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Science:湿/干循环可能为早期地球RNA的合成提供了条件

在一项新的研究中,来自德国、英国和日本的研究人员提出了一种的新理论来解释RNA如何可能在地球早期产生。相关研究结果发表在2019年10月4日的Science期刊上,论文标题为“Unified prebiotically plausible synthesis of pyrimidine and purine RNA ribonucleotides”。在这篇论文中,他们概述了他们所描述的一系列合理事件,这一系列事件可能导致RNA构成单元(building block)---即下文中的嘌呤核苷和嘧啶核苷---的自然合成。美国佐治亚理工学院的Nicholas Hud和David Fialho针对这项研究在同期Science期刊上发表了一篇标题为“RNA nucleosides built in one prebiotic pot”的评论类型的文章。图片来自CC0 Public Domain。 大多数研究生命起源的科学家们都同意R......阅读全文

基因技术专题-1

专题一:RNA干扰技术(RNAi)1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA。这些

产生RNA干扰RANi 的方法

4 产生RANi 的方法产生RANi 的方法主要有体外合成和体内合成siRNA 法。将siRNA 导入细胞的方法又分为微量注射法、电穿孔法、浸泡法、工程菌喂养法、转基因法和病毒感染法等。Harborth 等[14 ]设计体外合成21nt siRNA 的方法是:在基因库中寻找靶向基因的mRNA 序列,

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(1)

1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA[1]。这些双链RNA是体外

Cell:武汉大学阐明真核基因中的转录调控机制

  近日,来自武汉大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员在新研究中证实,SR蛋白与7SK和启动子相关新生(Nascent )RNA协同作用,促进了转录过程中停顿的聚合酶释放。这一研究发现为阐明真核基因中的转录调控机制,深入了解相关疾病提供了重要的理论依据。相关论文发表在5月9日的《细胞》(Cell

我国科学家开发出一种新型RNA编辑系统

  使用工程核酸酶的基因组编辑技术,比如锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN)和CRISPR系统中的Cas蛋白已被用于操纵许多有机体的基因组。最近,科学家们已将胞苷脱氨酶或腺苷脱氨酶与CRISPR-Cas9融合在一起,构建出可编程的DNA碱基编辑器,从而为校正致病性突变提供新

广州生物院发现抗结核一线药物吡嗪酰胺的新靶标

  根据世界卫生组织的最新统计,全世界每年新发结核病病例从900万增加至1400万,每年死亡140-150万人(2015年死亡180万人)。结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌( Mycobacterium tuberculosis, Mtb)引发的主要通过呼吸传播的致死性传染病

Science新突破:RNA折纸技术诞生

  Aarhus大学和加州理工的科学家们发明了RNA折纸技术(RNA origami),将一条RNA链编织成为多种复杂的结构。这一突破性成果发表在本周的Science杂志上。  与现有DNA折纸技术不同的是,RNA折纸需要RNA聚合酶的参与,大量RNA可以同时折叠成指定形状。另外,RNA折

基因编辑大牛张锋开发出RESCUE技术,可扩大RNA编辑能力

  基于CRISPR的工具彻底改变了我们靶向与疾病相关的基因突变的能力。CRISPR技术包括一系列不断增长的能够操纵基因及其表达的工具,包括利用酶Cas9和Cas12靶向DNA,利用酶Cas13靶向RNA。这一系列工具提供了处理突变的不同策略。鉴于RNA寿命相对较短,靶向RNA中与疾病相关的突变可避

生物谷7月份结构生物学研究进展一览

  1. Cell:中科院生物物理所王艳丽/章新政课题组从结构上揭示Cas13a切割RNA机制  doi:10.1016/j.cell.2017.06.050  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CR

拯救渐冻人,发现ALS真正诱因

  肌萎缩性脊髓侧索硬化症(Amyotrophic lateral sclerosis,ALS),又被称作卢伽雷氏症,也就是最近被大家所关注的渐冻人。该疾病是由于破坏性的神经退行性变和运动神经元缺失所引起,病人肌肉麻痹,一般在发病后2到5年内就会死亡。目前,这种疾病仍然无药可治。  ALS与其他神经

Cell发布CRISPR/Cas9重要研究成果

  来自东京大学、麻省理工学院与哈佛大学Broad研究所的研究人员,在新研究中揭示出了新凶手弗朗西丝菌Cas9(FnCas9)的结构,并利用这一结构信息对FnCas9进行改造构建出了一个变异体。研究成果发布在2月25日的《细胞》(Cell)杂志上。  京东大学医学科学研究所基础医学系Osamu Nu

基因技术专题-2

RNAi技术RNA干扰(RNA interference, RNAi)是近年来发现的研究生物体基因表达、调控与功能的一项崭新技术,它利用了由小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA)引起的生物细胞内同源基因的特异性沉默(silencing)现象,其本质是siRNA与对应

清华施一公院士Science同日发表两篇文章

   7月21日,清华大学的施一公(Yigong Shi)院士课题组再度在剪接体研究中取得重大突破,两篇姊妹研究论文同期发表在《科学》(Science)杂志。  在去年8月20日的Science杂志上,施一公团队也同期发表了两篇姊妹研究论文。在第一篇文章中研究人员报道称,采用单颗粒冷冻电子显微镜获得

清华施一公院士Science同期发表两篇新文章

  清华大学的施一公(Yigong Shi)教授是国际著名的结构生物学家,在细胞凋亡、大分子机器、膜蛋白研究领域占据国际领先地位。曾荣获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是基金会杰出科学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院爱明诺夫奖等多个国内外大奖。  2008年施一公放弃国外的优厚条件选择回

