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数据平台让水稻更易“读懂”以水稻为研究对象的数据库

水稻生物学数据库众多、信息量大,但大多是生物学原始数据;国内传统种质资源数据库鲜有二次开发功能;国内缺少整合多学科数据的集成性数据库……如何从海量数据中挖掘有用信息提供给农业科研工作者,一直是个难题。中国水稻研究所鄂志国、王磊、庄杰云等创建了“国家水稻数据中心”(http://www.ricedata.cn/),让难题迎刃而解。 经过10多年的建设,该平台已发展成为一个以水稻为研究对象,融贯多学科的综合性数据库。其所载内容已被他人引用超过350次,它以网站形式为用户提供信息,日访问IP数超过500个,在国内外农学类信息系统中,访问量名列前茅。 据悉,研究人员开发系谱数,创建中国水稻品种及其系谱数据库,收录国内外水稻品种和育种材料等数据近1.5万份;构建优异稻种资源数据集和大品种指纹数据集,收集优异稻种资源数据共计5379份。 “本数据库是国内有关水稻品种资料最全,且唯一带有系谱追溯功能的数据库。”中国水稻研究所教授鄂志......阅读全文

数据平台让水稻更易“读懂” 以水稻为研究对象的数据库

  水稻生物学数据库众多、信息量大,但大多是生物学原始数据;国内传统种质资源数据库鲜有二次开发功能;国内缺少整合多学科数据的集成性数据库……如何从海量数据中挖掘有用信息提供给农业科研工作者,一直是个难题。中国水稻研究所鄂志国、王磊、庄杰云等创建了“国家水稻数据中心”(http://www.riced

系谱分析

在遗传病诊断时进行系谱分析有助于区分单基因病和多基因病,以及属于哪一种遗传方式;有助于区分某些表型相似的遗传病以及由于遗传性而出现的不同遗传方式。进行系谱分析应注意下列问题:①系谱的系统性、完整性和可靠性。系谱分析时必须有一个系统完整和可靠的系谱,否则可以导致错误的结论。完整的系谱应有三代以上有关患

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant

深圳将建食品安全监管 追溯和信用管理数据库

  9月28日,记者从最新一期政府公报获悉,深圳市人民政府办公厅印发的《深圳市信息化发展“十三五”规划》(以下简称《规划》)显示,其间深圳将建设统一的食品安全监管与服务信息系统,并将在2020年建成国内基础设施覆盖率最广、综合服务能力国内领先的宽带中国示范城市。   据《规划》显示, 到2020

分子生物学常用数据库汇总及推荐

分子生物学主要研究具体生物大分子在某一生物学行为过程中的表达变化、功能和作用方式;主要涉及基因的表达调控、蛋白相互作用、信号分子间的交互对话等。分子生物学实验常需要我们在具体实验前对所关注的基因的一些基本信息、可能受哪些因素调控、与哪些分子可能存在潜在的相互作用,可能参与哪些生物学行为等进行一些初步

基因测定方法--系谱分析法

非整倍体测交法可以用来测定基因属于哪一个常染色体。用常染色体隐性突变型纯合体(a/a)和野生型二倍体(+/+)杂交,再用子一代杂合体(a/+)和隐性亲本回交,在它们的子代中表型是野生型的和表型是突变型的各占50%(见孟德尔定律)。杂交 a/a × +/+↓回交 a/+  ×  a/a↓回交子代 a/

基因测定方法--系谱分析法

在早期的人类遗传学研究中,基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体,男子有一个X染色体和一个Y染色体,Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因(也就是说对于 X连锁基因来讲,男子是半合体)。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲,以后又必定传给女儿。这种遗传方式称为交叉遗

动物所等建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研

研究人员建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(

科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库

  水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物,同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累,使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此,研究人员构建了相关的水稻数据库,主要包括RAP-DB(日本农业生物资源研究所构建的水稻注释