基因组所半导体所研制的“模块化DNA分析系统”通过验收

4月1日,由中科院北京基因组研究所与中科院半导体研究所共同承担的中科院重大科研装备研制项目——“模块化DNA分析系统”项目,通过专家组评审验收。该项目的完成,标志着我国在第二代DNA测序仪研发方面,形成了具有自主知识产权的高通量DNA测序技术及其系统样机,在高端生命科学仪器装备国产化方面取得了突破性进展,填补了国内空白。 3月30日至4月1日期间,在中科院计划财务局的组织协调下,由动物所魏辅文、赵建国研究员,生物物理所杭海英、蒋太交研究员,昆明植物所高立志、龙春林研究员,物理所魏志义研究员等众多不同领域专家组成验收组对该项目进行了全面详实的测试和验收考核。期内,验收组认真听取了由基因组所项目负责人于军研究员、半导体所项目负责人俞育德研究员等人所作的项目研制工作、用户使用、测试和经费决算报告,验收组成员现场考察了研制的系统设备,并进行实际操作使用,审核了测试组提供的模块化DNA分析系统数据产出情况。通过三天的评审及对各项指标......阅读全文

什么是基因组测序技术

自1998年美国塞莱拉遗传公司组建以来,人类基因组研究开始由两部分科学家同时展开,分别是由公共经费支持的人类基因组工程和美国塞莱拉遗传公司。在研究过程中,他们也分别采用了两种不同的测序和分析的方法。塞莱拉公司的核心分析方法被称为"霰弹法",人类基因组工程则采用了"克隆法"。所谓"霰弹法",其实是一种

基因组所半导体所研制的“模块化DNA分析系统”通过验收

  4月1日,由中科院北京基因组研究所与中科院半导体研究所共同承担的中科院重大科研装备研制项目——“模块化DNA分析系统”项目,通过专家组评审验收。该项目的完成,标志着我国在第二代DNA测序仪研发方面,形成了具有自主知识产权的高通量DNA测序技术及其系统样机,在高端生命科学仪器装备国产化方面取得了突

-Science:宏基因组学测序技术

  宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。   长期以来,对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

美用新技术完成炭疽基因组测序

  美国乔治亚理工学院科学家使用一种称为RNA测序的新技术,描绘出了炭疽芽孢杆菌的基因表达。公布在最新一期《细菌学》杂志网络版上的此项研究成果,标志着任何细菌转录(细菌表达不同基因时产生的完整信使RNA集合)自此可被全面定义,并为研究细菌如何调控基因表达提供了更多细节。   乔治亚理工学院光

最新测序技术能用单个细胞分析基因组

  美国物理学家组织网9月18日报道,最近,来自美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校、克雷格·文特尔研究院和Illumina公司的科学家对现代基因测序算法进行了改良,只需从一个细菌细胞中提取的DNA(脱氧核糖核酸)就可组装成接近完整的基因组,准确率达到90%,而传统的测序方法至少需要10亿个

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

Illumina宣布推出迷你测序仪和半导体测序计划

  Illumina公司今天在摩根大通保健大会(JP Morgan Healthcare conference)上宣布了两款新的新一代测序平台,一款靶向测序系统MiniSeq,以及另一款仍在开发中的半导体测序仪。  同时,Illumina的CEO Jay Flatley还宣布了一款新的基因分型芯片,

Nature子刊发布重磅测序技术:基因组和转录组平行测序

  四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,G&T-seq(Genome and Transcriptome Sequencing)。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序,同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。  研究人员用G&T-seq对220个小鼠

RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?

  近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在

长读长测序技术:拯救基因组组装项目

  随着高精度长读长测序技术的出现,基因组难以组装的状态正在改变。《Nature Methods》杂志上近日发表了一篇文章,介绍了基因组组装项目如何受益于这种技术。  自测序技术问世以来,利用DNA序列的片段来组装人类、动植物或微生物的基因组就一直是难题。许多参考基因组都存在缺陷,如组装错误或存在缺

我国自主研发的DNA测序仪BIGIS4产出首例科研成果

  近日,由中国科学院科研装备研制项目资助,中科院北京基因组研究所与中科院半导体研究所共同研发的,具有自主知识产权的国产化高通量DNA测序仪BIGIS-4系统日前投入试运行。  基因组所的科研人员应用该系统完成了海洋中温菌(Glaciecola mesophila)的基因组测序工作,

