Nature遗传学综述：何川教授详解RNA甲基化
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现， mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用，它不仅将DNA的遗传信息传递给蛋白，也负责调控各种生物学过程。RNA上有一百多种化学修饰，但绝大多数修饰的功能还不为人知。人们一般认为RNA的寿命很短，其上的化学修饰是静态的，一旦形成就不可改变。 然而就在这两三年，科学家们首次发现了一种可逆性的RNA甲基化——m6A。随后，研究人员陆续定位了哺乳动物转录组中的m6A，鉴定了这种动态修饰所需的“读”、“写”和“擦除”蛋白，解析了m6A在转录后调控中的一些功能。 著名的华人化学生物学家、芝加哥大学的何川(Chuan He)教授在Nature Reviews Genetics......阅读全文
RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章频现 说起近来的科研热点，RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一，亮点文章频出，着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的，就有高达 17 篇。
RNA甲基化促进草莓成熟
果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分，对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成，受到精确调控。解析果实成熟调控机制，将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同，果实可分为两种类型：呼吸跃变型（如番茄、苹果、香蕉）和非呼吸跃变型（如草莓、葡萄、柑橘）。植物激素
RNA足迹和修饰干扰分析实验
实验方法原理 RNA 足迹和修饰干扰分析（RNA footprinting and modification interference analysis）是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA 足迹试验的理论基础，它们都是建立在变性、半变性或
Cell综述：RNA修饰的新作用
迄今为止，科学家们已经发现了上百种RNA修饰类型，但是其中大多数在mRNA和调控非编码RNAs中还是很罕见的。近期的一些研究发现指出，这些修饰中有至少有一些含量丰富，且保守性强。本期Cell杂志以此为中心，介绍了两种RNA修饰方式的分子机制，和生物学功能。 这两种RNA修饰方式分别是N6-甲基
RNA足迹和修饰干扰分析实验
RNA 足迹和修饰干扰分析（RNA footprinting and modification interference analysis）是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA 足迹试验的理论基础，它们都是建立在变性、半变性或自然条件下采用碱基特异性
RNA足迹和修饰干扰分析实验
实验方法原理 RNA 足迹和修饰干扰分析（RNA footprinting and modification interference analysis）是用来研究 RNA 与蛋白质相互作用的技术。RNA 测序及其结构分析的原理是 RNA
RNA甲基化研究深度剖析（一）
一、听说最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？1、高分文章频现 说起近来的科研热点，RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一，亮点文章频出，着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的，就有高达 17 篇。 图：RNA甲基化近期高
“RNA－甲基化”研究汇总——拟南芥篇
关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上频频亮相，并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者，许多学者将它作为研究对象，并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合，证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
揭秘神经发育过程中m6ARNA甲基化与组蛋白修饰间的关系1
文章导读表观转录组学的研究在生物发育和疾病相关性等方面正越来越引起人们的关注。其中m6A修饰的研究是表观转录组学研究的一大热点。研究表明，m6A标签在mRNA和lncRNA中超过10,000种，并且m6A参与mRNA的转录后修饰也成为基因表达中的一种重要的调控机制。m6A的在基因表达调控方面功能作用
揭秘神经发育过程中m6ARNA甲基化与组蛋白修饰间的关系2
（3）Mettl14缺失导致晚期出生神经元数量减少在P0小鼠中，作者通过特定标记识别相应的神经元亚型，在六个不同的皮层中发现了RGCs分化的神经元。其中，Cux1在晚期出生的神经元中表达，是II-IV的标记物，对标记信号进行定量结果表明相比于CK小鼠而言Mettl14-cKO小鼠中Cux1+的信号值
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2
（二）云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱，一次测序两篇文章疾病：胃癌样品：胃癌组织vs癌旁组织（6 vs 6）研究方法：m6A-MeRIP-Seq，RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志：Frontiers in Genetics影响因子：3.258
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1
一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼，而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化
亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，用PCR扩增（引物设计时尽量避免有CpG，以免受甲基化因素的影响）所需片段，则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序，并且与未经处理的序列比较
修饰性甲基化酶的基本信息
中文名称修饰性甲基化酶英文名称modification methylase定 义编号：EC 2.1.1.72；EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一种修饰酶。通常甲基化发生在限制性酶切位点的一两个碱基上，从而保护该酶切位点，使其不被相应的限制性内切酶所切割。应用学科生物化学与分子生物学（
修饰性甲基化酶的基本信息
中文名称修饰性甲基化酶英文名称modification methylase定 义编号：EC 2.1.1.72；EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一种修饰酶。通常甲基化发生在限制性酶切位点的一两个碱基上，从而保护该酶切位点，使其不被相应的限制性内切酶所切割。应用学科生物化学与分子生物学（
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
一文了解RNA甲基化机制
1. 什么是RNA甲基化修饰？ 我们知道DNA的甲基化修饰是发生在胞嘧啶（C）上的，而最常见的RNA的甲基化修饰是m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）和尿苷化修饰（uridylation，U-tail）。 m6A修饰在70年代就发现了，是可以发生在mRNA、lncR
RNA表观修饰能够影响天然免疫研究
前言 DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员，对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文，揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞
RNA表观修饰居然能够影响天然免疫
DDX46是RNA解旋酶DDX家族成员，对于细胞核内mRNA前体的剪接具有重要的调控作用。《Nature Immunology》杂志8月29日发表了中国医学科学院院长、中国工程院院士曹雪涛研究团队的论文，揭示了RNA解旋酶DDX46通过结合RNA去甲基化酶ALKBH改变细胞核内RNA修饰的新方
m5C－RNA修饰靶基因验证
技术简介 RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术，是了解转录后调控网络的有力工具。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP-Seq将RIP技
LCMS/MS检测整体RNA修饰水平
核酸修饰概要 ： DNA/RNA 修饰是表观遗传修饰的重要层面，指的是在 DNA、RNA 碱基 A\T\G\C\U 及核糖上的各种修饰。目前己发现的 DNA 修饰有十几种，而 RNA修饰有 100 多种，其中甲基化修饰占大部分，目前研究也较为普遍，并且可能具有重要生物调控作用。 实
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...
SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：R
表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升（二）
3、数据分析标准分析：（1）DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析，识别甲基化富集的基因组区域，默认p
DNA甲基化——表现遗传学中DNA的修饰
DNA甲基化是哺乳动物DNA最常见的复制后调节方式之一，是正常发育、分化所必需的，具有重要的生物学意义。在DNA甲基转移酶 (DNAmethyltransferase，DNMT)的作用下，以S—腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体，可以将甲基基团转移到基因组DNA胞嘧啶第 5位碳原子(C5)
表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升（一）
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一，我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），却不知道随着测序技术的快速发展，科研者们已经在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化，且DNA-
2018国自然研究热点二：－RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章频现 说起近来的科研热点，RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一，亮点文章频出，着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的，就有高达 17 篇。 图：
RNA甲基化酶的基本信息
中文名称RNA甲基化酶英文名称RNA methylase定 义编号：EC 2.1.1.-。催化RNA中碱基甲基化反应的酶。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
RNA甲基化位点分析新方法
继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后，小编看到读者们的热情度特别高。借此机会，再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心，QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se