CPS 是细胞荚膜的主要成分，可作为屏障保护菌体免受外界不利环境影响。O-PS 由重复寡糖单位组成，是脂多糖主要的致病因子，可帮助致病菌逃避宿主免疫系统的识别。对大多数致病菌而言，CPS和O-PS具有免疫原性，可刺激机体产生保护性抗体。这些多糖均属于2型T细胞非依赖抗原（T cell-independent type 2，TI-2），进入机体后，通过与B细胞表面的抗原识别受体即表面免疫球蛋白分子（surface immunoglobulin mole?cules，sIg）交联而激活 B 细胞，引起一系列下游变化，使B细胞分化为可分泌抗体的浆细胞，在整个免疫过程中并没有T细胞的参与，因此不会形成免疫记忆，产生的抗体主要是亲和力较低的IgM和IgG2
由于多糖的免疫原性，可将其制成多糖疫苗，主要是将特异性的多糖纯化后制备而成。