随着临床级新一代测序(NGS)方法的逐渐成熟,使用组织和来自血液的ctDNA评估肿瘤患者基因改变成为可能。最近来自美国加州大学医学院的研究检测了62名晚期乳腺癌患者的ctDNA,其中38名患者还有组织的NGS测序结果。
对比这些结果发现,ctDNA的NGS检测结果中能够发现肿瘤相关的基因改变,最常见的是TP53和PIK3CA基因的改变,还会观察到EGFR的扩增。当ctDNA与组织的采集时间相差小于6个月时,两者之间的一致性更高。此外,ctDNA定量检测还能提供患者的预后信息,基因改变的程度与生存时间有关。
乳腺癌可能是最早出现“靶向”治疗的肿瘤之一,比如通过切除卵巢和药物拮抗治疗激素受体阳性的乳腺癌患者,对HER2阳性的患者使用相应的抗HER2治疗。随着越来越多肿瘤相关基因改变的发现,肿瘤的精准治疗时代渐渐到来,最近的NGS技术的出现,更是大大推动了这一进程。最近的NGS技术主要基于组织以及ctDNA,来自美国加州大学医学院的研究探索这两种技术对于乳腺癌治疗的意义。
研究纳入了62名晚期乳腺癌患者,她们之前接受治疗的中位数量为5种。62名患者有基于ctDNA的NGS检测结果,检测了54-70个不等的基因,其中38名患者还有组织NGS检测结果,检测了236-315个不等的基因。在ctDNA的检测结果中有42名患者具有特征性的改变,而组织NGS则在37名患者中检测出了有意义的改变。
ctDNA和组织NGS中检测出的肿瘤相关的基因改变
ctDNA的检测结果中,中位的有意义改变基因数量为1个(范围 0-7个),其中最为常见的是TP53(37%)和PIK3CA(23%)基因的改变。组织的检测结果中,中位的有意义改变基因数量为4个(范围 0-17个),其中最为常见的也是TP53(37%)和PIK3CA(24%)基因的改变。此外,在11%的ctDNA 患者中还检测到了EGFR基因的扩增,这一基因改变在组织的检测结果中并不存在。
组织和ctNDA的NGS检测结果稍有差异
比较ctDNA以及组织NGS的检测结果发现,当两个样本的采集、分离时间小于6个月时,两者之间的一致性会更好。ctDNA能够检测到48%在组织中检测到的改变,而在组织中则能检测到ctDNA中48%的改变。在排除了ER和ERBB2 改变,仅考虑其他具有可能临床意义的改变时,两者结果之间的重叠比例可以达到66%和95%。研究人员认为两种检测方法之间的差异可能与取样的时间间隔以及肿瘤异质性有关。
ctDNA定量分析能够提供患者的预后信息
进一步的研究考虑到了ctDNA的定量检测结果。分析发现,如果ctDNA的检测结果中基因改变的较多的患者往往预后会更差。具体而言,对于存在大于1个基因改变占ctDNA>5%的患者而言,其生存期就会较基因改变占ctDNA<5%的患者明显缩短(6.7月 vs 17.9月; P=0.01)。
研究人员认为,这两种技术能够提供互补的结果并对患者的预后有一定的提示作用。接下去应该开展前瞻性的队列研究对比两种技术的检测结果并评估它们对于患者预后的影响,从而为乳腺癌的患者的治疗决策提供更多有效的信息。
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