发布时间:2019-09-13 14:18 原文链接: 氨基酸序列测定实验

  • 基本方案 测定通过 SDS-PAGE 转移到 PVDF 膜上样品的氨基酸序列

  • 辅助方案 准备SDS-PAGE蛋白质样品

           

实验方法原理
实验材料

分离胶和积层胶溶液 还原型谷胱甘肽干粉

试剂、试剂盒

4 × 凝胶缓冲液 10 × 下槽缓冲液 10 × 上槽缓冲液 甲醇 转移缓冲液 0.1%(V/V)考马斯亮蓝的 50%甲醇溶液 10%(V/V)乙酸的 50%甲醇溶液

仪器、耗材

微量注射器或凝胶加样吸头 PVDF 膜 小型电转装置 自动蛋白质测序仪

实验步骤

1. 如蛋白质电泳实验中所述,以分离胶和积层胶溶液灌制变性微型凝胶。在加入过硫酸铵和 TEMED 之前脱气,小心不要在转移或吸取液体时把空气带入聚合混合物中。如果加样孔不是矩形和结实的,则需重新灌制。


2. 组装垂直凝胶电泳装置。


3. 将 80 ml 4 × 凝胶缓冲液稀释至 320 ml(总浓度是 1 × 凝胶缓冲液)。将 200 ml 1 × 凝胶缓冲液倒入下层缓冲液槽。剩余的 1 × 凝胶缓冲液加入还原型谷胱甘肽(干粉)至终浓度 1 mmol/L,将它们倒入上层缓冲液储槽。


4. 将凝胶连接于恒压/恒流电源。每块胶 10 mA 预电泳 45 min。关闭电源,将凝胶放置过夜。


5. 倾出凝胶缓冲液,用纸巾或滤纸吸干加样孔。往下槽倒入 200 ml 1 × 下槽缓冲液。150 ml 1 × 上槽缓冲液加入 0.1 g 巯基乙酸,倒入上槽。


6. 将蛋白质样品溶于样品缓冲液,用微量注射器或凝胶加样吸头加样。对 0.75 mm 厚的 5 孔的微型凝胶每孔上样 < 30 μl。上样一已知蛋白质作为对照(如 β-乳球蛋白)。


7. 在 10 mA 下电泳至粉红色的示踪染料(焦宁 Y 染料,见辅助方案)达到凝胶的底部(60~80 min)。关闭电源。


8. 用甲醇润湿 2 张 PVDF 膜,然后浸没在转移缓冲液中。


9. 拆卸凝胶夹层,轻轻将玻璃板分开。按下面的次序在小型转移装置中组装转印夹层:塑料框、海绵、滤纸、凝胶、2 张 PVDF 膜、滤纸、海绵、塑料框(见图 10.6.1)。确保排除气泡。


10. 将转印夹层插入转移装置,最靠近阳极(红色或正极)的是膜。用转移缓冲液充满装置。在转移装置电极间的电压降为约 6 V/cm 的条件下(如 LKB 的 Midget MultiBlot,用 50 V),转移时间因目标蛋白和凝胶的浓度而异。关闭电源。


11. 拆卸转印装置,取出 PVDF 膜,将它浸没于含 0.1% 考马斯亮蓝的 50% 甲醇中,摇动 5 min。


12. 用含 10% 乙酸的 50% 甲醇脱色,摇动至条带变得清晰可见(5~10 min)。


13. 转印膜移入水中,拍照(可选,见 10.5)。


14. 用刀片将目标蛋白的条带切下(每条带均用新的刀片),将每一条带放入一个微量离心管中,室温风干(不要加热)。切下的条带储存于 -20℃。


15. 将切下的条带放入测序仪的反应室,蛋白质面朝向溶剂液流(或按厂商的说明)。在自动化测序仪中测序。

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注意事项
其他

在特定的电压下,15%胶20~50 kDa蛋白质转移20~40 min;10%~12%胶50~100 kDa蛋白质 转移70 min;7%胶150~200 kDa蛋白质转移90 min。对>60kDa的蛋白质,减少转移缓冲液中 的甲醇量至1%。


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