干货丨新冠病毒Nanopore测序标准操作流程

2019新型冠状病毒Nanopore测序标准操作流程-PCR扩增测序版简介 新近在武汉出现的新型冠状病毒引发的肺炎疫情引起了社会各界的极大关注。对新型冠状病毒进行测序不仅能够为病原鉴定、病毒溯源与变异、传播力和传播机理等研究提供切实可靠的基因组信息,还能够为识别病毒传播方式和确定暴发范围提供重要的线索,为及时完善防控策略和措施奠定完善的理论基础。 MinION测序仪由于其长读长、可移植性强、可实时访问测序数据且具有非常低的初始成本,因此在许多临床情况下越来越多地用于对各种病毒病原体进行测序。尤其在新冠肺炎诊疗方案(试行第五版)中,病例确诊采用“逆转录酶聚合酶链反应 (RT-PCR)”核酸检测与基因测序两种方式,可见在新冠肺炎核酸与抗体检测等方法还不完善时,临床急需MinION这样的小规格设备对新型冠状病毒进行实验室或现场快速检测。虽然Oxford Nanopore 的技术专家们正在积极与纳米孔社区的科学家通力合作,支持开发对......阅读全文

干货丨新冠病毒Nanopore测序标准操作流程

2019新型冠状病毒Nanopore测序标准操作流程-PCR扩增测序版简介  新近在武汉出现的新型冠状病毒引发的肺炎疫情引起了社会各界的极大关注。对新型冠状病毒进行测序不仅能够为病原鉴定、病毒溯源与变异、传播力和传播机理等研究提供切实可靠的基因组信息,还能够为识别病毒传播方式和确定暴发范围提供重要的

新冠病毒变化多端,基因测序怎么跟节奏

  在受到大规模全球紧急情况的挑战时,如何科学有效应对是全球面临的共同现实。新冠肺炎大流行为科学开启了巨大的机遇,并让科学在这之中充分发挥了作用。其中,以闪电般的速度开发疫苗就是核心技术能力的体现,基因组测序亦然。 1月11日,世界卫生组织举行新冠肺炎例行发布会,总干事谭德塞表示,病毒传播得越广

新冠病毒疫苗有了国家技术标准

我国新冠病毒疫苗的临床研发有了可参考的国家级技术标准。记者8月15日获悉,国家药监局药品审评中心发布了《新型冠状病毒预防用疫苗研发技术指导原则(试行)》等指导原则,并自发布之日起施行。国家药监局网站截图据了解,自2020年1月31日,新型冠状病毒感染所致的疾病被世界卫生组织列为“国际关注的突发公共卫

-Oxford-Nanopore:纳米孔测序仪开放试用

  在上个月的美国人类遗传学协会年会上,英国Oxford Nanopore Technologies公司宣布将启动MinION测序仪的试用计划。这次,它果然没有食言。MinION试用计划于11月25日启动,将延续到2014年初,具体截止日期未定。   根据这项试用计划,参与者须支付1,000美

新冠病毒胶体金试剂:快速检测新冠病毒

   23日下午,中国工程院院士钟南山在广州医科大学附属第一医院首次与广东对口支援湖北荆州医疗队进行远程会诊。会上,他带来了一个“好消息”:国家批准了两个抗体试剂盒。  “这两种试剂盒都是采用胶体金法,能够测出患者体内的lgM抗体,在患者感染的第7天或发病的第3天就能够检测出lgM抗体,对患者进一步

SMRT测序和Nanopore测序有哪些相同点和差异

第一代DNA测序技术(又称Sanger测序)在1975年,由Sanger等人开创,并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174),全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用了不同策略的作图法、鸟枪法),2001年完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的San

武大联合团队开发纳米孔靶向测序-快速“捕获”新冠病毒

   武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法(NTS),能大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。  3月7日,该团队在预印版平台medRxiv发表题为《纳米孔靶向测序精准全面检测新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究论文。  既往

新冠病毒RNA直接测序-这次科学家得到了什么?

