即碱基互补配对原则（the principle of complementary base pairing）。
在DNA分子结构中，由于碱基间的氢键具有固定数目，且DNA双链间的距离恒定，使得碱基配对必须遵循一定的规律，这就是腺嘌呤（Adenine，A）一定与胸腺嘧啶（Thymine，T）配对，鸟嘌呤（Guanine，G）一定与胞嘧啶（Cytosine，C）配对。
碱基间的这种一一对应关系叫做碱基互补配对原则。
