生物芯片的制作主要有光引导原位合成法、电喷射原位合成法、接触式点涂法和非接触喷射法(通过压电晶体或其他推进形式)四种，前两种方法都是在芯片上直接合成探针，后两种方法是把事先已制备好的探针样品(如通PCR方法)移植固定在玻璃或硅片上，通常通过电脑自动化操作呈阵列状分布。其中最经济高效的还是后两种方法。
接触式点样和非接触式点样各有优点：
性能上：接触式芯片点样仪控制精度低于非接触式芯片点样仪，点出的微小液滴图案也不如非接触式点样更接近圆形。但压电陶瓷喷头在处理黏稠度较大的液体时显得非常困难，采用的解决办法是对喷头腔体进行加热，但加热会造成蛋白变性，所以对热敏感的样品，无法进行点样;而接触式芯片点样仪对各类黏稠度的样品基本上都可以工作。
强度上：接触式点样针更安全，因为针体结构简单，工作过程中，针体在针导向槽内滑动，所以点样动作比较安全;而压电喷头结构复杂，点样头固定在喷头上，上下运动稍有不慎就会损坏压电喷头，操作起来安全性较低。
这两种芯片点样仪都互相不可替代。接触式芯片点样仪已经很成熟，价格也基本稳定，是点样设备的主流。非接触式芯片点样仪，只有少数公司具备喷头的设计加工能力，而且喷头属于耗材，目前成本高，售价单支1万元人民币左右，在制备技术和成本方面还有较大的开拓空间。