展
2014年5月28日，英国新一期《自然》杂志公布两组科研人员分别绘制的人类蛋白质组草图。这一成果有助于了解各个组织中存在何种蛋白质，这些蛋白质与哪些基因表达有关等，从而进一步揭开人体的奥秘。上世纪90年代，人类基因组计划开始成形时，有科学家提出了破译人类蛋白质组的想法。其目标是将人体所有蛋白质归类并
蛋白质组最新研究进展
蛋白质组（Proteome）的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物，蛋白质组中蛋
蛋白质蛋白质相互作用理论预测和药物设计新法获进展
11月29日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）在线发表了中国科学院上海药物研究所蒋华良课题组和美国莱斯大学（Rice University）José N. Onuchic 课题组合作的论文Elucidating the druggable interface of protein-protei
武汉植物园在纳米银与蛋白质相互作用研究中取得进展
纳米银（Silver nanoparticles）是空间三个维度都处于1-100 nm范围内由银原子构成的具有特殊性质的材料，由于具有卓越的抗菌性能，被广泛用于人类生产生活的各个领域。然而，随着纳米银使用的增加，越来越多的纳米银释放到环境中，由此可能会对生物体造成毒害，从而破坏生态系统的结构和
大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展
中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作（Nature Structural & Molecular Biology）基础上，再次与合作者利用结构生物学手段，揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的
研究蛋白质RNA相互作用的新工具
近日，赛默飞世尔科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit，让研究人员能够以末端标记的RNA作为诱饵，轻松富集蛋白质-RNA的相互作用。与抗体捕获相比，这种方法的优势在于脱硫生物素化的目标RNA能够直接富集RBP(或复合物)。 蛋白