我国研究院揭示m6A修饰对AtoI类RNA编辑的调控作用

A-to-I类型的RNA编辑是一种基本的生物学现象,广泛存在于哺乳动物中,目前被认为是一种能够产生分子多样性的转录后修饰机制,通过重新编码来调节蛋白质翻译,大大丰富了遗传信息。A-to-I类型的RNA编辑不仅对基因表达调控具有重要影响,而且还与很多疾病的发生发展过程密切相关。m6A 修饰对 A-to-I 编辑的负向调控作用及其机制 在多达100多种的RNA修饰中,m6A修饰与A-to-I编辑是存在于 (m)RNA上最普遍的两种RNA水平的表观修饰,都发生于腺苷 (adenosine, A) 上。基于上述两种修饰在催化原理和发生位置上的差异,推断m6A和A-to-I这两种最为普遍的RNA表观修饰一般来讲不会竞争在同一个A碱基位置发生。但是,它们之间是否存在其它的互作关系? 1月4日,中国科学院-马普计算生物学研究所杨力研究组和中国科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组在Molecular Cell 杂志上在线发表了题......阅读全文

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(二)

为了进一步说明Mettl3在CRC糖酵解过程中促进肿瘤发展的作用,作者通过RNA-seq(云序可提供此服务)分析比较Mettl3 KO和野生型的细胞(WT HCT116 CRC)基因表达情况。通过GO和KEGG分析,WT HCT116主要富集与葡萄糖代谢相关的信号通路,而Mettl3 K

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(三)

(5)酶METTL3作用分子机制研究已表明Mettl3是一种甲基化转移酶,可以调控靶分子的甲基化水平,那么是如何调节糖代谢过程呢?现有实验已表明Mettl3敲除或过表达不仅影响HK2和SLC2A1的甲基化水平,还调节HK2和SLC2A1的表达水平,这暗示着靶分子甲基化水平影响其表达,而双荧光素酶实验

m6A-RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用(四)

1)m6A修饰PCR芯片 new!云序生物提供m6A修饰PCR芯片检测,高效一次性检测m6A相关的Writer,Eraser,Reader的表达情况,m6A PCR 芯片基因列表(34 个基因)-human如图:  2)RNA修饰PCR芯片 new!云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测,高效一次

m6A-RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机

导读近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近期Hepat

Nature-|-m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成

  目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。   文章导读:   2018年10月31日,美国芝加哥大学何

揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性

  文章导读   m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性

  m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(三)

总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法,研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性,改善了体内肿 瘤生长,而ALK

小白必看!RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总

  RNA甲基化(RNA methylation)是一类表观遗传修饰,在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenos

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化(二)

5.进化角度分析人类m6A修饰位点作者通过比较人鼠之间保守m6A位点比例和保守对照A比例,来评估CDS区域m6A位点面临的自然选择压力,发现发生于第 一个密码子处的m6A的周围序列保守程度低,可能由于此处的m6A会带来不利的影响比如影响tRNA结合,而发生于第三个密码子处的m6A则受到进化选

睾丸间质细胞(LCs)m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3

总结: 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式,越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用,而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP(云序生物提供此服务)等多种技术联合分析,揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC

云序生物最新“RNA-甲基化”研究汇总拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性

m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济

m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(一)

目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。文章导读:2018年10月31日,美国芝加哥大学何川团队,上海科技大学

m6A修饰的长链非编码RNA调控神经元的发育及机制

  近日,Cell Reports在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)鲍岚研究组的最新研究进展(m6A-modified lincRNA Dubr is required for neuronal development by stabilizing YTHDF

m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(二)

接着,作者对同类型样本进行了m6A CLIP测序,对三个样本分别进行motif分析后,发现三者共有将近有11,000个序列为GGACU的peaks(图5 c)。将peak分别于转录本和基因组比对后,发现与YTHDF1 CLIP的结果十分类似(图5 d,e)。对两次CLIP实验的peaks

Hepatology:m6A-RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机

  近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近期Hepat

Hepatology:m6A-RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机

  导读   近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近

北京基因组所RNA-m6A甲基化调控mRNA剪切研究获进展

  6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最为丰富的甲基化修饰形式之一,发生于保守序列RRACH(R=G ,A; H=A,C or U)中,富集在mRNA的外显子编码区及3’-非编码区。类似于DNA甲基化修饰,RNA的m6A甲基化修饰也是可逆的,由

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

“RNA-甲基化”研究汇总——拟南芥篇

关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育

RNA修饰技术在华南农大余义勋组植物m1A-调控机制的运用

  RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The N1-met

云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用

  导读   RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The

转录组的重编写:RNA编辑

  基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠正,成为了

RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总

RNA甲基化(RNA methylation)是一类表观遗传修饰,在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methylad

Nature报道表观遗传学新发现

  日前,芝加哥大学的科学家们在Nature上发表最新的研究成果。这项研究揭示了N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)调控RNA-蛋白质相互作用的一个未知机制。  RNA结合蛋白通过与单链RNA结合基序(RNA binding motif,RBMs)1、2、3的结合来控制细胞

云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...4

2)RNA修饰PCR芯片 new!    云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测,高效一次性检测6种RNA修饰相关的Writer,Eraser,Reader的表达情况,最全面的RNA修饰相关基因覆盖,RNA 修饰芯片基因列表(68 个基因)-human如图:  3)m6A相关酶预合成的慢(腺)病毒

转录组的重编写:RNA编辑

  前 言   基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA

转录组的重编写:RNA编辑

前 言基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