胃蛋白酶原是胃蛋白酶这种消化酶的前体物质，分为胃蛋白酶原I（PGI）和胃蛋白酶原II（PG II）。PG I是由胃底腺产生，是血循环中占主导地位的胃蛋白酶原。而PGII产生于胃底腺、贲门腺 ，幽门腺和布伦纳氏腺。当胃底腺粘膜萎缩时，PG I / PG II（I / II）的比值降低。
萎缩性胃炎是很重要的胃癌癌前病变，在癌症的发病机制中起着至关重要的作用。在慢性萎缩性胃炎的发展过程中，胃蛋白酶原I随胃主细胞明显减少二减少，同时幽门腺的增多，从而使PGI / PGII的比值不断减少。因此，PGI / PGII的比值可作为胃底腺粘膜是否萎缩的分析指标。联合分析PGI和PGI/PGII的比值，使用免疫学PG I和PG II的测试方法可适用于大规模筛查胃底腺粘膜疾病。PG I≤70.0 ng/mL, PG I / PG II ≤ 3 被认为具有临床意义，提示存在萎缩性胃炎的可能，需进行内镜检查，提高胃癌的检出效率。