近期,《Cell》在线发表了一篇文章,公布了癌症基因图谱(TCGA)部分的研究结果。
这是迄今为止最大型研究,利用多平台方法,观察了来自12种不同癌症类型的3500个肿瘤样本的分子和遗传学特征。这是很重要的,之前的分子研究大多数侧重于1种技术,在病理上将肿瘤类型定义为“组织/器官”病变类型。
这种新的方法借助6种不同的平台研究综合的基因组学——大多数是诸如DNA和RNA测序,联合蛋白质表达图谱的基因组学。
然后在所有平台上开展广泛的生物信息学分析以确认相似的亚组(群),从而确定不同分子癌症亚型(不同途径)。一共有11种癌症类型进行了确认,在肿瘤分期和主要的组织起源上提供了独立的和临床上的相关预后信息。根据这项研究,十分之一的癌症患者将通过这种新的分子分类,较之目前的肿瘤分类体系,出现不同的癌症分类。
这显然与患者管理(特别是在新的靶向治疗时代)存在潜在相关性,在未被选定的非小细胞肺癌(经完全不同的方法治疗)中潜在的错误分类肿瘤的比重堪比与EGFR突变率。
另外在该项研究中,在一个亚型中的肿瘤差异或者不同癌症(来自于不同的器官)之间的重叠具有挑衅性。例如,经确认膀胱癌的至少三个亚型会出现不同的预后;这些亚型中的一个几乎与肺腺癌无法区分,而另一种与头颈肿瘤引起的鳞状细胞癌最为相似。
这项研究强调并证实乳腺癌亚型之间存在差异,但是也显示出了令人惊讶的新发现,即基底样乳腺癌实际上构成了自己的癌症类别。基底样乳腺癌,通常被称为三阴性乳腺癌,尤其是在非裔美国人和年轻女性更为普遍。在分子水平上,比起乳腺癌的其他类型,这些基底样乳腺癌可能与卵巢癌和鳞状细胞癌起源的癌症有更多共同点。
但是,这些显然还需要验证,这些数据不亚于革命——随着病例研究数量的增加(可反映更多的癌症多样性),该篇文章的作者认为高达30%~50%病例最终需要重新分类。新的分类方法可能(应该)更专注于靶向大型基因类似癌症组的药物发展,而不只是单一的肿瘤类型。我们应该感谢这项了不起的工作,这无疑已经挑战了我们的认识……我相信会越来越好。
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