华人学者全面解读癌症中的ceRNA

　　过去几年人们逐渐发现，竞争性内源RNA（ceRNA）是一类重要的转录后调控子。这些RNA通过miRNA介导的机制改变基因表达，进而影响细胞的功能。

　　德州大学MD安德森癌症中心的研究人员最近在Cell旗下的Trends in Genetics杂志上发表文章，全面介绍了癌症ceRNA研究的新进展，探讨了这类分子发挥的功能和机制。文章通讯作者是德州大学MD安德森癌症中心的Yiwen Chen博士。Chen博士早年毕业于复旦大学，后来在北卡罗来纳大学取得博士学位。

　　包括癌症在内的复杂疾病往往与转录水平和非转录水平的异常基因表达有关。最近的实体瘤和血液系统恶性肿瘤研究显示，ceRNA在癌症发病机理中起到了重要的作用，影响了关键致癌基因或抑癌基因的表达。这意味着ceRNA可以成为癌症治疗的潜在靶标。

　　文章指出，将计算机分析与生物学实验结合起来有助于鉴定癌症相关的ceRNA，探索它们的功能和机制。这样的研究能增进我们对癌症发病机制的理解，还有助于开发以RNA为基础的新癌症治疗策略。

　　假基因（Pseudogenes）一直被视为基因组的“垃圾”。贝斯以色列女执事医疗中心（BIDMC）的研究人员发现，假基因BRAF起到了ceRNA的作用，会诱导一种侵袭性的淋巴瘤样疾病。这一研究表明假基因有可能在各种疾病中发挥了重要的作用。（更多详细信息参见：癌症研究大师Cell惊人发现：致癌的假基因）

　　宁波大学医学院的研究人员对胃癌中与长链非编码RNA（lncRNAs）有关的竞争性内源RNA展开了调查，并将研究结果发布在《Scientific Reports》杂志上。他们基于胃癌lncRNA微阵列数据、生物信息学算法miRcode以及miRNA靶标数据库TarBase，首次构建出了一个lncRNA-miRNA-mRNA网络。随后，利用头颈部鳞癌、前列腺癌、甲状腺乳头状癌、垂体促性腺激素肿瘤、卵巢癌、慢性淋巴细胞白血病6种癌症类型的数据对这一网络进行了验证。研究结果显示出了一个明确的癌相关ceRNA网络。

　　非编码RNA主要包括长非编码RNA（lncRNA）和microRNAs（miRNA），它们可以调节转录因子的表达、指导染色质的重组和修饰、减少mRNA的翻译对基因表达进行控制。非编码RNA对维持细胞内稳态非常关键，在疾病特别是癌症中起到了重要的作用。Science Signaling杂志通过专题“Noncoding RNAs in cancer”，介绍了这类分子的生理和病理学功能。