CASMS平行研讨会：大咖齐聚丨临床蛋白质组路在何方？

　　分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在10日举办的“Mass Spectrometry in Clinical Proteomics: What We Do Now”平行研讨会，华盛顿大学圣路易斯分校医学院Li Ding博士、美国临床多组学分子诊断公司Qing Wang博士、亚利桑那大学Haining Zhu博士、约翰霍普金斯大学Hui Zhang博士、西湖大学郭天南博士带来精彩的学术报告。分析测试百科网作为独家支持媒体，将持续为您带来精彩报告。

　　华盛顿大学圣路易斯分校医学院Li Ding博士

　　报告题目：Going Beyond drivers in Renal Cell Carcinoma

　　基因组改变分析显示3p缺失是CCRCC的一个重要标志。人们不断扩大CCRCC研究，目前已经确认213个CCRCC+9个其他RCC，但是由于临床试验费用高、持续时间长、患者不足阻碍了新疗法的发展，用于开发个性化药物和新疗法的患者衍生异种移植物（PDX）模型进入了人们的视野。

　　报告指出CPTAC大规模蛋白质组学研究为药物治疗奠定基础，大多数组学指导的靶向治疗在CCRCC PDX模型中显示出一定的疗效-RTK-mT或HDAC-HIF-MEK-CDK抑制剂等。在所有试验组合中，Cabozantinib+Sapanisertib组合的疗效最好。一些模型显示肿瘤体积减少了-70%。HGF高表达的细胞系可能对Cabozantinib不太敏感，这可能是由于通过HGF/C-MET的替代血管生成途径所致。激活Plk3 CA突变可预测对的更高敏感性。总的来说，组学结果在解释治疗反应差异和预测结果方面很有价值。

　　美国临床多组学分子诊断公司Qing Wang博士

　　报告题目：Valid-NEO: An Integrated System for Neoantigen Validation from Limited Clinical Samples

　　新抗原是免疫系统以前未识别的新形成的抗原，肿瘤新抗原即突变相关新抗原可出现在肿瘤细胞表面，可以被T细胞识别。免疫检查点抑制剂（如抗pd-1抗体）的有效性取决于对MANAS的识别，很难可靠地检测和量化新抗原，从而验证其作为个体化癌症治疗靶点的潜力。

　　然而新抗原检测中的三个技术问题：1.Hla新抗原复合物的最佳富集程序；2.来自IP系统的污染（清洁剂）；3.新抗原选择（解决肽的化学稳定性问题）。

　　报告介绍了2项使用Valid-neo的代表性研究，已取得初步成果。目前与23家制药公司合作，实现了现成的个性化癌症治疗，同时已经为配套诊断提交一份手稿供审查。

　　亚利桑那大学Haining Zhu博士

　　报告题目：Misfolded Proteins in the Aged Brain

　　报告指出特定的大脑区域表现出明显的疾病特异性脆弱性（神经元内含物与细胞和功能丧失密切相关）；老年人脑中经常同时存在多种疾病，这为针对阿尔茨海默病的新治疗策略带来了希望；载脂蛋白E蛋白病是有或无载脂蛋白Eε4等位基因个体的主要痴呆相关病理生物标志物；在老年人的大脑中，可能有比以前想象的更多的致病性错误折叠蛋白质。

　　约翰霍普金斯大学Hui Zhang博士

　　报告题目：Proteogenomic Characterizations of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

　　癌症的蛋白质基因组学特征是指基因组改变与癌症病理生物学的功能机制联系起来，描述仅用于捕获蛋白质基因组分析的新见解，提供癌症特异性蛋白质基因组改变作为新的检测或治疗靶点，为临床/生物学调查的公众访问生成资源。

　　报告介绍了利用正交法确定研究队列中的肿瘤细胞数，蛋白质基因组学特征揭示了基因组改变和多组亚型的功能影响，用于早期检测或治疗干预的蛋白质和糖蛋白清单，磷酸蛋白质组学揭示了KRAS下游的假定治疗靶点，多组学整合将内皮细胞重塑和糖酵解与免疫排斥联系起来。

　　西湖大学郭天南博士

　　报告题目：High-Throughput Proteomics for Minute Amounts of Tissues

　　蛋白质组对疾病的诊断非常重要，科学技术的发展让蛋白质组技术用在临床生物标志物的发现成为可能。报告指出SWATH/DIA、压力循环技术（PCT）、蛋白质的稳定性研究、蛋白质异质性研究、石蜡组织样本的蛋白质组变化使得使用蛋白质组大数据进行数据分析寻找生物标志物成为了可能。通过甲状腺结节的良恶性诊断作为例子，来证明基于PCT辅助的SWATH/DIA质谱技术的蛋白质组学对精准医疗具有可行性。

  关于Mass Spectrometry in Clinical Proteomics: What We Do Now分论坛演讲人的简介，请见：http://www.casms.org/?action=content&id=63