GWAS荟萃分析发现新的乳腺癌风险位点

　　由剑桥大学研究人员领导的国际研究小组通过全基因组关联研究（GWAS）的荟萃分析，发现了15个与乳腺癌风险有明显关联的新位点。这项成果于3月9日在线发表于《Nature Genetics》杂志上。

　　这个团队汇集了超过10万名妇女（包含病例和对照）的数据，其中几万个样本已通过定制的iCOGS芯片进行了基因分型。这项研究重复了过去在70多个位点中发现的乳腺癌相关变异，并发现了15个新的位点。

　　文章的通讯作者、剑桥大学的遗传流行病学研究人员Douglas Easton表示，这些遗传标记不仅带来更多信息，说明乳腺癌高风险为何遗传以及如何遗传，也帮助他们针对那些最需要筛查和预防的妇女实施措施。

　　“解决这个难题的下一步是深入了解遗传变异如何让妇女增加风险，”Easton谈道。“我们肯定更多变异仍有待发现。”

　　之前的研究已经发现了一些与乳腺癌的中等至高风险相关的稀有变异，以及几十个常见SNP。然而，尽管一直在取得进展，但在理解乳腺癌风险的遗传可能性上仍有较大的差距。

　　为了缩小这种差距，研究人员汇集了15,748名欧洲乳腺癌患者及18,084名对照的数据。他们还融入了46,785名乳腺癌病例和42,892名对照的数据。这些样本曾在定制的iCOGS芯片上进行了基因分型。iCOGS是一款定制的Illumina iSelect基因分型芯片，包含211,155个标记，适用于研究三种与激素相关的癌症：乳腺癌、卵巢癌和前列腺癌。

　　从千人基因组计划获得信息之后，研究团队比较了1100多万个SNP在乳腺癌病例和对照中的模式。这项分析最终鉴定出15个新位点，之前未曾与乳腺癌相关联。

　　研究人员还深入研究了新位点上的潜在致病SNP。他们利用了ENCODE计划产生的乳腺细胞的增强子元件图谱，以及癌症基因组图谱所产生的表达数量性状位点的模式。

　　通过这些分析，Easton及其他作者指出，新发现的位点似乎解释了乳腺癌家族风险的2%，而分布在大约90个位点上的与乳腺癌相关的所有常见变异似乎解释了遗传可能性的16%。