发布时间:2022-12-02 11:24 原文链接: OxfordNanopore便携式高通量测序仪,打开基因组学新市场

  Oxford Nanopore Technologies(“Oxford Nanopore”)推出PromethION 2(“P2”)Solo测序仪,这是全球可及性最高的高通量测序设备,有可能大大提高针对人类遗传学和其他更大数据集的准确、快速和负担得起的测序的可及性。

  P2 Solo是市场上唯一一款小型、高通量的测序仪,其大小相当于印刷版《指环王》三部曲中的一册。新设备让任何人可以突破基础的DNA分析,能够在一个平台上整合更全面的遗传变异、转录组和表观遗传分析,以推动科学发现并改善生活质量。

  在PromethION平台已经证实的价值的基础上,该新设备使用任何长度非扩增读长(从20bp到超过4M bp)的高精度纳米孔测序,并从单个测序芯片中捕获完整的生物学信息,包括SNPs、INDELs、结构变异和甲基化。

  该设备旨在通过为任何人在任何地点提供高通量的实时全基因组测序数据来打开基因组市场:

  用户可通过全新的P2 Solo设备使用纳米孔测序技术,每年在自己的实验室对多达190-380个人类基因组进行全面测序。如使用 PromethION 48 (“P48”),每年测序的人类基因组数量可提高至约4600-9200个。每张测序芯片包括1-2个基因组。

  利用Oxford Nanopore提供的独特的“免费盒子”的模式,用户能够在自己的实验室中以不到1000美元的价格使用P2完成全面的人类基因组测序。或当使用P48设备以生产模式运行时,实现约300至600美元的基因组价格(每张测序芯片有1-2个人类基因组,简单的文库制备成本为每个基因组43美元起,设备、甲基化和任何长度片段均无需额外成本),并还有进一步降低的可能性。

  P2 Solo的尺寸和功能与其卓越的准确度相匹配,将最新的R10.4.1测序芯片与最新的试剂盒14相结合,提供测序数据,实现99.6% (Q24)的模态原始读长单链准确度和99.92% (Q31)的单分子双链准确度,运行条件可调节,实现进一步优化并提高了灵活性。

  在一个小型测试“开发”团队的早期项目中,P2 Solo已经被用于分析癌症研究样本。纳米孔测序结合了可以生成涵盖复杂基因组区域的长测序读长(长达4 Mb)的设备,以及集成的碱基修饰检测(包括DNA/RNA甲基化)和实时结果。这为癌症样本的全面表征提供了一个完整、精简和快速的解决方案。

  除了P2 Solod的全新上市,Oxford Nanopore还提供数据分析解决方案EPI2ME的全基因组工作流程。用户只需上传自己的文件,一键点击便可获取小型变异、结构变异和甲基化报告。

  PromethION 2是Oxford Nanopore的完全即插即用型台式纳米孔测序仪,与P2 Solo为同系列产品,搭载强大的GPU,可运行两个高通量的PromethION测序芯片。您可提前订购,几个月内即可发货。

  PromethION系列产品通过进一步将可持续发展理念融入产品设计、生产流程和日常运营中,最大限度地减少对环境的负面影响。

  Oxford Nanopore首席执行官Gordon Sanghera评论道:

  “我们总是设计产品来重新定义基因组学的可能性,并向更广泛的社区引入重要的科学。今天,我们很激动能够再次重塑未来。凭借世界上可及性最高的高通量测序设备,我们正在打开基因组学市场,让任何人在任何地点都能获得准确度最高的人类规模的基因组数据。

  P2 Solo设备将进一步推动基因组学研究的民主化,并利用全面的纳米孔数据带来更多的科学发现。这提供了更广泛的基础,让这些发现在癌症、人类遗传学、传染病领域产生现实影响,并重塑我们与环境互动的方式。”

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