基因组重排的定义

基因组重排将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组,可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。......阅读全文

Nature-Genetics-揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排

  在刚刚过去不到一个月的时间,染色体外环状DNA(eccDNA)重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊,这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖,吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增,极大地促进肿瘤

DNA重排的概念

DNA重排,是基因活性调节的一种方式。这种调节主要是根据DNA片段在基因组中位置的变化,即从一个位置变换到另一个位置,从而改变基因的活性。

基因重排的概念

基因重排是指将一个基因从远离启动子的地方移到距启动子很近的地方从而启动转录的方式。

基因重排的分类

基因重排分基因内重排和基因间重排。基因结构重排的机制是一种DNA双链断裂(double-stand break)的修复过程,在等位基因内或等位基因之间,出现了重复单位复杂的转换式移动( conversional transfer)。

线性基因组的定义和结构特点

中文名称线性基因组英文名称linear genome定  义构成生物体全部遗传信息的核酸分子的一种结构形式,具有这种结构形式的长链核酸分子的5′端和3′端都是游离的。具有线性基因组的生物包括真核生物、某些噬菌体和病毒,其基因组的完整复制依赖于各种有别于具有环状基因组的生物。应用学科生物化学与分子生物

抗体基因重排

  抗体的L链是由C、V、J三个基因簇编码的,H链由C、V、D、J四个基因簇编码的。V是编码可变区,有300个种类;D编码高变区,有15 ~ 20个种类;J编码连接V、C的结合区,有4~5个种类;C编码恒定区,仅有一种。这些外显子通过多种多样的重排,所合成出的肽链,还要再进一步进行L和H链组合,这样

麦氏重排

  麦氏重排(McLafferty rearrangement)是对质谱分析中离子的重排反应提出的经验规则,于1956年由美国质谱学家麦克拉弗蒂(F.W.Mclafferty) 提出。  重排机理  当有机化合物含有不饱和基团(如C=O、C=N、C=S、C=C),且与不饱和基团相连的γ 碳上有氢原子

我国学者在合成型基因组重排领域取得重大突破

           图1.精确控制合成型单倍体和二倍体酵母基因组重排图2.体外DNA重排图3.杂合二倍体与跨物种基因组重排  在国家自然科学基金项目(项目编号:21750001,21621004)等资助下,天津大学元英进教授带领的合成生物学研究团队开发了一系列原创的基因组重排技术和策略,

基因内重排的特点

一个结果是错位链最末端的碱基率先复性,然后局部合成空缺的碱基,经过修复形成一个或几个插入重复单位。因为是发生在同- DNA分子内的单链插入,故这种基因的转移是一种基因内转换形式。基因内转换重排可以反复出现,每出现一次就增加一段插入序列,所以这种错位复性及修复方式在小卫星座位一般都是增加了重复单位数,

基因间重排的特点

另一种修复的结果更多见,DNA断端的游离单链末端侵入(strand invasion)到对应的染色单体上的等位基因,与另一条染色单体的DNA发生复性,结果形成了两同源染色单体的基因之间转换式移动。这类单链侵入形式导致异源链合成、延伸,会出现三种不同的后果:(1)从重复序列开始的错配新合成链,多数在达

基因重排的应用介绍

基因组重排技术结合了传统诱变技术和细胞融合技术,是一项对整个微生物基因组重排的新型育种技术。基因组重排技术通过多亲本原生质体递归融合,可以使工程菌快速获得多样复杂优良表型,并且无须了解其基因组学、代谢组学等具体背景。介绍了基因组重排技术的过程及应用,展现了基因组重排技术的优点,并给出了基因组重排技术

抗原抗体的基因重排

  抗体的L链是由C、V、J三个基因簇编码的,H链由C、V、D、J四个基因簇编码的。V是编码可变区,有300个种类;D编码高变区,有15 ~ 20个种类;J编码连接V、C的结合区,有4~5个种类;C编码恒定区,仅有一种。这些外显子通过多种多样的重排,所合成出的肽链,还要再进一步进行L和H链组合,这样

克莱森重排的应用

自然界中,在植物代谢的莽草酸途径中从分支酸到预苯酸的转换步骤就是一个克莱森重排反应;该反应受分支酸歧化酶的催化。预苯酸是一个重要的前体化合物,生物体内含苯环的天然化合物有一大半是由预苯酸转换过来的。克莱森重排的发现启示着化学家们发现更多更复杂反应的化学本质。

