发布时间:2021-06-29 16:14 原文链接: 单细胞多组学高通量测序平台(一)

单细胞多组学高通量测序技术简介


通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治疗中。

多组学研究肿瘤 探针资本整理


探针资本根据公开资料整理


通过多维的测序技术可以获得组织样品的基因表达、调控信息,然而组织中仍有不同功能、形态的细胞,通过大量细胞混合样品测序只能得到组织的平均状态,而无法获得每个细胞的信息,为了解决这一问题,各个组学技术的单细胞测序技术应运而生,并且在近10年的发展中有了突破性进展,被广泛应用于肿瘤研究,甚至临床应用中。

2010-2019年PubMed “single cell sequencing cancer”主题文献数量 探针资本


1.1单细胞组学技术发展历史

单细胞组学技术中以单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing)应用最为广泛。蛋白质是生命活动的承担者,而蛋白质的时空表达等信息均可由RNA反映,所以通过检测细胞内RNA的表达可以有效反映细胞状态。自从1991年第一篇使用array技术测量RNA表达的文章发表以来,对转录组(狭义上则指细胞所能转录出的所有信使RNA,mRNA)的研究技术经历了Array(1991)-> RNA sequencing(2008)-> single-cell RNA sequencing(2009)的发展历程。目前针对不同需求,呈现RNA sequencing和single-cell RNA sequencing并存的状态。

测序方法发展史 资料来源:Molecular Cell 探针资本整理