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首个基于全基因组测序技术的食源性疾病分子溯源网络

食源性疾病是全球范围内重要的食品安全问题,早期发现和查明病因是防控食源性疾病的重要保证。随着新一代基因组测序技术的发展,基于全基因组测序(WGS)的分子分型技术在食源性疾病聚集性病例识别和暴发溯源调查中已显示出极大的应用价值和发展潜力,逐渐成为国际研究热点,欧美相关国家已相继开展研究和布局。在国家重点研发计划“食品安全关键技术研发”重点专项的支持下,国家食品安全风险评估中心与中国农业大学和北京中科助腾科技有限公司合作,以国家食源性疾病分子溯源网络(TraNet)为基础,首次建成了基于WGS分型技术的新型食源性疾病分子溯源网络,是我国首个实现国家、省、市三级实际应用的分子溯源网络。 WGS技术的推广和使用需要解决庞大基因组数据的传输、储存、快速计算和精准比对,需要成熟易用的生物信息学分析流程和标准化解释系统。针对上述问题,研究团队搭建了我国首个全基因组数据计算云引擎,将标准化的WGS数据分析流程转移到云端,大大降低了WGS数......阅读全文

陈君石院士:食源性疾病是中国头号食品安全问题

  日前,浙江大学校友、拼多多创始人黄峥及拼多多创始团队向浙江大学捐赠1亿美金,设立“浙江大学上海高等研究院繁星科学基金”,拟推动浙江大学在生物、医疗、农业、食品等多领域交叉方向展开基础研究及前沿探索。黄峥在此前的致股东信中也表示,辞任后将专注于食品科学和生命科学领域,关注食品安全、消费者健康。  

中美携手合作“十万食源性病原微生物基因组计划”

  5月28日,北京诺赛基因组研究中心(国家人类基因组北方研究中心)、北京师范大学、中国科学院微生物研究所与美国加州大学戴维斯分校在北京师范大学就“十万食源性病原微生物基因组计划”达成合作协议。据悉,中美双方将共同参与十万食源性病原微生物基因组计划的研发,建立重要的食源性致病微生物基因序列综合数据库

首个基于全基因组测序技术食源性疾病分子溯源网络建成

  食源性疾病是全球范围内重要的食品安全问题,早期发现和查明病因是防控食源性疾病的重要保证。随着新一代基因组测序技术的发展,基于全基因组测序(WGS)的分子分型技术在食源性疾病聚集性病例识别和暴发溯源调查中已显示出极大的应用价值和发展潜力,逐渐成为国际研究热点,欧美相关国家已相继开展研究和布局。在国

PacBio助力100K基因组计划最新进展

  今年1月我们报道了Pacific Biosciences公司加入100K基因组计划,该计划将对10万种食源性病原微生物基因组进行测序。最近,该项目研究者宣布,利用PacBio单分子实时(SMRT)测序技术,他们已经完成了20种食源性病原微生物的基因组,并且已经将序列和完整的表观遗传学信息发布

全基因测序法分析STEC

产志贺毒素大肠杆菌(STEC)是引起人类疾病的重要食源性致病菌之一,该分离菌能引起溶血性尿毒综合症(HUS),导致人体肾衰竭。2011年7月,由STEC引发的疫情曾在德国北部造成了至少22人死亡。事件爆发后,科研人员借助于快速全基因组测序方法分析疫情,并开发出一种实时荧光定量PCR检测试剂,精

美国FDA采购Illumina公司1700万美元MiSeq测序仪及试剂用于病原体

  2012年9月18日,来自美国圣地亚哥BUSINESS WIRE的消息 C Illumina公司(纳斯达克代码:ILMN)今天宣布,它赢得了一份来自美国食品药品监督管理局(FDA)的合同,为该机构提供MiSeq测序系统及试剂,以便开展食品安全相关的沙门氏菌和产志贺毒素大肠杆菌的全基因组分析进

FDA斥资17000万购Illumina测序仪检测病原体

美国FDA采购Illumina公司1700万美元MiSeq测序仪及试剂用于病原体检测   2012年9月18日,来自美国圣地亚哥BUSINESS WIRE的消息 C Illumina公司(纳斯达克代码:ILMN)今天宣布,它赢得了一份来自美国食品药品监督管理局(FDA)的合同,为该机构提供MiSe

