按分化潜能干细胞可分为三类：全能干细胞，多能干细胞，单能干细胞。
全能干细胞：具有形成完整个体的分化潜能，如胚胎干细胞(ES细胞)。
多能干细胞：具有分化出多种细胞组织的潜能。如造血干细胞、神经干细胞。
单能干细胞：只能向一种或两种密切相关的细胞类型分化。如上皮组织基底层的干细胞，肌肉中的成肌细胞。
