液相色谱仪是一种灵敏度相当高的检测仪器，异于气相色谱仪，液相色谱仪适于检测高沸点、大分子化合物，应用范围更加广泛。因此，在液相色谱仪检测过程中，为确保检测结果的准确性，对于检测样品和流动相溶剂的处理有着较高的要求。由于液相色谱仪结构精密，流动相溶剂和样品中若细小颗粒会增加进样阀的堵塞和磨损，同时也会增加泵头内活塞杆和活塞的磨损。此外，液相色谱柱填料颗粒很细，色谱柱内腔很小，溶剂和样品中的细小颗粒会使色谱柱和毛细管色谱柱容易堵塞。
流动相溶剂和样品过滤非常重要，它会对色谱柱、仪器起到保护作用，消除由于污染对分析结果的影响。常用液相色谱仪流动相和样品溶液过滤方法有两种，分别是溶剂过滤器和过滤头。
溶剂过滤器的原理和方法是利用滤膜过滤流动相溶液中的杂质，使用真空泵加快过滤的速率。其中，起关键性作用的就是滤超临界流体色谱仪(SFC)膜，滤膜分为有机和水系这两种，滤膜种类的选择根据过滤流动相溶液的性质而不同。水系滤膜适用于水基溶液，不耐有机溶剂，具有较高的化学和热稳定性，流速快、耐酸碱能力强，具有高机械强度，对蛋白质吸附力较低。有机滤膜为疏水性滤膜，适用于有机溶剂及空气过滤。耐酸耐碱，抗氧化剂。耐高温，强度好，化学性能稳定。不仅适用于含有酸碱性的水溶液，更适用于含有有机溶剂，如醇类、烃类、脂类、酚类、酮类等有机溶剂。
溶剂过滤器长期用于过滤溶剂中的杂质，溶剂的质量或污染以及藻类的生长会堵塞溶剂过滤器，从而影响泵的运行，尤其水溶液或磷酸盐缓冲液。为有效防止溶剂瓶内溶剂过滤器的堵塞，在使用过程中须严格执行溶剂过滤，避免使溶剂瓶暴露在直射阳光下，尽量使用琥珀色的溶剂瓶盛放水溶液或磷酸盐缓冲液，存放多日的蒸馏水及磷酸盐缓冲液不宜使用。
过滤超临界流体色谱仪(SFC)头用于液相色谱仪样品进样系统，一般与注射器结合使用，使用方法是在注射器摄入适量样品溶液之后，将过滤头安装在注射器进口处，在注射器向仪器进样口中注射样品溶液时即可起到过滤的作用。
最小检测浓度是考验仪器的灵敏度。最小检测浓度数值大，仪器的灵敏度就小，不能反应真正的噪音和漂移水平。例如：W公司的最小检测浓度小于1×10-8g/ml(萘/甲醇溶液)，而某些仪器是：4×10-8g/ml(萘/甲醇溶液)。这就说明W公司的仪器灵敏度大，可以检测更微量的样品。同样如W公司仪器把最小检测浓度调较得和其它产品是一样，也就表明W公司产品可以做得比其它产品噪音和漂移低4倍。
可以从这个公式看出：
最小检测浓度=2×仪器的噪音×进样的样品浓度/样品的峰高值
那光程又代表什么？我们先看下面一个公式，比尔定律：
超临界流体色谱仪(SFC)A=log(I0/I)=εCL
A是吸收率；I0代表参照池的光强；I为样品池的光强；ε为摩尔吸光系数；C是样品浓度；L就是流通池的光程。
可以看出在同样的"C"样品浓度情况下，"L"流通池的光程越大,仪器的"A吸收率"也就越大。这样可以检测到的样品浓度就越小。为什么有些厂家把仪器的流通池光程做得很小，小的只有3.5mm、4.5mm或5.5mm。这是因为这些厂家不能有效的降低整个系统的"噪音和漂移水平"，超临界流体色谱仪(SFC)只能牺牲流通池光程，也就是牺牲了仪器的检测灵敏度和最小检测浓度，来达到降低"噪音和漂移水平"目的。用通俗的说法比喻：HPLC就是一台音响，光程就是这台音响的音量控制键，光程越小就是把音量调小了，耳朵对音响本身的噪音和失真（可以理解为仪器的噪音和漂移）感觉就越小。但也就说明了这些仪器整体系统的制造水平不高。
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