lncRNA在农业领域的研究成果（二）

【思路及相应结果】

内容与图片源：（王立方，2015）

【结论】

通过全转录组测序、lncRNA测序和实时荧光定量的方法发现和鉴定了与家蚕产丝相关的lncRNA和其在不同产丝阶段的表达量变化，挑出了与家蚕产丝调控紧密相关的非编码RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互补链的lncR2034，与P25基因在后部丝腺呈相反的表达关系，表明lncR2034可能在5龄后部丝腺具有负向调控P25基因表达的作用（上图红括号标出）。

二、牛脂肪细胞分化

【目的】脂肪或肌肉组织中的脂肪和脂肪酸成分，对牛肉的外观、质地、风味、硬度和保质期等都有积极影响，是肉类营养价值的核心，阐明脂肪生成的调控机制对于提高肉品质具有重要意义。本研究为秦川牛优异肉质性状遗传机制、改善其生长速度，培育我国专门化的肉牛品种、提高畜牧业竞争力等方面奠定了基础。

【方法】研究中运用了RNA高通量测序技术、cDNA末端快速扩增、RNA荧光原位杂交、基因过表达、RNA干扰、双荧光素酶报告系统、基因定点突变等技术探索了一个lncRNA；ADNCR调控牛脂肪细胞分化的机制。

【思路及相应结果】

【结论】

①lncRNA高通量测序和lncRNA整体表达谱分析显示了在秦川牛的脂肪细胞分化过程中有2,882个相关的lncRNAs表达，通过对于此结果分析，鉴定了新的lncRNAs，其中包括与代谢过程密切相关的ADNCR，同时清晰地显示了基因在不同分化时期表达量的差异；

②差异表达分析和实时定光定量PCR(qRT-PCR)结果显示ADNCR在脂肪细胞分化前后下调程度最大，生物信息学预测和体外翻译试验均表明ADNCR符合长链非编码RNA的特征；

③ADNCR可能是潜在的ceRNA（内源性竞争RNA），通过与miR-204竞争结合SIRT1基因，提高表达量，抑制脂肪细胞分化；

④从5个本国品种的SIRT1基因中新鉴定到了5个SNPs位点；与南阳牛的生长性状关联分析表明，这5个SNPs与部分体尺性状显着相关；就基因分型方面，在秦川牛背最长肌、半腱肌和肝脏等组织中，AA基因分型会致使SIRT1基因的表达量减少。

参考文献：（李朋勋，2016）

【总结】

在本研究中，研究者运用多种分子基因技术，在牛脂肪细胞模型中实现了非编码RNA交互调控运用的分析与预测，落实ceRNA理论。同时对于牛的脂肪细胞分化进行了非常详尽的研究，上述研究结果只是一部分而已。这说明着农业上的研究可以深入地联合使用多种成熟的技术，从而得出高质量的研究成果。以上RNA测序，转录组测序，荧光定量分析，生物信息学分析预测，SNP检测都是阅微基因能够提供的业务。

三、白菜花粉受精

【目的】花粉形成和授粉受精是种子植物完成有性生殖及世代交替的重要环节，与生产上雄性不育系的利用、种子产量的高低与质量的优劣等息息相关。揭示其分子机理对于开展杂交育种、提高种子产量和质量等均具有重要意义。本例探讨lncRNA在调控花粉发育和授粉受精等生殖发育过程中起到的作用，目前还鲜有报道。

【思路及相应结果】

参考文献：（张芳，2015）