半导体测序助力胎儿遗传测试

  来自中国广州医科大学等机构的科研人员报告了一种基于半导体的DNA测序平台可能有助于增加胎儿遗传测试的速度并减少成本。    近来基于大规模平行测序的方法已经促进了迅速的、非侵入式的出生前遗传测试,这种测试通过分析母亲血浆中流动的无细胞DNA从而测试被称为非整倍性的染色体拷贝数的异常。   

半导体技术策动新一轮基因测序价格战

  从几万美元到几千美元,完成个人全基因组测序所需要的花费越来越少,所需要的时间越来越短,并且,发生这样加速度变化的频率也越来越高。  今年3月份,总部位于美国加利福尼亚州的生命科学厂商Life Technologies公司又宣布在中国推出新的台式基因测序仪 Ion Proton。借助该技

Life-Technologies推出Ion-PGM-首款半导体技术的测序仪

  Life Technologies公司今日宣布推出Ion Personal Genome Machine(PGM™)测序仪,这是第一款使用半导体测序技术的产品。  这台测序仪的制造商是Ion Torrent公司,几个月之前,Life Technologies收购了该公司。Ion PGM测序仪的设

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

罗氏宣布推出目标基因组测序的新技术

罗氏应用科学部(Roche Applied Science)旗下的Roche NimbleGen公司的宣布推出商业化的NimbleGen序列捕获技术(NimbleGen Sequence Capture technology),以帮助那些希望对基因组选定目标区域进行高通量测序的科学家们。这项新技术使

多种测序技术成就高质量的蚊子基因组

  提起蚊子,相信大家没有爱只有恨吧。这种恼人的生物不仅会吵得你睡不好觉,还会传播多种疾病。每年全球大约有4亿人感染由埃及伊蚊(Aedes aegypti)传播的病毒,包括登革热、黄热病、寨卡和基孔肯雅病毒。  为了更好地了解蚊子背后的生物学,并开发消灭蚊子的工具,由洛克菲勒大学领导的国际研究团队本

JAMA:全基因组测序用于临床仍存在技术挑

  据3月12日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究报告披露,在一项有12名成年人参与的探索性研究中,应用全基因组测序(WGS)与不完整的遗传性疾病基因的覆盖、检测具有最高潜在临床影响的基因变异的低复验性,以及临床报告发现的不确定性有关,尽管在某些案例中,WGS会发现基因变异株从而引入早期的医疗干预

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

二代测序的焦磷酸测序,合成法测序,连接法测序和离子半导体测序原理

  不同的二代测序平台的区别主要体现在测序反应的技术上,这些差别可以分为4类:  焦磷酸测序,合成法测序,连接法测序和离子半导体测序。焦磷酸测序  在焦磷酸测序中,测序反应通过每个核苷酸结合过程中释放的焦磷酸来调控。释放的焦磷酸参与了一系列化学反应从而导致链光的产生。发出的光由记录基因蔟相应序列的相

年度创新:Ion-PGM半导体测序仪

【导读】Rothberg博士的梦想是打造测序领域的“数码相机”,既实惠又易用,还能快速得到结果。他确实做到了。与其他测序平台相比,Ion PGM™ 测序仪快速、简捷,扩展性好,更关键的一点是,价格实惠。它让测序平民化,让每个实验室都触手可及。  半导体技术已经改变了它所触及的每一个行业,从计算到摄影

测序技术发展过快?基因组学千万大奖告吹

  X奖基金会近日决定取消了奖金高达1000万美元的基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize),因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。   X奖基金会的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了关闭竞赛的决定。他表示,这是因为如今

欧盟廉价快速DNA基因组测序与解码技术获得突破

  欧盟第七研发框架计划(FP7)提供220万欧元资助,总研发投入290万欧元,由欧盟6个成员国及联系国塞尔维亚(总协调)、德国、英国、爱尔兰、瑞士和以色列跨学科科研人员组成的欧洲NANODNASEQUANCING研发团队。历时3年多的研发创新活动终于修成正果,即廉价快速的DNA基因组测序与解码技术

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

DNA测序的测序技术

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以

我国完成小麦A基因组测序

本报讯(记者丁佳)5月10日,《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果,该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究,全面揭示了小麦A基因组的结构和

测序解读基因组,真的好吗?

测序解读基因组,真的好吗?   “对基因组了解过多也不全是好事。”贝勒医学院生物医学伦理学副教授、医学伦理和健康中心主任Amy McGuire,在今年旧金山举办的TEDMED机构年度大会上说,“尤其是对自己基因组信息的了解。”  虽然McGuire 从事人类基因组学研究已有多年,但