原核生物不具有以核膜为界限的细胞核，它们的DNA被组织在一个类核结构中。类核是独特的结构并占据细菌细胞确定的区域。但这种结构是动态的，可被与细菌染色体相关的一系列组蛋白样蛋白的作用来维持和重塑 [6] 。古细菌染色体中的DNA被包装在与真核核小体相似的结构中。某些细菌还含有质粒或其它染色体外DNA。这些细胞质环状结构含有细胞DNA，在水平基因转移中发挥作用。细菌染色体倾向于结合于质膜上，因此，分子生物学通过离心裂解的细菌以便其从质粒DNA中的分离。与真核生物一样，原核染色体和质粒DNA通常是超螺旋的。DNA转录、调节和复制前必须首先将DNA超螺旋链解开。