解锁5分m6A甲基化谱文章新思路

1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63,通过阿霉素DXR诱导,建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1;干细胞相关基因的表达量;皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG63 / DXR具有OSC的特性。图1 MG63 / DXR具有OSC的特性2.OSC中mRNA上m6A甲基化修饰的整体概况作者首先挑选了四个与m6A甲基化相关的主要酶,包括METTL3、METTL14、FTO和ALKBH5,从RNA和蛋白水平检测了它们在MG63 / DXR和MG63中的表达,发现METTL3和ALKBH5在MG63 / DXR中显著性上调。因此推测在OSC和非OSC细胞系之间可能存在m6A甲基化的差异,于是后期通过m6A MeRIP-seq(云序生物提供此项服务)进行进一步检测。图2 m6A甲基化......阅读全文

解锁5分m6A甲基化谱文章新思路

1.构建OSC细胞模型--MG63/DXR作者选择人的OS细胞系--MG63,通过阿霉素DXR诱导,建立了多药耐药性细胞株--MG63 / DXR。并通过分析其特定的细胞表面标志物CD133和CD117 / STRO-1;干细胞相关基因的表达量;皮下注射对裸鼠的致瘤潜力等多个方面数据证明MG

2019年云序RNA甲基化修饰领域文章汇总

  感恩有你,一路同行!2019年末,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!光阴如梭,一年转瞬又将成为历史,新的一年意味着新的起点、新的机遇、新的挑战,决心再接再厉,更上一层楼。回首即将过去的2019,云序生物不断创新,硕果累累;展望2020,任重道远却信心倍

三个月内搞定5分m6A甲基化谱文章

关于m6A修饰的研究在生物领域持续火热,近年国自然立项和文章发表数目保持指数增长趋势,2020年pubmed收录文章已经高达652篇。云序生物在m6A修饰测序领域具有丰富的经验,近期云序客户又连发了5篇m6A甲基化测序研究的文章,下面小编就带大家一起来分析下这几篇发表文章的研究思路,给想短时间内发表

揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排

  在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤

甲基化研究新思路

        组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。为更深入探索表观调控与临床现象间的具体机制,上海华盈生物合作伙伴——华中科技大学同济医院马丁院士

Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排

  在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用

  最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况,发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇,已经追平2019年整年度发表篇数,可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。   图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况( data from PubMe

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据

文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一:非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表

m6A文章盘点(二)

是不是甲基化一定发生在mRNA的3’UTR区域才能有重要作用呢?在这篇Nature Communication文章当中的故事则有所不同。上皮间质转换(epithelial-mesenchymal transition)是癌细胞转移的重要步骤,在这一过程当中发现mRNA的m6A水平会有所升高,

m6A文章盘点(一)

19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(一)

导读最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况,发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇,已经追平2019年整年度发表篇数,可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。 图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况( data from PubMed)那么您

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(二)

为了进一步说明Mettl3在CRC糖酵解过程中促进肿瘤发展的作用,作者通过RNA-seq(云序可提供此服务)分析比较Mettl3 KO和野生型的细胞(WT HCT116 CRC)基因表达情况。通过GO和KEGG分析,WT HCT116主要富集与葡萄糖代谢相关的信号通路,而Mettl3 K

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(三)

(5)酶METTL3作用分子机制研究已表明Mettl3是一种甲基化转移酶,可以调控靶分子的甲基化水平,那么是如何调节糖代谢过程呢?现有实验已表明Mettl3敲除或过表达不仅影响HK2和SLC2A1的甲基化水平,还调节HK2和SLC2A1的表达水平,这暗示着靶分子甲基化水平影响其表达,而双荧光素酶实验

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(四)

1)m6A修饰PCR芯片 new!云序生物提供m6A修饰PCR芯片检测,高效一次性检测m6A相关的Writer,Eraser,Reader的表达情况,m6A PCR 芯片基因列表(34 个基因)-human如图:  2)RNA修饰PCR芯片 new!云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测,高效一次

“RNA-甲基化”研究汇总——拟南芥篇

关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3

总结: 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式,越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用,而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP(云序生物提供此服务)等多种技术联合分析,揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC

云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用1

m6A甲基化是近年来一大热门研究方向,种种研究表明m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在,并对多种生物学功能、疾病肿瘤的发生发展具有极大影响。m6A甲基化位点的检测依赖于MeRIP-seq,其中的抗体免疫共沉淀(IP)环节要求样品RNA起始量相较普通转录组测序要高,曾经令许多难以大量获取的

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

  文章导读   2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。   云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测

2019年,大牛们都在研究什么?—m6A文章盘点

  19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成

小白必看!RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总

  RNA甲基化(RNA methylation)是一类表观遗传修饰,在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenos

2019年,大牛们都在研究什么?—m6A文章盘点

  19年悄悄的已经将近过半,但RNA甲基化研究马不停歇。单单过去一个半月的时间里高分文章就有十多篇,Nature,Cell子刊均有相关文章发表;造血干细胞分化,癌细胞上皮间质转化,树突细胞活化,心肌细胞肥厚,内源性免疫应答调控都有它的身影。这里小编给大家列举展示几篇最新的m6A RNA甲基化研究成

云序超微量MeRIP测序技术在m6A甲基化文章发表的应用2

3) m6A修饰与基因表达联合分析通过m6A-MeRIP-seq和RNA-seq联合分析,文章展示了m6A修饰水平与基因表达水平间的关系,统计发现表达高的基因分组中,受m6A修饰的基因比例也更高。4)甲基化相关酶的表达通过qPCR检测了两组样品中6个甲基化相关酶的表达,发现在高度近视白内障患者中甲基

SMAD2/3与TGFβ影响转录因子发生m6ARNA甲基化调控干细胞发育

  文章导读:   胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚胎干细胞向神经内胚层细胞分化过程中的分子机制目前并没有相关报道。今天,分享一

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN

昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星

  m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!   2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell

RNA甲基化研究深度剖析(一)

一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。 图:RNA甲基化近期高

云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇

  RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN