发布时间:2018-10-31 21:02 原文链接: PCR仪操作与维护

简单的说,PCR就是利用DNA聚合酶对特定基因做体外或试管内In Vitro的大量合成,基本上它是利用DNA聚合酶进行专一性的连锁复制。


目前,常用的技术,可以将一段基因复制为原来的一百亿至一千亿倍。根据DNA扩增的目的和检测的标准,可以将PCR仪分为普通PCR仪,梯度PCR仪,原位PCR仪,实时荧光定量PCR仪四类。


实验操作注意事项:


尽管扩增序列的残留污染大部分是假阳性反应的原因,样品间的交叉污染也是原因之一。因此,不仅要在进行扩增反应是谨慎认真,在样品的收集、抽提和扩增的所有环节都应该注意: 


1.戴一次性手套,若不小心溅上反应液,立即更换手套; 

2.使用一次性吸头,严禁与PCR产物分析室的吸头混用,吸头不要长时间暴露于空气中,避免气溶胶的污染; 

3.避免反应液飞溅,打开反应管时为避免此种情况,开盖前稍离心收集液体于管底。若不小心溅到手套或桌面上,应立刻更换手套并用稀酸擦拭桌面; 

4.操作多份样品时,制备反应混合液,先将dNTP、缓冲液、引物和酶混合好,然后分装,这样即可以减少操作,避免污染,又可以增加反应的精确度; 

5.最后加入反应模板,加入后盖紧反应管; 

6.操作时设立阴阳性对照和空白对照,即可验证PCR反应的可靠性,又可以协助判断扩增系统的可信性; 

7.尽可能用可替换或可高压处理的加样器,由于加样器最容易受产物气溶胶或标本DNA的污染,最好使用可替换或高压处理的加样器。

如没有这种特殊的加样器,至少PCR操作过程中加样器应该专用,不能交叉使用,尤其是PCR产物分析所用加样器不能拿到其它两个区; 

8.重复实验,验证结果,慎下结论。


具体归类为以下常见的4点,描述如下:
问题一:无扩增产物

现象:正对照有条带,而样品则无

原因:
1、模板:含有抑制物,含量低
2、Buffer对样品不合适
3、引物设计不当或者发生降解
4、反应条件:退火温度太高,延伸时间太短

对策:
1、纯化模板或者使用试剂盒提取模板DNA或加大模板的用量
2、更换Buffer或调整浓度
3、重新设计引物(避免链间二聚体和链内二级结构)或者换一管新引物
4、降低退火温度、延长延伸时间

问题二:非特异性扩增

现象:条带与预计的大小不一致或者非 特异性扩增带

原因:
1、引物特异性差
2、模板或引物浓度过高
3、酶量过多
4、Mg2+浓度偏高
5、退火温度偏低
6、循环次数过多

对策:
1、重新设计引物或者使用巢式PCR
2、适当降低模板或引物浓度
3、适当减少酶量
4、降低镁离子浓度
5、适当提高退火温度或使用二阶段温度法
6、减少循环次数

问题三:拖尾

现象:产物在凝胶上呈Smear状态

原因:
1、模板不纯
2、Buffer不合适
3、退火温度偏低
4、酶量过多
5、dNTP、Mg 2+浓度偏高
6、循环次数过多

对策:
1、纯化模板
2、更换Buffer
3、适当提高退火温度
4、适量用酶
5、适当降低dNTP和镁离子的浓度
6、减少循环次数

问题四:假阳性

现象:空白对照出现目的扩增产物


原因:
靶序列或扩增产物的交叉污染

对策:   
1、操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外;
2、除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管及加样枪头等均应一次性使用。
3、各种试剂最好先进行分装,然后低温贮存

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