发布时间:2014-12-02 11:12 原文链接: 卢煜明:血浆DNA测序技术检测红斑狼疮

  来自香港中文大学的研究人员采用基因组和甲基化组测序方法,揭示出了系统性红斑狼疮(SLE)患者血浆DNA的异常。研究结果发布在11月26日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。

  领导这一研究的是香港中文大学的卢煜明(Y. M. Dennis Lo)教授。卢煜明教授是分子生物学的临床应用专家,尤其致力于人体内血浆DNA和RNA的研究。卢教授早在1997年就发现了孕妇外周血中存在漂流的胎儿DNA,并发展出了一套新技术来准确分析和度量母亲血浆内的胎儿DNA,被誉为无创产前诊断的奠基人,2013年入选美国科学院外籍院士。

  系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种弥漫性、全身性自身免疫病,主要累及皮肤粘膜、骨骼肌肉、肾脏及中枢神经系统,同时还可以累及肺、心脏、血液等多个器官和系统,表现出多种临床表现;血清中可检测到多种自身抗体和免疫学异常。虽然随着临床诊治水平的提高,红斑狼疮患者病死率已有下降,但它仍是最主要的致残、致死性自体免疫性疾病。该疾病的病因至今尚不明确,大量研究显示遗传、感染、内分泌、免疫异常和一些环境因素与发病有关。近年来测序技术飞速发展为鉴别出红斑狼疮的病因以及实现个体化治疗带来了希望。

  在这篇文章中,研究人员报告称他们采用大规模平行基因组和甲基化组测序,对系统性红斑狼疮患者血浆DNA的生物学特征进行了高分辨分析,由此发现了大量的血浆DNA异常。首先,他们鉴别出了系统性红斑狼疮患者血浆中的一些检测基因组代表(measured genomic representations ,MGRs)异常。证实MGRs异常的程度与抗双链DNA(抗dsDNA)抗体水平相关联。其次,他们发现活动期系统性红斑狼疮患者血浆DNA显示出分子大小偏态分布,短DNA片段的比例显著增高。且在系统性红斑狼疮患者中血浆DNA缩短的程度与系统性红斑狼疮疾病活动指数(SLEDAI)以及抗 dsDNA抗体水平相关。此外,他们还证实活动期系统性红斑狼疮患者的DNA甲基化密度下降。且低甲基化程度与SLEDAI和dsDNA抗体水平相关。

  为了探讨抗dsDNA抗体对于系统性红斑狼疮中血浆DNA的影响,研究人员采用了一种基于列 (Column-Based)的G蛋白捕获技术,来分离血浆中的IgG结合和非IgG结合DNA。研究人员发现与健康个体相比,系统性红斑狼疮患者血浆中 IgG结合DNA的浓度增高。较多的IgG结合发生在一些基因组位点,表明MGRs增高。此外,他们证实相比于非IgG结合血浆DNA,IgG结合血浆 DNA更短、低甲基化程度越高。

  这些观察结果增进了我们对于系统性红斑狼疮中血浆DNA异常谱的理解,并有可能为我们提供了一些系统性红斑狼疮的新分子标记物。此外,作者们也在文章提出基于这些结果,当解读系统性红斑狼疮患者的血浆DNA、非侵袭性产前检测以及癌症测试结果时,人们应当持谨慎小心的态度。

相关文章

研究人员基于FFPE样本构建甲基化图谱预测癌症原发部位

9月14日,《自然-通讯》(NatureCommunications)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心石建涛组完成的最新合作研究成果(DNAmethylationprofilingtode......

遗传年龄或可评估自闭症和精神分裂症患者脑组织衰老速度!

自闭症(ASD)和精神分裂症(SCZ)是常见的慢性精神疾病,在行为、遗传学和神经病理学等方面存在相当多的重叠特征,提示自闭症和精神分裂症可能存在共同的神经发病机制。衰老与表观遗传效应的动态变化密切相关......

全球首例异基因造血干细胞治疗LPI患儿康复

2017年,6岁的童童(化名)开始出现烦躁、间断谵妄、无热惊厥。查体结果显示,其免疫指标显著异常,肾穿检查为狼疮肾炎,同时伴有呼吸、血液、泌尿系统受累的症状。综合上述表现,童童被诊断为“系统性红斑狼疮......

2个月年轻4.6岁!饮食、运动改变DNA甲基化,逆转衰老

衰老,是一个复杂、多阶段、渐进的过程,发生在生命的整个过程。随着时间的流逝,人体的器官、肌肉会逐渐衰老,一些疾病也伴随着年龄的增长而发生,包括癌症、糖尿病、心血管疾病等。DNA甲基化,是一种DNA上的......

输注年轻血浆,实验鼠寿命打破历史记录

研究实验性抗衰老疗法的科学家声称,他们的实验室老鼠Sima打破了老鼠的寿命记录。Sima是印地语中的“极限”或“边界”一词。以该词命名的老鼠是一群啮齿动物中仅存的幸存者,这些啮齿动物接受了从幼鼠身上提......

人体血浆有效及预警“信号”找到了

危重症是指病情严重且威胁患者生命的综合征,常由创伤、感染等诱发。如果能找到有效治疗及预警危重症患者病情走向的关键“信号”,将为危重症患者的诊治提供非常有效的参考,极大提高其救治率。中南大学湘雅三医院心......

解读|单采血浆采集供应全过程技术操作规范升级

一、《规程》修订背景为规范单采血浆采集供应全过程技术操作,加强单采血浆站管理,原卫生部于2011年制定发布了《单采血浆站技术操作规程》(以下简称《规程》)。为不断适应单采血浆站技术发展要求,提高原料血......

单采血浆站操作规程修改

各省、自治区、直辖市及新疆生产建设兵团卫生健康委:为进一步提高单采血浆站规范化执业水平,提升血浆质量,保障献血浆者安全,根据《单采血浆站质量管理规范(2022年版)》《单采血浆站实验室质量管理规范(2......

林东昕:DNA甲基化是癌症早筛指标“潜力股”

“新冠疫情早期,我们就研发出了核酸检测试剂,可以确定谁被感染、谁需要隔离和治疗。但遗憾的是,人类有很多种严重疾病,例如癌症,目前为止还没有出现像新冠核酸检测这样简单的方法,甄别谁容易得或者要得癌症。”......

昆明植物所在DNA甲基化调控竹笋快速生长研究中获进展

竹类植物作为一种特殊的禾草,其笋期的快速生长这一特殊性状备受关注,但以往研究集中在细胞微观结构、转录组、代谢组、蛋白质组、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作为重要的表观遗传修饰,主要参与转座子沉......