染色体外环状DNA（eccDNA）
1. eccDNA成环的整体统eccDNA测序结果充分体现了基因组水平成环的多样性。eccDNA来源十分丰富，同一个基因有可能会产生非常多的环状，同样一个环状也不仅仅只会包含一个外显子。TTN基因就是一个非常典型的例子。该基因长度达到了0.3Mb，而这样一个基因竟然能衍生得到130个eccDNA，是一个经典的编码基因区域成环的案例。其中比较有代表性的是43-66以及44-52号外显子所组成的环状分子。eccDNA测序的目的正是在组学的层面上全面的描述刻画eccDNA的成环多种可能性。图1 来源于TNN基因的两例eccDNA2.eccDNA长度分布与来源探索eccDNA是环状结构，这样一种分子的长度分布如何？测序结果显示99%的eccDNA长度小于25Kb，其中仅有占比约1%的分子大于25Kb。在这99% 当中，在0.1Kb以及5Kb处有富集峰，这表明该区段的eccDNA占绝大多数。经典的知识体系告诉我们重复序列......阅读全文
染色体外环状DNA（eccDNA）
1. eccDNA成环的整体统eccDNA测序结果充分体现了基因组水平成环的多样性。eccDNA来源十分丰富，同一个基因有可能会产生非常多的环状，同样一个环状也不仅仅只会包含一个外显子。TTN基因就是一个非常典型的例子。该基因长度达到了0.3Mb，而这样一个基因竟然能衍生得到130个eccDNA，是
癌基因的关键——染色体外环状DNA（eccDNA）
实验方法：环状DNA-seq, RNA-seq（云序生物提供以上服务）1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构，作者通过环状DNA-seq（云序生物提供以上服务）方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外，并且
开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA（eccDNA）
近期，Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA（eccDNA），这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央，云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采（点击链接：颠覆性发现：癌基因竟不在染色体上---环状D
开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA（eccDNA）
近期，Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA（eccDNA），这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央，云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采（点击链接：颠覆性发现：癌基因竟不在染色体上---环状D
研究者首次发现孕妇染色体外环状DNA
人血浆中细胞游离的DNA（cfDNA）的片段化模式是引起人们广泛研究的领域。在怀孕期间，观察到胎儿血浆DNA（主要是胎盘来源）是线性DNA片段，比母体来源（主要是造血来源）DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA（eccDNA）。但是，尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。
国自然研究热点——eccDNA的前世今生（一）
1. eccDNA为什么火？它到底是何方神圣？2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学
Nature重磅新星eccDNA的物种发现史（三）
6.染色体外环状DNA来源于植物基因组（拟南芥和短毛菊）的串联重复序列发表期刊：The Plant Journal影响因子：5.786发表时间：2007.12.3 文章链接：Extrachromosomal circular DNA derived from tandemly repeated g
eccDNA新型生物标志物的多种应用
文章导读 新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排
Nature重磅新星eccDNA的物种发现史（一）
文章导读随着高通量测序技术的发展，人类基因组中的神秘面纱被一层层的揭开。eccDNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)作为染色体外的环状DNA的研究也随着国际顶 级学术期刊中《Nature》和《Cell》相继发表的关于eccDNA在肿 瘤的发生和
国自然研究热点—eccDNA的前世今生
2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界，一时之间，将人们的目光都吸引到这个科研界的新宠
揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
eccDNA新型生物标志物的多种应用
新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一
eccDNA新型生物标志物的多种应用
新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一
国自然研究热点—eccDNA的前世今生
1. eccDNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
Nature重磅新星eccDNA的物种发现史（四）
10.酵母菌老化过程中转录诱导的染色体外环状DNA的形成发表期刊：PLOS Biology影响因子：7.076发表时间：2019.10.31文章链接：Transcription-induced formation of extrachromosomal DNA during yeast ageing
再登Nature－GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...2
3.与线性DNA相比，ecDNA扩增导致的ai基因转录水平更高环状ecDNA扩增的转录结果发现，在所有扩增子类别中观察到DNA CN和ai基因表达水平高度明显相关(图3a)。然而，DNA CN归一化后，环状扩增子上的ai基因表达明显高于非环状扩增子。转录活性中不依赖于CN的增加现象可能部分是因为
Nature重磅新星eccDNA的物种发现史（二）
3.非洲爪蟾染色体外环状DNA的形成与端粒DNA相关发表期刊：EMBO reports影响因子：8.383发表时间：2002.10.15文章链接：Formation of extrachromosomal circles from telomeric DNA in Xenopus laevis端粒D
科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能
早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年，来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出，它们是以染色体外DNA（extrachromosomal DNA，ecDNA）的形式存在的，但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。 201
研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构
近日，纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，发现染色体外环状DNA驱动神
染色体外DNA的定义
中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定 义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
染色体外DNA的定义
中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定 义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇染色体外DNA
中文名称：线粒体DNA外文名称：Mitochondrial DNA,mtDNA定 义：线粒体DNA是线粒体中的遗传物质，线粒体能为细胞产生能量（ATP），是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量（ATP）的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。
细胞化学词汇染色体外DNA
中文名称：染色体外DNA英文名称：extrachromosomal DNA定 义：存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
Nature－Genetics揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重..
1. 神经母细胞瘤eccDNA整体统计研究人员联合eccDNA-seq和RNA-seq（云序生物提供此服务）技术，与开创性的生物信息学算法相结合，首次在神经母细胞瘤（一种主要发生在儿童的致命肿瘤）中进行详细的环状DNA序列分析。本研究中分析了93名儿童的神经母细胞瘤组织样本，结果显示，每个组织样本平
染色体外DNA的基本信息
中文名称染色体外DNA英文名称extrachromosomal DNA定 义存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
肿瘤细胞中ecDNA新机制在斯坦福大学致癌基因研究应用2
（5）EcDNA hubs调控两个癌基因位点的分子互作上述研究证明ecDNA hubs可能促进分子间增强子-启动子相互作用。为了验证这些相互作用，作者对人类胃癌细胞系中两种类型的ecDNA进行了研究，一种ecDNA包含来自8号染色体的MYC扩增子，另一种包含来自10号染色体的FGFR2扩增子。用
分子遗传学词汇染色体外DNA
中文名称：染色体外DNA英文名称：extrachromosomal DNA定 义：存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
国自然研究热点——eccDNA的前世今生（二）
(3) 形成特征早期的研究发现eccDNA是基因扩增的产物，是基因组不稳定性的一种表现形式。肿瘤基因扩增往往以两种方式，一种是在染色体上进行基因的扩增，另一种则是形成eccDNA。目前关于肿瘤中eccDNA的形成机制还没有定论。早期的研究认为短重复序列是介导eccDNA形成的因素，主要通过基因重组机
再登Nature－GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现，许多扩增的原ai基因，并不只是位于染色体，而且还能变成游离的染色体外DNA（ecDNA），并出现大量拷贝，而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色体外环状DNA