国家生物医学分析中心蛋白质组学技术平台
蛋白质 组学开放平台
本平台由军事医学 科学院 投巨资建设， 负责人为: 张学敏, 何 昆, 杨松成。本平台也得到了国家863项目、国家 自然科学 基金和北京市科委大力资助。投入千万余元引进超高性能混合型串联 傅立叶 变换回旋共振质谱[NanoLC-Q-FT-ICR-MS]。
1. 基本情况
国家 生物医学 分析中心（NCBA） 蛋白质组学 技术平台 始建于1997年，主要由小规模 双向电泳 和第一代 生物质 谱（TofSpec 和Platform II）组成。
该平台于2001年更新为接近当年国际水平的第二代—— 高通量 （200 ～ 300蛋白质/天）、高灵敏（fmol）、高 分辨率 （>10,000）、高 准确度 （5 pmol）的较完整系统，包括可同时运行12块电泳胶的Ettan DALT twelve（Amersham）、能够进行随机 序列分析 和准确鉴定 翻译后修饰 的 毛细管 高效液 相色谱 - 电喷雾 - 四极杆 飞行时间 串联质谱 （CapLC Q-TOF2，Micromass）、带有源后衰变（PSD）功能的 基质辅助 激光解吸附电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS，Reflex III）和高 自动化 、可连续运行3840个样品的飞行时间质谱Autoflex（Bruker）、高容量HCT 离子阱 质谱和三级四极Quattro电喷雾串联质谱以及自动切胶系统SpotCutter（Bio Rad）和自动酶切系统MassPrep（Micromass）。
本平台已经更新为第三代。它以超高性能的9.4T混合型串联 傅里叶 变换回旋共振质谱为主要特征。分辨率超过140万，准确度优于1.0 ppm，可实现超 高分辨 、高准确度和高 灵敏度 的多级串联质谱功能。该系统配备了丰富的辅助离子解离组件，可实现整体蛋白质的序列标签分析，无须进行酶切而直接鉴定蛋白质，是 研究生 物 标志物 最有力的、最可靠的手段。
全国近400单位/ 课题组 在此平台上工作，课题来源包括973课题、863课题、国家自然 科学基金 、开发与生产等。确认了数十个全新蛋白。部分单位根据我们提供的结果成功克隆到新基因。许多课题因为本平台支持而获得国家、地方科技基金的资助。
北京质谱开放平台
北京质谱开放技术平台在2004年由国家 科技部 、北京市科委和军事医学科学院国家生物医学分析中心联合投资共建。核心仪器是9.4T混合型四极杆 傅里叶变换 离子回旋共振 质谱仪 （Q-FT-MS），此外中心还有十余台质谱仪配套设施，主要用于 新药研发 、生物反恐、药物和毒物分析、 蛋白质组 学、 代谢组学 、生物医学分析、食品和 环境卫生 分析等体系，为我国在上述领域的 科学研究 、新药产品开发和社会经济活动提供重要的技术支撑和服务。中心已通过国家计量认证和“中国 实验室 国家认可”，可提供权威的分析数据和检测报告。
双向电泳与 样品制备 技术
- BIO-RAD公司PROTEAN IEF Cell等电聚焦仪。
- Amersham pharmcia Biotech公司IPGphor等电聚焦仪。
- BIO-RAD公司PROTEAN II xi Cell电泳槽。
- Amersham pharmcia Biotech公司Ettan DALT II System。
- Amersham pharmcia Biotech公司Hoefet miniVE electrophoresis and electrotransfer Unit。
- 图像分析软件为Amersham pharmcia Biotech公司imageMaster™ 2D version:5.0
- 自动切胶系统SpotCutter
- 自动酶切系统MassPrep
蛋白质组学中的核心 质谱技术
纳升电喷雾四极杆飞行时间串联质谱仪Q-TOF2(LC-MS/MS，共3套)拥有强大的De novo 测序功能和自动化LC-MS/MS DDA功能，是多肽组学研究的重要技术。样品用量少，仅fmol样品就可测序（如电泳胶），可测N端封闭的 蛋白质序列 （Edman降解不能），确认新蛋白质可信度非常高。还可对蛋白质的翻译后修饰、不同剪切形式及 氨基酸 序列变异进行分析。
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS，共3套)可测定生物 大分子 的 分子量 高达600KDa。通过肽质量指纹谱（PMF）和肽序列标签（PST）技术可高灵敏度、高通量、快速鉴定蛋白质，是蛋白质组学研究必不可少的 生物质谱 ，也是临床蛋白质组学首选的技术。还可分析寡 核苷酸 序列、多糖结构、 聚合物 分子量分布、特殊合成 化学品 等。
质谱技术体系
- 高通量蛋白鉴定技术
- 肽序列标签和多肽序列De Novo测定法
- 高分辨串联质谱多肽序列标签自动化分析
- 蛋白质 糖基化 含量、位点和糖链的结构分析
- 蛋白质 磷酸化 含量及位点分析
- 蛋白质氨基酸修饰或突变研究及高级结构研究
- 单 寡核苷酸 多态性（SNP）快速分析与鉴定
- 二硫键 研究技术：游离巯基和二硫键定位技术
- 糖类、核酸与反义核酸等 生物大分子 相互作用 研究
- 抗原和抗体、配基和受体等非共价键相互作用
- 药物代谢 与代谢组学研究
- 中药成分指纹谱研究
联系人：何昆 He Kun
电话：010-66939396，010-66874903 传真：010-68186281
Email ：hk@proteomics.cn
主 页 ：http://www.proteomics.cn/
单 位 ：军事医学科学院国家生物医学分析中心
地址：北京市海淀区太平路27号
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帐号 ：02000049090268083-14
户名 ： 中国人 民解放军军事医学科学院生物医学分析中心
银行 ：中国工商行永定路支行（请注明收款人）
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中心办公室 |
宋荷英 86530557 |
核 磁共振 |
颜贤忠 86538174 |
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课题合作 |
何 昆 |
于 水 86538172 |
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HDMS LC-MS/MS |
王红霞 86533042 |
光 谱 |
宋占军 86538146 |
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高分辨FT质谱 |
何 昆 86533064 |
梁月琴 86538167 |
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MALDI-TOF/TOF |
王 杰 86663978 |
色 谱 |
董方霆 86538173 |
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Q-TOF多肽测序 |
李 萍 86530554 |
激光共聚焦及电镜 |
周 涛 86538040 |
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Western/ElISA |
李爱玲 86533064 |
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蛋白质组 |
何 昆 86533046 |
中心专家 |
杨松成 86538487 |
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电 泳 |
王鸿丽 86533041 |
蛋白质组学网 |
何 昆 86533046 |
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FAB/EI 小分子 |
薛 燕 86533049 |
胶内酶切 |
薛 燕 86533049 |
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