  澳大利亚墨尔本大学微生物和免疫学系的Lachlan Coin和Sebastian Duchene团队及合作者,提供了新冠病毒的第一个直接RNA序列,详细介绍了该冠状病毒亚基因组长度的mRNA结构,并描述了从共享数据中揭示的冠状病毒进化遗传学的各个方面。相关论文3月7日发布于预印本服务器bioRx

新冠病毒近日播报

   8月22日0—24时,31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例12例,均为境外输入病例(河北5例,天津2例,广东2例,陕西2例,福建1例);无新增死亡病例;新增疑似病例2例,均为境外输入病例(均在福建)。  当日新增治愈出院病例44例,解除医学观察的密切接触者1478人,重

新冠病毒已突变

  新冠病毒是否已经发生突变?如何突变?这是目前学界研究的焦点之一。中国科研团队最新发现显示:新冠病毒已于近期产生了149个突变点,并演化出了两个亚型,分别是L亚型和S亚型。研究发现,在地域分布及人群中的比例,这两个亚型表现出了很大测差异。其中S型是相对更古老的版本,而L亚型更具侵略性传染力更强。对

新冠病毒检测方法

  新冠肺炎仍在持续,如何更快、更准确诊断,已成为社会各界关注的热点。  核酸检测、抗体检测、抗原检测……不同检测方式有何特点、效果如何?  为此,《中国科学报》采访了中国工程院院士、河南农业大学校长张改平。  他表示,不同的检测方法各有优缺点,不能单说某种技术优劣,而是要将其放在一定的条件下去评价

新冠病毒研究用水系列:测序仪用水对结果的影响

基因测序技术是一种基因检测技术,也被称为DNA测序技术,是进行分子生物学研究和基因改造的基础,也是解锁人类生命奥秘的重要方式之一。基因测序技术发展了40余年,已在众多领域被广泛应用,包括生物的基因组图谱绘制、物种进化演替过程、表观遗传学、疾病相关基因的确定和诊断等等。近年来,基因测序相关产品和技术由

新冠病毒基因组测序的方法有哪几种?

新冠病毒基因组测序的方法有宏基因组测序和靶向测序。

新冠病毒重男轻女?数据揭秘新冠易感人群

  新冠疫情暴发已有大半年的时间,全球疫情新增确诊整体仍然呈上升趋势。截至7月17日19时,全球累计确诊逾1380万,累计死亡人数超59万。  在海外疫情形势严峻的背景下,北京和香港疫情反弹、哈萨克斯坦出现不明肺炎,这些都让大家对新冠疫情蒙上一层阴影,有关疫情的二次爆发以及新冠病毒变异的猜测不断蔓延

辉瑞BioNTech新冠疫苗可中和新冠变异病毒

  《自然》发表的一篇论文报道,接种辉瑞 -BioNTech 新冠疫苗的血清中和了新的新冠变异病毒。接种两剂疫苗的人的血清中和了B.1.617.2(又称delta)变异株(首次于印度发现)和一些其他变异株,包括B.1.525(首次发现于尼日利亚)。  随着新冠病毒新变异株的出现,亟需评估现有疫苗产生

新冠治疗新希望?2天新冠病毒减少5000倍!

  随着近期印度疫情再次加剧,当地大面积应用伊维菌素的消息引发关注,还有研究显示,伊维菌素能在 48 小时内将新冠病毒 RNA 减少 5000 倍。  一个不少人关心的问题:伊维菌素要成为新冠治疗的新希望吗?  伊维菌素能治新冠吗?  伊维菌素(Ivermectin)是上世纪七十年代发现的一种抗生素

面对新冠病毒肺炎,DIN将提供医疗设备相关标准

欧洲标准化委员会(CEN)和欧洲电工技术标准化委员会(CENELEC)成员为抗击新冠肺炎危机提供支持经过与其全部成员 – 其中包括DIN – 及与欧盟委员会的协商一致,CEN和CENELEC决定,将免费提供许多关于医疗产品和个人防护用品欧洲标准,以此来支持抗击新冠肺炎的斗争。此次免费提供这些标准旨在

新冠病毒“自然起源”说新佐证?

  据法国《世界报》报道,法国巴斯德研究所报告称,在老挝北部发现迄今为止和新冠病毒最为接近的蝙蝠冠状病毒,与新冠病毒具有共同关键特征,可能与新冠病毒存在进化关系。这项研究为新冠病毒溯源提供了线索,也让科学家们更接近于确定新冠病毒的起源。相关研究于9月18日发表在《自然》杂志的预印本平台“研究广场”。

新冠病毒溯源深陷迷雾

  2月27日,国家卫健委高级别专家组组长钟南山在新闻通气会上表示,疫情首先出现在中国,不一定是发源在中国。  同时,最新研究表明,继蛇、穿山甲、水貂之后,龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主。  有关新冠病毒溯源的新进展源源不断。然而,它从哪里来?如何到达人类?又为什么是武汉?这些问题迄今没有答案,

