目前,在饲料中添加的酶制剂都是由微生物生产的。利用微生物来生产酶制剂的两种方法,一是固体发酵,二是液体发酵。目前国产复合酶大多为固体发酵,生产的复合酶质量不稳定,发酵水平和酶蛋白的产量也较低。另外我国饲料厂颗粒饲料制粒温度普遍较高,温度对复合酶的酶活性有不同程度的影响,降低了酶制剂的使用效果,因此,如何减少在生产加工、贮存过程中对酶活性的影响是目前需要解决的重要问题之一。一方面要利用基因技术，开发研究出活性更高，适用条件更广的耐高温、耐酸、耐压的酶制剂及其包被材料。另一方面，改变传统的酶制剂添加工艺，采用酶制剂后置添加技术，即将液态酶制剂在饲料制粒、膨化后添加到饲料中去的技术，这样就可避免在饲料预处理和制粒、膨化过程中损失添加剂的有效成分。
不同的家禽消化生理不同，同一禽种的消化生理在不同年龄阶段也有所差异。酶是一种活性物质，温度、PH值和重金属等环境条件对其活力影响很大，因此应加强对不同禽种消化道内环境的研究，使饲料酶达到最佳效果。此外，饲用酶制剂的检测方法也应得到更深入的研究，使得测定结果能贴近实际，指导生产实践。