分子间的重排过程

分子间的重排可看作是几个基本过程的组合。例如,N-氯代乙酰苯在盐酸的作用下发生重排:先是发生置换反应产生分子氯,然后,氯与乙酰苯胺进行亲电取代反应得到产物。

麦氏重排的介绍

麦氏重排是MCLAFFERTY对质谱分析中离子的重排反应提出的经验规则。

分子重排反应的概念

重排指某种化合物在试剂、温度或其他因素的影响下,发生分子中某些基团的转移或分子内碳原子骨架的改变的过程。重排反应(rearrangement reaction)是分子的碳骨架发生重排生成结构异构体的化学反应,是有机反应中的一大类。重排通常涉及取代基由一个原子转移到同一个分子中的另一个原子上的过程。

基因重排的主要类型

基因内重排一个结果是错位链最末端的碱基率先复性,然后局部合成空缺的碱基,经过修复形成一个或几个插入重复单位。因为是发生在同- DNA分子内的单链插入,故这种基因的转移是一种基因内转换形式。基因内转换重排可以反复出现,每出现一次就增加一段插入序列,所以这种错位复性及修复方式在小卫星座位一般都是增加了重

麦氏重排的介绍

麦氏重排是MCLAFFERTY对质谱分析中离子的重排反应提出的经验规则。

基因组研究揭示复杂染色体重排或为子宫平滑肌瘤主因

  子宫平滑肌瘤是一种良性肿瘤,但影响着数百万女性的健康。对其分子机理的深入理解可为这种肿瘤的预防和治疗提供线索。芬兰肿瘤学会的Miika Mehine等人对此进行了研究,他们发现,一种与染色体破碎重组(Chromothripsis)很类似的复杂染色体重排是许多子宫平滑肌瘤染色体异常的主要原因。

什么是DNA重排?

DNA重排(DNA rearrangement)这种调节主要是根据DNA片段在基因组中位置的变化,即从一个位置变换到另一个位置,从而改变基因的活性。最熟知的两个例子是酵母交配型的控制和抗体基因的重排。

天津大学连发三篇Nature子刊-发表原创性基因组重排技术

  来自天津大学的元英进教授带领的合成生物学研究团队开发了一系列原创的基因组重排技术和策略,在化学再造酵母应用领域取得重大突破。  这些成果分别以“Precise control of SCRaMbLE in synthetic haploid and diploid yeast”(精准控制合成型单

关于基因重排的应用介绍

  基因组重排技术结合了传统诱变技术和细胞融合技术,是一项对整个微生物基因组重排的新型育种技术。基因组重排技术通过多亲本原生质体递归融合,可以使工程菌快速获得多样复杂优良表型,并且无须了解其基因组学、代谢组学等具体背景。介绍了基因组重排技术的过程及应用,展现了基因组重排技术的优点,并给出了基因组重排

克莱森重排的经典形式

克莱森重排反应最经典的形式是烯丙基苯基醚在高温(> 200°C)下重排,得到邻烯丙基苯酚。反应的机理是σ[3,3]重排(这也是最早发现的σ[3,3]重排反应),中间产物4-烯酮不稳定(无芳香性),会互变异构为有芳香性的酚。

克莱森重排的影响因素

一般地说,周环反应不受试剂和溶剂的极性的影响,也不受催化剂和引发剂的影响。然而,仔细研究仍可发现诸多因素能影响本反应。其中主要是溶剂效应,同位素效应和结构因素。溶剂效应溶剂对本反应速率的影响很大。在十七种不同溶剂中,反应速度能差约300倍。常用的溶剂有二苯醚,联苯,四氢蔡及三氟醋酸等。其中以三氟醋酸

关于基因重排的概述介绍

  基因结构重排的机制是一种DNA双链断裂(double-stand break)的修复过程,在等位基因内或等位基因之间,出现了重复单位复杂的转换式移动( conversional transfer)。  DNA双链断裂常发生在靠近串联重复序列的5’端的重复单位内,形成DNA分子的两个游离的、突出的

克莱森重排的反应机理

这个反应的特点是高度的区域选择性,产物大部分是邻位的。这一点与弗里斯重排(酚酯的酰基到邻对位)很相似(图1)。图1值得注意的是若苯环的两个邻位被堵住,则重排到对位。此时,反应产物是对位烯丙基取代物。这是因为中间产物发生了一个重排反应所致(图2)。图2审视整个过程可以看到:克莱森重排反应的驱动力是生成

克莱森重排的发现背景

克莱森重排(Claisen rearrangement)烯醇或酚的烯丙基 醚加热到200℃以仁时发生分子内重排,烯丙基从氧原子迁 移到碳原子上,称为克莱森重排。克莱森重排起初是在芳香化合物中发现的,这与当时(20世纪初期)合成化学家主要注意力集中的范围局限在芳香烃上有关。后来发现该反应可以拓展到非芳

Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组

  据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。  在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。  目前虽然许多病毒未

Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图

  近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助

细胞化学词汇重排基因

中文名称:重排基因英文名称:rearranging gene定  义:在功能淋巴细胞发育中,与V(D)J重组有关的基因。已发现的有α、β、γ和δ链的基因。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)