发布时间:2020-02-21 16:20 原文链接: AI找到全新抗生素可杀死超级耐药菌

  今日,顶尖学术期刊《细胞》杂志刊登了一篇来自麻省理工学院(MIT)的研究论文。科学家们通过一种深度学习系统,让人工智能“慧眼识珠”,发现了一种潜在糖尿病药物的抗菌潜力。在动物实验中,这种全新的抗生素能有效杀死一种对已知所有抗生素都耐药的超级细菌。这一重磅发现也登上了当期《细胞》杂志的封面。

  科学家们是怎么想到用人工智能来寻找新型抗生素的呢?在论文的开头,他们介绍说自青霉素诞生以来,抗生素已经成为了现代医学的基石之一。然而随着抗生素的滥用,越来越多的细菌对抗生素产生了耐药性。不幸的是,过去许多抗生素都来自于土壤中的微生物,用开发传统药物的方式来开发抗生素并不容易。这也就不难理解,为何在过去的几十年里,诞生的新型抗生素寥寥无几,且结构上与过去已有的抗生素大同小异。

  为了改变这一困境,研究人员们开发了一种机器学习的模型。具体来看,这种模型能够自动学习不同药物分子里的结构,不但可以掌握这些分子的不同位置是否存在特定的化学基团,还能够预测这些分子的特性。

  随后,研究人员们给这种模型提供了2335个用于“学习”的不同分子,这些分子中有美国FDA已经批准的药物,也有不少具有广泛生物活性的天然分子。研究人员们希望在训练之后,这种模型能够学会识别能有效杀死大肠杆菌的药物。

  训练完毕后,是检验这套机器学习模型学习能力的时候了。研究人员们使用Broad研究所的一个化合物库,让这套模型从其中6111个分子里,寻找具有潜在抗菌潜力的分子。从中,这种模型认为一个分子具有很强的抗菌活性。有意思的是,这种分子原先是作为一种糖尿病药物而开发出来的,在结构上和已有的任何一种抗生素都明显不同。后续的一些研究,也表明该分子对人类细胞的毒性较低。

  据麻省理工学院的新闻透露,研究人员们致敬经典科幻片《2001太空漫游》(2001: A Space Odyssey),将该分子命名为halicin(电影里的人工智能系统叫做HAL 9000)。随后,他们在培养皿里测试了halicin对多种耐药菌的杀菌效果,而结果令人欣喜!除了铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,一种难治的肺部病原体)之外,halicin对所有测试的耐药菌都有杀伤作用。

  当然,培养皿中的结果,还不能代表活体动物上的抗菌疗效。于是,研究人员们又让小鼠感染上了一种超级耐药的鲍氏不动杆菌(A. baumannii)。同样据麻省理工学院的新闻介绍,这种超级细菌能耐受已知所有的抗生素!而halicin再次显现出了神奇的效果——含有halicin的软膏在24小时内,就彻底清除了感染。

  基于以上这些结果,研究人员们指出,halicin具有广谱的抗菌活性。而从机理上看,这是因为它能干扰细菌,不让它们形成跨膜的电化学梯度。一般情况下,这种电化学梯度能协助细菌产生能量。如果没有这种梯度,细菌就会死亡。研究人员们也提到,重塑电化学梯度的过程非常复杂,不是简单的几个突变就能完成的,因此这也最大程度上杜绝了耐药性的产生。

  利用这套系统,研究人员们进一步在另一个数据库里筛选了数亿个分子,并从中找到了23个与现有抗生素结构迥异,且对人类细胞无毒性的潜在抗菌分子。这一筛选过程,只用了短短的3天时间。后续的研究也表明,其中8个分子的确有抗细菌的活性,2个分子的活性尤其强。科学家们也计划继续对这些分子进行研究和评估。

  正如一些科学家所言,这项突破性的研究是抗生素药物研发的一个范式改变,有望提高我们发现新型抗生素的效率,给我们带来更多抗击超级细菌的武器。

相关文章

Nature子刊:老药新用,两种常用抗生素可诱导心脏再生

心力衰竭(HeartFailure)是一种影响全球约3000万人的严重疾病,在成年人中发生的原因是心肌损伤后无法自我修复。虽然成人心脏中的心肌细胞更新正常,但其更新速率不足以在心肌细胞大量丢失后恢复心......

有望治疗耐药菌感染,纳米“光镊”可捕获和操纵噬菌体

近日消息,瑞士和法国科学家携手,开发出一种芯片上的纳米“光镊”,能以最小光功率捕获、操纵和识别单个噬菌体,有望加速甚至改变基于噬菌体的疗法,治疗具有抗生素耐药性的细菌感染。相关研究论文发表于最新一期《......

核糖体结合“预组织”的抗生素克服了超级细菌

哈佛大学和其他地方的研究人员创造了一种合成抗生素,可以非常有效地对抗困扰许多现代抗生素的抗菌素耐药机制。一篇新的《科学》论文提供了该抗生素的设计、合成和评估的详细信息,题为“一种预先组织用于核糖体结合......

突破|新抗生素显著增强抑制耐药菌功效

细菌的抗生素耐药性正在使许多现代药物失效,甚至可能引起全球公共卫生危机。现在,美国哈佛大学研究人员开发的一种新抗生素克服了抗生素耐药性机制。据最新一期《科学》杂志报道,合成化合物克雷霉素(cresom......

消除抗生素污染新方法,速率更高、产物更安全!

抗生素在环境中残留会给人类健康带来危害,而在许多抗生素中,包括青霉素、阿莫西林、头孢氨苄等在内的β-内酰胺类抗生素用量占比约为70%。围绕水中β-内酰胺类抗生素的降解难题,近日,中国科学院化学研究所研......

最新研究:一种新型抗生素有望战胜一类多重耐药菌

当地时间1月3日起,英格兰近五万名初级医生开始为期六天的罢工,就薪酬问题抗议。分析指出,新一轮罢工将会影响冬季医疗需求高峰期间的就诊体验。2023年,英国医疗系统工作者曾进行一系列罢工,要求提高薪资待......

蚂蚁也会用抗生素?神奇的马塔贝莱蚁

马塔贝莱蚁广泛分布于撒哈拉沙漠以南,其饮食范围很窄:它们只吃白蚁。它们的狩猎探险是危险的,因为白蚁士兵会保护它们的同类,并使用它们强大的下颌骨来战斗。因此,马塔贝莱蚁在狩猎时受伤是很常见的。一只马塔贝......

中国科学院:水中抗生素污染去除研究取得进展

环境中残留的抗生素及其引起的耐药基因传播,给人类健康带来危害。在众多种类抗生素中,β-内酰胺类抗生素(如青霉素、阿莫西林、头孢氨苄等)用量占比约为70%。目前常用的生物降解方法处理效率因抗生素分子本身......

算法会诊降低儿科抗生素使用率

根据《自然·医学》近日发表的一篇论文,坦桑尼亚一项大规模随机临床试验发现,一种“算法会诊”,即数字决策支持工具可显著降低医生给儿童开抗生素药物处方的概率,且不会影响临床结局。研究报告图片来源:《自然·......

如何降低儿科抗生素使用率?《自然·医学》一文指出·······

根据《自然·医学》近日发表的一篇论文,坦桑尼亚一项大规模随机临床试验发现,一种“算法会诊”,即数字决策支持工具可显著降低医生给儿童开抗生素药物处方的概率,且不会影响临床结局。科研团队研究成果细菌耐药性......