清华施一公院士Science同期发表两篇新文章

  清华大学的施一公(Yigong Shi)教授是国际著名的结构生物学家,在细胞凋亡、大分子机器、膜蛋白研究领域占据国际领先地位。曾荣获国际赛克勒生物物理学奖、香港求是基金会杰出科 学家奖、谈家桢生命科学终身成就奖、瑞典皇家科学院爱明诺夫奖等多个国内外大奖。2008年施一公放弃国外的优厚条件选择回国

RNAi的机理与应用

  RNAi 技术的机理与应用   关于 RNAi 技术   RNA 干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链 RNA( double-stranded RNA,dsRNA) 诱发的、同源 mRNA 高效特异性降解的现象。   RNAi 受到追捧的

Science新研究为探索癌症治疗打开大门

  利用他们开发的技术,德克萨斯大学西南医学中心的研究人员发现了一类蛋白——多聚(ADP核糖)聚合酶(PARP)从前未知的作用:充当了基因活性和RNA加工的调控因子。  这一新发现的功能报告在近期的《科学》(Science)杂志上,“有可能为思考PARP蛋白开辟一些新途径,这可能会促成一些治疗机会,

盘点2014年度十大改变世界的革命性技术

  基因编辑更快更准更简单  1973年,斯坦利•N•科恩(Stanley N. Cohen)和赫伯特•W•博耶(Herbert W. Boyer)找到了改变生物体基因组的方法,成功将蛙的DNA插入到细菌中。20世纪70年代末,博耶的基因泰克(Genetech)公司对大肠杆菌进行基因改造,使其带有一

Science:化学-遗传学检测新方法解开一种关键酶的奥秘

  德州大学西南医学中心的研究人员开发出了一种创新的化学-遗传学检测方法监测了一种十分重要的酶家族的不同成员酶活性,确定了这三种蛋白靶向和改变的蛋白。并且在乳腺癌细胞中证实改变一些基因开启和关闭的方式,有可能改变了细胞的生物学。  这一研究成果公布在Science杂志上,领导这一研究的是德州大学西南

揭秘m6A修饰新功能 -- 调控染色质状态和转录活性

  文章导读   m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院

揭秘m6A修饰新功能 -- 调控染色质状态和转录活性

  m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所

m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性

m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济

Science:更多证据证实RNA是生命起源

  在一项新的研究中,来自德国慕尼黑大学的研究人员证实嘌呤类碱基腺嘌呤和鸟嘌呤如何能够容易地和高产率地合成,从而提供更多证据证实RNA可能是地球上生命的起源。相关研究结果发表在2016年5月13日那期Science期刊上,论文标题为“A high-yielding, strictly regiose

《科学》:端粒可作为RNA合成模板

一直以来,科学家认为,端粒(Telomeres)的唯一作用在于保护DNA免受磨损。瑞士科学家最新研究发现,端粒的作用不仅如此,它还能作为合成RNA的模板。相关论文10月4日在线发表于《科学》上。 每次染色体进行复制的时候,末端的DNA总是会发生丢失。为了防止重要遗传信息的遗失,端粒会“牺牲

免费开源给学术研究,升级版CRISPR拓展RNA功能编辑

  近日,张锋团队再次升级CRISPR基因编辑系统,升级版的CRISPR通过靶向特定的RNA能够将致病蛋白扼杀在萌芽状态。该研究发表于Science。DOI: 10.1126/science.aax7063  基因编辑新品发布  张锋教授像极了基因编辑技术领域的“乔布斯”。张峰团队在基因编辑从无到有

研究解析新冠病毒RNA聚合酶三维精细结构

  由饶子和院士/娄智勇教授/王权教授等组成的“上海科技大学-清华大学抗新冠病毒联合攻关团队”率先在国际上成功解析了新型冠状病毒转录复制机器核心单元“RdRp-nsp7-nsp8”复合体的三维空间结构,整体分辨率达到2.9 埃(Å)。  该研究揭示了该病毒遗传物质转录复制机器核心“引擎”的结构特征,

E.coli基因文库的分类和选择

自 1995 年成立以来,Dharmacon 在生物信息学,RNA 生物学和合成化学方面的专长 , 使我们能够开发出一整套研究基因功能的产品。作为 RNA 定制合成的leader,Dharmacon 公司是 RNA 干扰新发现领域的早期参与者,并且在若干重要的科学发现中,以及确保沉默效率的

【Science特刊】RNA中的信号

  6月17日的Science出了一期关于RNA的特刊。RNA与基因表达的分子生物学紧密相关:有形成特定结构的能力;作为信号载体;对自身的调节。例如非编码小分子RNA,已知是基因表达的调控因子,和哺乳动物干细胞基因表达变化相关,而这种变化反过来和胚胎发育过程中细胞命运的决定有联系。  DNA甲基化是

小RNA领域牛人Science发表重要研究成果

  来自奥地利科学院分子生物技术研究所(IMBA)的研究人员,揭示出了细胞利用来生成一类生殖细胞特异性的小分子调控RNAs——piRNAs的分子机制。他们的研究结果发表在5月15日的《科学》(Science)杂志上。  领导这一研究的是IMBA的分子生物学家Julius Brennecke,这位学者

高光侠组揭示机体抗病毒新机制:抑制病毒蛋白翻译过程

  病毒感染可以引起多种疾病,严重威胁人类健康。但机体也并非坐以待毙,而是进化出多种方式感知病毒的感染并通过激活自身的免疫系统清除体内的病毒。病毒的感染诱导干扰素产生,而干扰素上调多种干扰素刺激基因(ISGs)的表达。根据已有报道,ISGs在HIV-1 病毒复制期的多个步骤以不同机制抑制病毒【1】。