CFAS 2016开幕之大会报告汇总篇

  分析测试百科网讯 2015年3月29日,第五届中国食品与农产品安全检测技术与质量控制国际论坛(简称 CFAS 2016)在北京国际会议中心举办(部分大会报告详见:CFAS 2016今日开幕 共话食品与农产品安全检测技术)。国家食品安全风险评估中心研究员 吴永宁  国家食品安全风险评估中

吴永宁:十三五食品领域重点研究方向都有哪些

  分析测试百科网讯 2015年11月4-5日,中国国际食品安全与质量控制会议暨展览(2015 CIFSQ)在京召开。4日召开的食品安全科学大会中,中国食品安全风险评估中心首席科学家吴永宁作了题为《中国食品安全科技计划:过去、现在

全基因组测序助力食源性疾病检测

CDC研究人员检查用于全基因组测序的电脑芯片。  李斯特菌暴发致3人死亡并且迫使美国得克萨斯州蓝铃冰淇淋公司在上个月底召回其全部产品,这是遗传流行病学如何正在改变食源性疾病检测的最新例子。两年前,位于亚特兰大的美国疾病控制和预防中心(CDC)启动一项试点计划,测序与某种疾病相关联的每个李斯特菌样品的

第七届食品安全技术论坛分会:致病菌限量与检测技术

  2014年3月20日上午,第七届中国北京国际食品安全技术论坛——食品中致病菌限量与检测技术专题研讨会在北京国家会议中心召开。此次会议邀请了军事医学科学院研究员、中国微生物学会副理事长杨瑞馥教授,国家食品安全风险评估中心食源性疾病监测部的郭云昌博士,北京出入

专访3位微生物学家:中国微生物组研究如何自强

  北京奥林匹克公园一条马路之隔的中科院微生物研究所把以上表述自豪地刻在楼前的石头上。从那里路过的人大都会不由自主地朝那块石头多看几眼,心中油然而生的除了敬意之外,还有对“微生物”的几分好奇。而近日,美国白宫以总统名义发布“国家微生物组计划”之举使得“微生物”在神秘之外,平添了攸关国家科技竞争力的更

六部门印发《“十三五”卫生与健康科技创新专项规划》

  分析测试百科网讯 近日,按照《中华人民共和国国民经济和社会发展第十三个五年规划纲要》、《“十三五”国家科技创新规划》、《“健康中国2030”规划纲要》等的总体部署,为进一步完善卫生与健康科技创新体系,提升我国卫生与健康科技创新能力,显著增强科技创新对提高公众健康水平和促进健康产业发展的支撑引领作

2015 cifsq Jorgen Schlund下一代测序和全基因组测序

  分析测试百科网讯 2015年11月4-5日,中国国际食品安全与质量控制会议暨展览(2015 cifsq)在京召开。会议由国际食品保护协会(iafp)主办,北京讯息展信息技术有限公司承办。新加坡南洋理工大学教授 Jorgen Schlundt  新加坡南洋理工大学教授Jorgen Sch

2015 CIFSQ召开 聚焦“创新发展,全球合作”下的食品安全

  分析测试百科网讯 2015年11月4-5日,中国国际食品安全与质量控制会议暨展览(2015 CIFSQ)在京召开。会议由国际食品保护协会(IAFP)主办,北京讯息展信息技术有限公司承办。  本次大

2014中国国际食品安全与质控会议与设备展热烈召开

  11月5日,2014中国国际食品安全与质量控制会议暨检测仪器设备展览会在上海龙之梦大酒店热烈召开。本次会议旨在努力提升和保证全球食品安全供应,邀请了来自全球不同地区和国家的政府官员、科学家、专家以及行业高管,提供了不可多得的与来自全球业内人士相互沟通交流的

食品安全中 不可“微”观的微生物

—访军事医学科学院研究员、中国微生物学会副理事长杨瑞馥  作为中国领先的食品安全技术推广平台,CBIFS食品安全论坛以为中国食品安全提供出色的技术解决方案为宗旨。CBIFS汇聚了众多行业内专家及企业代表,,积极交流、深入探讨,既是行业的技术创新研讨会,更是我国食品安全技术发展的盛会。 

第二届AVDC大会新增会议嘉宾抢先看!

