质谱流式细胞技术推荐论文

　　研究人员将流式细胞技术与质谱分析技术结合在一起，发展出了质谱流式细胞技术（mass cytometry），这种融合技术能在单细胞水平上同时分析超过40种细胞参数，极大的增加了流式细胞分析评估复杂细胞系统和过程的能力。5月5日Cell杂志发表“Mass Cytometry: Single Cells, Many Features”综述，介绍了质谱流式细胞技术目前的现状，相关的仪器，主要涉及的应用范围，以及数据分析方法，和未来的发展前景。

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　　Single-cell mass cytometry of differential immune and drug responses across a human hematopoietic continuum

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　　2012年，多伦多大学和斯坦福大学采用同位素标记抗体，结合质谱分析的方法实现了同时对细胞表面多达一百种标记物的检测。

　　通常采用的荧光抗体标记细胞表面蛋白结合流式细胞术检测的方法，虽然能实现细胞分选，但只能够同时识别6-10种不同颜色的荧光，且还需尽量避免发生荧光重叠。

　　而这项研究通过这大量细胞计数法的方法，观察了人类骨髓产生的不同形态细胞中及表面的34种物质，不但能正确归类10多种不同类型的免疫细胞，还能观察到各类免疫细胞的内部变化，从而预知可能发生的变化。研究人员利用这一可以追踪单细胞多达45种(潜在性的100种或者更多)的技术观察了人类骨髓产生的不同形态细胞中及表面的34种物质。而且更为重要的是，研究人员不但能正确归类10多种不同类型的免疫细胞，还能观察到各类免疫细胞的内部变化，从而预知可能发生的变化。

　　Droplet barcoding for single-cell transcriptomics applied to embryonic stem cells

　　哈佛医学院Marc Kirschner等人开发了两种方法，能利用微珠将大量不同的DNA条形码同时传送到几十万纳米大小的液滴中。这些方法都利用了微流体装置来将细胞和微珠一起装入这些液滴中。这些液滴是在一个小型装配线上生成，沿着一根头发宽的槽道流动。

　　这两种技术分别为Drop-seq和inDrops。通过Drop-seq或inDrops运行一个批次的细胞，科学家们就可以看到整个样本中表达了哪些基因——并可以按每个细胞进行排序。

　　目前如果要生成96个单细胞表达谱，成本为一天数千美元。相比之下，Drop-seq每天只需6.5美分就可生成1万个单细胞表达谱。两篇Cell文章：廉价的单细胞基因表达分析新技术

　　Highly multiplexed imaging of tumor tissues with subcellular resolution by mass cytometry

　　来自苏黎世大学与苏黎世联邦理工学院的研究人员开发出了一种新方法成功综合分析和显影了来自患者样本的肿瘤细胞。

　　这项技术以医院常规使用的一些方法为基础，采用一些抗体标记非常薄的组织切片上的生物标记，抗体偶联上纯金属同位素，这样就无需染料采用纯金属同位素来显影生物标记物，避免了生物样本分析中颜色数量有限这一问题。而且这种方法有可能确定哪些细胞受到了什么影响及其影响的程度。通过这种方法可以精确找到控制系统的弱点，这有助于开发一些新的治疗方法。

　　A Continuous Molecular Roadmap to iPSC Reprogramming through Progression Analysis of Single-Cell Mass Cytometry

　　来自美国斯坦福大学医学院的研究人员，借助于质谱流式细胞技术进行分析，对细胞重编程的动态变化过程有了更全面的认识。作者指出，这样得到的结果与传统的荧光流式细胞术基本相同，但可让我们每秒钟在大约500个细胞中同时测量40多种不同的参数。使用质谱流式细胞技术，该研究小组在重编程的第一个3到4周，分析了三个不同的重编程细胞系。对质谱流式细胞技术数据集进行的时间分辨、高维进展分析，可促进连续的重编程分子图谱的构建。本研究所描述的这种方法和数据集，为重编程优化和其他细胞重编程机制研究、以及随时间动态变化的复杂细胞群研究，提供了宝贵的资源。