发布时间:2022-05-13 12:01 原文链接: DNA序列显示多形茶渍复合群多达100个物种

  地衣型真菌是一类能与蓝细菌或藻类共生形成稳定有机体的特化真菌,其物种演化和分类界定仍在不断地探索中。近日,中国科学院昆明植物研究所联合美国杨百翰大学、加拿大自然博物馆的科研人员,对采自亚洲、欧洲、北美洲和南美洲的300余份多形茶渍样品开展了物种界定研究,首次从DNA层面揭示了多形茶渍复合群极其丰富的物种多样性。相关研究成果发表在《真菌杂志》的地衣型真菌物种多样性、生态和进化历史特刊。

  茶渍科是地衣型真菌的第五大科,含1000余种,是地衣分类中问题最多、最为复杂的类群之一。其中,多形茶渍为世界广布种,不同材料间形态差异较大,使该种下亚种、变种和变型多达40余个。

  科研人员通过自主扩增的ITS序列结合GenBank的分子序列,采用ASAP和bPTP分析方法对多形茶渍复合群进行物种划分,ASAP分析结果显示该复合群包含62-103个种级分支,bPTP的物种划分结果为73个种级分支,与ASAP的结果基本一致,这些种级分支中仅10%左右为跨洲际分布。同时科研人员对该种复合群的五基因系统发育分析显示,绝大多数ASAP获得的种级分支与多基因分析结果一致。

  在此基础上,研究人员选取了美国西部的32个代表样品进行简略基因组测序,基于1209个单拷贝核基因构建的系统发育树同样支持ASAP的物种划分结果;线粒体基因组分析检测到一个基因渐渗事件,其余种级分支也与ASAP的划分结果一致。

  文章对多形茶渍复合群下潜在物种的地理分布初步分析,为该类群的分类研究提供新视野,多形茶渍复合群或可作为地衣型真菌谱系生物地理和物种形成研究的模式类群。

image.png

多形茶渍复合群形态特征(昆明植物所供图)

相关文章

DNA甲基化调控荔枝种子发育的机制获新进展

近日,华南农业大学园艺学院研究员李建国团队在岭南现代农业科学与技术广东省实验室和国家现代荔枝龙眼产业技术体系项目资助下,研究揭示了DNA甲基化调控荔枝种子发育的机制。相关成果发表于《实验植物学杂志》(......

度量衰老,科学家创建中国人复合DNA甲基化时钟

时间如梭,衰老是自然界不可抗拒的规律,但衰老的步伐并非一成不变——即使在同龄人之间,生理功能的衰退和器官老化的程度也存在显著差异。这些差异性说明个体的生物学年龄,即生理状态所反映的年龄,可能与其实际年......

最新研究:斑鬣狗DNA遗传信息反映社会地位等级

中新网北京4月1日电(记者孙自法)施普林格·自然旗下专业学术期刊《通讯-生物学》最新发表一篇遗传学论文称,一项研究发现,野生雌性斑鬣狗(Crocutacrocuta)的社会地位反映在其整个基因组的DN......

DNA打印机升级迭代PCR检测相关标准再更新

PCR检测——ISO标准发布近日,由上海海关主导制定的2项ISO标准正式获得国际标准化组织(ISO)通过并发布。这两项ISO标准是:《ISO/TS20224-10:2024分子生物标记分析——食品和饲......

NatureMaterials|南京邮电大学汪联辉/高宇/晁洁智能DNA纳米器件,精确溶栓!

南京邮电大学汪联辉、高宇及晁洁共同通讯在NatureMaterials在线发表题为“AnintelligentDNAnanodeviceforprecisionthrombolysis”的研究论文,该......

Cell:揭示蛋白PARP1形成的超级胶水对DNA损伤的修复至关重要

我们的DNA会不断受到损伤和修复。最严重的损伤发生在DNA断裂成两段时,即DNA双链断裂。它会产生两个松散的DNA末端,如果不加以修复,就会导致细胞死亡。在一项新的研究中,来自德国德累斯顿工业大学生物......

2023年美国质粒DNA制造市场规模达到18968万美元

2023年美国质粒DNA制造市场规模达到18968万美元,预计到2033年将达到115044万美元左右,2024年至2033年复合年增长率为19.57%。访问我们的医疗保健数据智能工具,其中包含100......

超过100个与DNA损伤相关的基因被发现

威康桑格研究所的研究人员及其剑桥大学英国痴呆症研究所的合作者进行了一项新研究,旨在确定细胞健康的生物学原理并确定维持基因组稳定性的关键基因。研究人员通过对近1,000个转基因小鼠品系的系统筛选,发现了......

Nature最新文章:基因测序游戏规则正在被改写,速度翻倍,仅需数小时

超高速测序推动基因组诊断快速发展简化的DNA和RNA测序工作流正在帮助临床医生在几天甚至几小时内提供迅速的有针对性的护理    约十年前,澳大利亚墨尔本的默多克......

Nature发布2024年值得关注的七大技术,首位中国科学家成果入选

2024年1月22日,《自然》发布了2024年值得关注的七大技术——大片段DNA插入、人工智能设计蛋白质、脑机接口、细胞图谱、超高分辨率显微成像、3D打印纳米材料和DeepFake检测。七大技术中,生......