发布时间:2020-09-07 11:59 原文链接: 差减cDNA文库法2

[cDNA末端磷酸化]
1.70℃灭活反应后,稍微离心一下,置室温5分钟。
2.在反应混合物(10μl)中加入:
1μl10×连接缓冲液
2μl10mMATP
1μl(10μ)DNA激酶

[限制性内切酶消化]以得到粘性末端
1.限制性内切酶消化DNA和载体。
2.在37℃保温1~5小时,然后冷却到室温,如果选用定向插入,需用两个不同的限制性内切酶消化,可得到两个不同的粘性末端。

[cDNA大小的选择]
1. 在50μl的总体积中加入5μl0×STE缓冲液。
2.SephacrylS-400柱收集分离出的cDNA。
3.用酚,氯仿抽提。
4.酒精沉淀之后,悬浮cDNA在10μl的无菌水中。
[cDNA和载体连接]载体可用λgt10,λgt11或λZAPⅡ
cDNA(0.1~1μg)2.5μl
10×连接缓冲液0.5μl
10mMαATP0.5μl
载体(1μg/μl)1.0μl
T4DNA连接酶(4WeissU/μl)0.5μl
总体积为5μl
12℃保温过夜,或4℃两天,然后放在室温下2小时。

[包装]试剂由Strategene制备
1.包装提取物从-70℃取出立即放入干冰中。
2.同时化解超声提取物(黄色)。令在手指间溶解冻红色管,到刚刚开始化时,加1μlDNA置于冰上。
3.快速加15μl超声提取物到DNA中,仔细混合,避免气泡,在室温下保温2小时(22℃)。
4.加500μl噬斑稀释缓冲液(SM溶液),再加20μl氯仿,温和的混合。
5.离心弃去噬菌体碎片。这个cDNA文库可以测效价,保存于4℃中。

[制备ZAPⅡ文库的单链cDNA]
1.在一个50ml的圆锥形离心管中,加宿主菌250μl到SM液中:
SM液:20mMTrispH7.5
100nmNaCl
10nMMgSO4
0.2%Gelatin
2.37℃保温15分钟后,加5ml2×YT(其中每升溶液含10gNaCl,10g酵母提取物,16g胰酶解胨),37℃摇5小时。
3.然后在70℃保温20分钟。
4.4000g离心5分钟,以除去细菌裂解碎片。回收上清液。这里应含有诱导得到的单链重组噬菌体,同样还会有辅助噬菌体。滴度可以按细菌的形成单位来计算。