新冠病毒详细科普指南

还有几天就是春节了,亲朋好友的扎心三连问又如约而至:脱单了吗?生几个?年终奖多少……想要年过得愉快舒心,就得先发制人。那就是发挥生物医药科研人的优势,给七大姑八大姨科普目前备受关注的新冠病毒,拿出来的瞬间就能让人惊艳闭嘴、妈见夸。话不多说,小赛已经为大家准备好了,从初一到初七,从七大姑八大姨到熊孩子

美国新冠病毒复制特性

  3月3日,美国疾控中心等机构的研究人员在bioRxiv上发表论文,描述了从第一个美国新冠肺炎患者体内分离出的病毒,并描述了其基因组序列和复制特性。(bioRxiv论文未经同行评议。)  研究人员表示,此次疫情传播速度之快前所未有,迫切需要为进一步研究新冠病毒提供参考试剂。公共卫生界也需要病毒裂解

新抗新冠病毒药物潜在作用靶点—新冠病毒包膜蛋白

  新冠病毒已经感染超过1.5亿人次,并导致300多万人死亡,然而迄今尚无用于新冠肺炎的特效药物。新靶点的发现和确证对于抗新冠病毒药物研发具有重要意义。  2021年6月10日,中科院上海药物所高召兵、李佳、沈敬山,以及武汉病毒所张磊砢、昆明动物所郑永唐联合研究团队在Cell Research 发表

污水新冠检测标准出台

现发布推荐性卫生行业标准《污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法标准》,编号和名称如下:WST799—2022  污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法标准该标准自发布之日起施行。特此通告。                   国家卫生健康委2022年3月24日

我国牵头的首个新冠病毒核酸检测国际标准发布

记者从市场监管总局获悉,国际标准化组织(ISO)4月19日发布《体外诊断检验系统—核酸扩增法检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒 2(SARS-CoV-2)的要求及建议》(ISO/TS 5798:2022)国际标准。该标准由市场监管总局(标准委)组织华大基因、中国标准化研究院等单位提出并联合全球专家共

中国牵头的首个新冠病毒核酸检测-国际标准发布

  国际标准化组织(ISO)近日发布《体外诊断检验系统—核酸扩增法检测严重急性呼吸系统综合征冠状病毒 2(SARS-CoV-2)的要求及建议》(ISO/TS 5798:2022)国际标准。该标准由市场监管总局(标准委)组织华大基因、中国标准化研究院等单位提出并联合全球专家共同研制,是ISO发布的首个

新测序技术揭开病毒突变“王国”

  最近,新加坡A*STAR的研究人员,设计出一种测序技术,可在患者体内病毒(如乙型肝炎病毒)迅速变异时,跟踪所产生的特异病毒变体。这一突破对“进化中的病毒种群的结构”提供了前所未有的视图,并能有助于开发新药,防止病毒株对药物和免疫反应发展出抵抗力。相关研究结果发表在最近的《Genome Biolo

新研究揭示新冠病毒如何影响心脏

 新华社悉尼10月5日电(记者郝亚琳)澳大利亚昆士兰大学日前发布消息说,一项新研究揭示了新冠病毒如何对心脏产生影响,以及其与流感病毒对心脏影响的差异,这为治疗新冠病毒感染所引起的心脏损伤提供了思路。  这项由昆士兰大学领衔的研究已发表在《免疫学》月刊上。研究报告作者之一、昆士兰大学的库拉辛哈博士说:

新冠病毒咽拭子阳性等于确诊新冠肺炎吗?

  近些天北京疫情的新闻,让大家刚平复没多久的心情又紧张了起来。而新发地市场成了这次疫情的『中心』。  新冠病毒核酸检测作为找出病毒的有效手段之一,又开始被大家重视了起来。  关于核酸检测,大家肯定有很多疑问,下面小编就简单梳理一下大家比较关心的几个问题。  普通人需要核酸检测吗?  1、5月30日

惊!日本出现变异新冠病毒?

  据日本广播协会电视台统计,截至8日20时(北京时间8日19时),日本当日新增新冠确诊病例1565例,连续两天单日新增病例超过1500例。另据日媒当天报道,该国最新研究发现,6月中旬以来日本出现了变异后的、具有新型基因序列的新冠病毒。  统计数据显示,日本累计确诊47464例,累计死亡1042例。

新冠病毒疾病临床特征研究

  2 月 28 日,由国家卫健委高级别专家组组长、中国工程院院士钟南山领衔,国家卫健委高级别专家组成员、中国工程院院士李兰娟等参与的新冠病毒疾病临床特征研究,在《新英格兰医学杂志》正式发表。  分析发现,过半患者入院时无发热表现;初次就诊时,有2.9%的重症患者和17.9%的非重症患者未发现影像学