 为进一步提高中国兽医诊断服务在可靠性、准确性、及时性和高通量等方面的表现,第二届国际兽医检测诊断大会将于2020年9月10-12日在南京国际展览中心举行。大会广泛邀请全球兽医检测诊断的杰出代表与不断进取的中国兽医进行深层次的分享、对话及相互启迪。大会详情时  间:2020年9月

新一代国产基因测序仪样机研制成功

  4月18日,中科院北京基因组所和吉林中科紫鑫科技有限公司在长春举办国产新一代基因测序仪样机观摩研讨会,向国内基因测序领域专家和应用单位代表展示这一合作成果,并向社会公开征集部分应用单位进行免费测试使用。   目前市场上所有的高通量基因测序设备和试剂均需进口。据不完全统计,仅2013年我国在测序

“523项目”预测微生物学技术团队召开专题报告会

  按照食品评估中心“523计划”能力建设项目安排,食品评估中心邀请“523计划”预测微生物学技术团队外聘专家,爱尔兰都柏林大学公共卫生、理疗与人口科学学院教授,都柏林大学食品安全中心主任Séamus Fanning先生于2016年5月19日在我中心做了题为“动物源性细菌耐药基因特征分析及耐药基因在

RiboPrinter® 在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用

  RiboPrinter® 在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用   梭状芽孢杆菌是一个多样化的革兰氏阳性菌属,专性厌氧,在环境中普遍存在。这个属大约包含了100多个种,基因组内总体的G+C含量范围在22-55%,反映出该属内的细菌在系统进化关系上的巨大差异。   该属内最主要的食源性致病菌为

速览美媒发布2019十大食品安全新闻事件

  近日,美国食品安全新闻(Food Safety News)回顾了2019年十大食品安全新闻事件。以下对这十大事件做了简短的介绍。  1. 联邦食品安全官员对疫情保密  美国食品药品管理局(FDA)对于与生菜有关的疫情保密了六个多星期,联邦政府内外的很多人都知道这次秘密爆发,但并未告知公众和媒体。

RiboPrinter® 在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用(二)

肉毒梭菌的Ribotyping鉴定及分子分型    正因为肉毒梭菌的种内菌株的多样性及其16S序列的高度保守性使得生化鉴定和16S测序鉴定等传统技术对肉毒梭菌的鉴定存在诸多难点,所以研究者们不遗余力应用更多分子生物学技术以缩短肉毒梭菌的鉴定时间,简化鉴定流程,增加鉴定结果的准确

NIH 2500万资助Venter传染病基因组研究

        近日,美国国家卫生研究院(National Institutes of Health)授予美国克雷格·文特尔研究所(J.Craig Venter Institute)2500万美元,以支持传染性疾病(疟疾和流感)的

254项北京市科委第四季度项目立项公开 新冠相关21项

  分析测试百科网讯 近日,北京市科委公布了2020年度市科委第四季度项目(课题)立项公开清单,共254项,项目涉及了首都临床诊疗技术研究及转化应用,新冠肺炎疫情科技防控,生命科学前沿创新培育,食品安全技术保障,创新品种及平台培育,城市精细化管理,疫情防控追溯、监测与消杀科技,科技支撑乡村产业振兴,

生物芯片有哪些应用领域

1.生物制药领域各大药厂和生物技术公司将会使用基因芯片发现筛选新药等。采用基因芯片技术,可以大大加快人类基因组计划的工作进度,其可用于基因测序、基因表达检测和新的遗传标志等,这对寻找新的功能基因、寻找新的药物作用靶点和开发新的基因药物具有重要意义。新药在实验阶段要通过人体安全性实验,就必须观察药物对

线虫基因组中存在DNA甲基化现象

  2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DN

吉大和华大基因联合发现线虫基因组中存在DNA甲基化现象

2012年10月18日,吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象,改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史,同时也使以DNA甲基化

RiboPrinter® 在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用(一)

RiboPrinter® 在肉毒梭菌鉴定和分子分型中的应用   梭状芽孢杆菌是一个多样化的革兰氏阳性菌属,专性厌氧,在环境中普遍存在。这个属大约包含了100多个种,基因组内总体的G+C含量范围在22-55%,反映出该属内的细菌在系统进化关系上的巨大差异。 该属内最主要的食源性致病

2020国际兽医检测诊断大会嘉宾新鲜出炉

2020国际兽医检测诊断大会嘉宾新鲜出炉为进一步提高中国兽医诊断服务在可靠性、准确性、及时性和高通量等方面的表现,第二届国际兽医检测诊断大会将于2020年6月13-15日在南京国际展览中心举行。大会广泛邀请全球兽医检测诊断的杰出代表与不断进取的中国兽医进行深层次的分享、对话及相互启迪。一、大会详情时