发布时间:2013-04-12 15:31 原文链接: Cell:两项研究聚焦“超级增强子”

  近日,麻省理工白头研究所和哈佛丹娜法伯癌症研究所以及冷泉港实验室这三家知名的研究机构的科学家惊讶地发现,一组称作“超级增强子”( super-enhancer)的强有力基因调控子,它们控制了细胞的状态和特性。相关两个研究论文刊登在了近期出版的《细胞》(Cell)杂志上。

  研究发现,健康细胞利用这些超级增强子来控制负责细胞功能和发育转换(例如从胚胎干细胞转换为神经细胞)的基因,而癌细胞能够装配自身的超级增强子,过度表达癌基因,导致侵袭性肿瘤。

  研究人员一直惊叹细胞控制的复杂性,在构成人体的各种各样细胞中,数百万的增强子控制着数以万计的基因。因此,发现只有数百的超级增强子控制了赋予每个细胞特性和功能的大多数关键基因,并且这些特异的控制在癌症和其他疾病中遭到了劫持,是令人感到惊喜的。

  研究人员在正常细胞中确立了一个基因调控模型,这一模型似乎远没有以前所认为的那么复杂,且更易解析。到目前为止,包括近期记述的 ENCODE(DNA元件百科全书)计划在内的大量研究,已经在哺乳动物细胞中鉴别出了超过一百万个控制基因表达的增强子或“开关”。破解每个开关的精确功能和靶基因将是一个艰巨的任务,而研究人员发现了一条捷径,来解析控制回路的核心基因。他们证实,只有数百个特异开关即所谓的“超级增强子”控制了实际上赋予每个细胞独特性的重要基因。

  这一观点的奇妙之处在于它非常简单。对于每个细胞特别重要的那些基因受到这些特化增强子的调控。在发育过程中这些超级增强子特别迅速地发生改变,因此在发育过程中失去老的超级增强子,建立新的超级增强子,驱动了细胞身份(cell identity)的变化。

  研究人员表示,细胞身份的改变可能以这些超级增强子作为开始和结束,这些超级增强子非常的强有力,但也对环境的改变极其的敏感。事实上,随着分化起始,活化的超级增强子被关闭,受到新建立的超级增强子控制的基因表达程序发生改变。这一过程使得我们更深入地认识了解了,一个受精卵最终产生超过一万亿个人体细胞的机制。发现这些超级增强子,有望帮助我们解析所有人类细胞的调控线路,包括癌细胞。

  科学家们沿着多发性骨髓瘤(MM)细胞的基因组,绘制出了超级增强子的定位图谱。他们发现区域中的超级增强子与已知的致癌基因有关联,其中包括臭名昭著的MYC癌基因。结果表明,这些MM细胞正形成自身的超级增强子,来驱动它们的原癌基因危险性的过表达。并且,这一现象并不局限于MM细胞,因为研究人员在非小细胞肺癌和多形性胶质母细胞瘤中也发现了重要肿瘤基因上的超级增强子。

  在观察发现敏感的超级增强子在环境中遭受破坏机制后,研究人员推测,在癌基因超速运转的癌细胞中这一敏感性有可能代表了一个脆弱点。哈佛丹娜法伯癌症研究所曾经开发了一种实验性药物JQ1,并曾经在MMZ细胞中证实JQ1选择性抑制了MYC的表达。然而对于JQ1抑制MYC的确切机制却一直不清楚。研究发现,其尤其强烈地抑制了MYC超级增强子。

  研究人员表示,在患者肿瘤中鉴别超级增强子,以及开发新疗法破坏它们对于重要癌基因的调控,展望这一前景很难不让人感到兴奋。超级增强子有可能成为鉴别重要基因基因的生物标记物,帮助指引开发出治疗新方法。这一基因调控超级增强子模式对于整个人类疾病状态具有重要的意义。

相关文章

医药狂掀涨停!细胞免疫治疗基因检测等概念走高

大家好!来一起关注上午的市场行情及最新资讯~5月8日,A股市场小幅低开后震荡下行,截至上午10时56分,深证成指、创业板指跌幅有所扩大。行业板块上,上午医药、农业、银行等板块表现居前,煤炭股盘中走高;......

《自然》连发3项研究:锻炼有益身体分子证据揭示

科技日报北京5月5日电 (记者张梦然)锻炼对身体有益似乎已是公认常识,但这其实是一个笼统的认知,人们对其分子层面的奥秘还不甚了解。不清楚这一过程,会影响人们对锻炼强度、类型以及相应疾病和健康......

人工智能设计的基因编辑工具来了

在不断探索以前未知的CRISPR基因编辑系统的过程中,研究人员从温泉、泥炭沼泽、粪便甚至酸奶中搜寻各种微生物。现在,由于生成式人工智能的进步,他们可能只需按一下按钮就可以设计出这些系统。据《自然》报道......

科学家发现50个肾癌相关新基因区

科技日报讯 (记者刘霞)在对癌症遗传易感性开展的一项新研究中,由美国国立卫生研究院下属国家癌症研究所科学家领导的一个国际研究小组,确定了50个与肾癌发病风险相关的新区域。这一成果有助推进对癌......

科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质

5月3日,《细胞—代谢》(CellMetabolism)刊发了中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队与合作者最新研究成果。他们改写了教科书中“线粒体基因组编码13个蛋白”的论断,首次发现线......

决定“社牛”还是“社恐”的基因或找到

科技日报讯 (记者张梦然)现在人们常说的“社恐”,其特征是会尽力回避处身公共场所或与人打交道;而“社牛”则与之恰恰相反。《自然·通讯》最新发表的一篇论文描述了果蝇体内一种调节社交网络结构的基......

新研究丰富酵母基因表达调控提升产物合成效率

华南理工大学食品科学与工程学院教授黄明涛团队对酿酒酵母中的未折叠蛋白响应元件(UPRE)进行了改造,并应用于基因表达的动态调控。相关成果于4月30日在美国《国家科学院院刊》(PNAS)以“创制UPRE......

青光眼基因治疗有望实现“单次给药,长效降压”

近日,中山大学中山眼科中心教授张秀兰团队与剑桥大学教授PatrickYu-WaiMan合作,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术靶向敲除碳酸酐酶2(Car2)基因,在小鼠模型上单次给药获得持续降低眼......

新基因在藤壶适应底栖固着生活中的作用机制获揭示

近日,厦门大学教授柯才焕、冯丹青团队和副教授张原野团队等合作,在海洋生物基因组学和污损生物附着研究领域取得最新进展,相关成果发表于《自然-遗传学》。该研究分析了代表性海洋污损生物藤壶附着和壳形成过程,......

挑战传统假设,研究揭示细胞有非基因组信息系统

美国莫菲特癌症中心科学家一项新研究提出,细胞拥有一个此前未知的、独立于基因组的信息处理系统,使它们能够对环境变化迅速作出反应。相关论文发表于最近的《交叉科学》(iScience)杂志。图片来源:《交叉......