发布时间:2016-08-17 15:06 原文链接: 中外学者发布里程碑测序成果

  最近,一个国际研究小组对烟草天蛾的基因组序列进行了测序,这种毛虫在许多实验室被用于昆虫生物学研究。

  康奈尔大学Boyce Thompson研究所的Gary Blissard教授,和堪萨斯州立大学的Michael Kanost教授,启动了这项研究,并且是这个大的国际项目的共同资深作者,该项目包括来自50家研究机构和11个国家的114名研究人员。中国农业大学、西南大学、西北农林科技大学、东华大学、安徽农业大学和中科院动物研究所也是共同参与单位。

  研究人员将这项研究结果,以“Multifaceted biological insights from a draft genome sequence of the tobacco hornworm moth, Manduca sexta”为题发表在《Insect Biochemistry and Molecular Biology》杂志。科学家们已经通过国家农业图书馆和美国国家生物技术信息中心(NCBI)向公众提供这些基因组序列。

  Blissard说:“该项目的完成,标志着在昆虫生物化学和分子生物学研究的一个重要里程碑,因为烟草天蛾是一种重要的模式昆虫:几十年来它的生理学和生化已经得以深入研究。”

  Kanost说:“这个项目是世界各地科学家多年来的合作研究。我们想向科学家们提供这些有价值的数据,我们的希望是,这一测序的基因组将激励昆虫的分子生物学新研究。”

  烟草天蛾(Manduca sexta),发展成为卡罗来纳州狮身人面像蛾(Carolina sphinx moth)。Manduca这个名字来自拉丁词glutton(贪吃),因为这些毛毛虫吃的很多。烟草天蛾自然发生在北美洲、中美洲和南美洲,是园丁众所周知的一种害虫:它吃番茄植物的叶子,在辣椒、茄子、马铃薯植株上也可以发现它们的踪迹。来自这一植物家族的作物和杂草,包括烟草,可产生一些化学物质如尼古丁,阻止大多数昆虫的蚕食,但不能阻止天蛾,这使得烟草天蛾的生理学引起了科学家的极大兴趣。

  基因组测序,可以提高昆虫分子生物学、生理学和神经生物学研究,也可能有助于未来开发新的害虫管理方法。烟草天蛾是一种很好的模式物种,由于其体型较大——可以达到4英寸长,从而使科学家很容易收集它们的组织样本。

  Kanost研究烟草天蛾已经有几十年的时间,他和Blissard在2009年决定启动这一合作项目,测定烟草天蛾的基因组序列。通过合作,该研究团队测定了不同发育阶段编码昆虫基因以及RNA的DNA,以确定不同的基因何时表达,以及在哪些组织和器官内表达。

  Kanost和堪萨斯州立大学的研究小组,制备并纯化了烟草天蛾的DNA,将样本送至贝勒医学院人类基因组测序中心,进行基因组测序。Blissard在Boyce Thompson研究所的研究团队,从各种各样的组织以及特定发育阶段的卵、幼虫、蛹和成虫中,分离出了RNA。该国际研究小组使用一种通用的计算机系统,这样,世界各地的研究人员就可以根据他们的专业领域对基因序列进行分析。

  Blissard研究病毒与寄主之间的相互作用。他和他的同事检查了液泡蛋白分选(VPS)基因。这些基因编码的蛋白质,在整个健康的细胞内参与运输被称为囊泡的小容器,但这些蛋白质往往被病毒劫持,以移动病毒通过细胞。

  Blissard说:“这个项目的独特之处在于,在这么多基因家族的深入研究中,有许多不同的研究团队,这是一种非常丰富的资源,不仅将可以帮助研究昆虫的科学家,而且对研究其他生物和病原体及疾病的科学家有帮助。”

相关文章

哺乳动物“共同祖先”基因组重建完成

从鸭嘴兽到蓝鲸,每一种现代哺乳动物都是生活在大约1.8亿年前的“共同祖先”的后裔。人们对“共同祖先”知之甚少,现在,一个国际研究小组通过计算重建了其基因组。该成果将发表在《美国国家科学院院刊》上,对理......

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-WideAssociationStudy,G......

史上最全小麦基因组序列图集问世

  据最新一期《自然》杂志报道,加拿大萨斯喀彻温大学领导的国际团队在一项对全球小麦生产具有里程碑意义的研究——10+基因组计划中,对代表全球育种计划的15个小麦品种的基因组进行了测......

新型抗小麦白粉病基因被找到

  小麦白粉病是严重威胁我国小麦生产的重要病害之一。推广抗病品种是防治该病最经济有效的措施,育种上主要利用全生育期抗性及成株期抗性基因。然而单一抗源抗性的频繁丧失,使育种工作总是在......

新发地的新冠病毒基因组序列是什么样的?中疾控公布了

据中国疾病预防控制中心网站消息,6月18日晚,中国疾病预防控制中心通过“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”正式发布2020年6月北京新发地新冠疫情及病毒基因组序列数据。三条数据来自北京市确诊病例基因组......

中国新型冠状病毒的基因组序列

《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列(论文:AnewcoronavirusassociatedwithhumanrespiratorydiseaseinChina),病毒样本系从一名曾在......

我率先破译花生栽培种全基因组

近日,福建农林大学组织的“花生栽培种全基因组序列破译”成果认证会上,该研究组在国际上首次破译了花生栽培种基因组,成果总体处于国际同类研究领先水平。图片来源于网络花生是世界重要油料作物和第二大植物蛋白来......

基因组研究发现结肠癌发病机理

日本理化学研究所基因组序列分析项目负责人中川英刀和兵库县医科大学教授池内浩基的联合研究小组,对炎症性肠疾病转化结肠癌患者的全基因组进行解析,发现了结肠癌发病机理。该研究成果将于近日发表在美国《Onco......

科学家们在非洲人种基因组中找到了肥胖特异性基因

在最近的一项研究中,来自美国NIH,国家人类基因组研究所的研究者们首次分析了非洲人以及非洲裔美国人的基因组序列,发现其中有百分之一的人群携带有患肥胖症的基因在,这一结果能够解释为什么肥胖症总是具有家族......

蔬菜中心:绘成世界首张西瓜基因组序列图谱

我国是世界第一西瓜生产与消费大国,但是人们却始终未能从外到内了解它,直到2013年1月,国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱(影响因子35.532),标志着人类成功破译了西......