发布时间:2020-01-21 13:58 原文链接: 《科学》发表同济大学高亚威团队联合研究成果

  摘要:1月17日,同济大学生命科学与技术学院、附属东方医院高亚威教授联合美国芝加哥大学教授何川、中科院北京基因组研究所研究员韩大力合作完成的研究成果“N6-methyladenosine of chromosome-associated regulatory RNA regulates chromatin state and transcription”(《染色体相关RNA上的m6A 修饰参与染色质状态与转录活性的调控》),在线发表于国际顶尖学术期刊《科学》。

图片.png

  重大发现

  1月17日,同济大学生命科学与技术学院、附属东方医院高亚威教授联合美国芝加哥大学教授何川、中科院北京基因组研究所研究员韩大力合作完成的研究成果“N6-methyladenosine of chromosome-associated regulatory RNA regulates chromatin state and transcription”(《染色体相关RNA上的m6A 修饰参与染色质状态与转录活性的调控》),在线发表于国际顶尖学术期刊《科学》。该研究首次揭示了RNA的m6A修饰调控染色质状态和转录活性的重要机制,刷新了对m6A功能的认识。

图片.png

调控性染色质相关RNA通过m6A修饰调控转录的分子模型

  对于生命体来说,细胞是最小的功能单位,而在细胞中,DNA是遗传物质,它与自身缠绕的组蛋白共同形成染色质。DNA可以转录生成RNA,RNA随后被运输到细胞核外后,通过翻译作用可以形成不同的蛋白质。细胞就像是一个大的生产工厂,DNA和染色质就是工厂里面的核心生产线,不同生产线是不同的基因,可以生产出不同的模具。这些模具被运输出生产线所在的厂房后,通过翻译过程生产出不同的产品。但是同一个体的不同细胞产生的蛋白从种类到数量都有很大的不同,这就来源于染色质上表观修饰(包括DNA本身和DNA上结合组蛋白)以及RNA的表观修饰造成的影响,相当于分别对应生产线的控制和模具翻译成产品过程的控制。其中N6甲基腺嘌呤(m6A)是真核生物mRNA上常见的修饰类型,近年来,m6A被证明在胚胎发育、配子发生、免疫系统、以及各种肿瘤发生等过程中发挥了重要作用。但是,这两个表观调控系统之间是否存在直接的相互影响,一直尚无确切的结论。

图片.png

左一为高亚威教授,左四为博士生陈川

  为解答这一问题,研究者首先利用m6A“书写”蛋白METTL3缺陷的小鼠胚胎干细胞,分离了处于胞质、核质和染色质上三个空间内的RNA。结果发现,这个蛋白显著影响了染色质上的RNA,尤其是位于基因调控区域以及重复序列区域转录出的RNA(后文简称为carRNA)上获得m6A修饰。有趣的是,研究者发现这些carRNA上的m6A修饰可以进一步被修饰识别蛋白YTHDC1识别。而这个YTHDC1蛋白就如同生产线上的质检员,一旦发现生产线上的carRNA被METTL3加上了m6A修饰,就会把这条RNA拿去降解掉。

  更有意思的是,研究者发现,这种依赖于m6A的carRNA降解机制对于细胞来说非常重要。在METTL3或YTHDC1敲除后的细胞系中,carRNA出现累积后会直接影响相关区域,以及下游基因的转录活性,从而引起基因组水平的转录活性增加、染色质开放程度增加。这就意味着这种生产线上的质检和清除机制,可以有效控制生产线上的生产速度,降低因为开发程度增加引起的各种不稳定损伤。

  生命科学专家表示,此项研究不仅实现了对于染色质相关RNA的m6A修饰调控机制的探讨,更首次揭示了RNA的m6A修饰调控染色质状态和转录活性的重要机制。这对于研究和理解生物体复杂的表观调控网络,提供了新的思路与研究视角,具有很强的理论先导性和示范性。这一发现也为发育和疾病的调控和靶点开发提供了重要的理论依据。

  此项目的部分工作是高亚威教授在芝加哥大学公派访学期间与何川教授团队共同完成。其中,芝加哥大学何川教授团队的博士后刘君博士和豆晓阳博士以及中国科学院北京基因组研究所博士生陈传远为该论文的共同第一作者,何川教授、韩大力研究员与高亚威教授为论文的共同通讯作者。同济大学生命科学与技术学院博士生陈川通过同济大学资助的交叉学科短期国际交流项目,参与了本项目的多项工作。该论文在线发表于《科学》,是同济大学国际交流合作取得的又一重要成果。


相关文章

两所985高校共建全国重点实验室,拟今年开工

7月30日下午,同济大学与长三角生态绿色一体化发展示范区执行委员会(简称“示范区执委会”)、上海市青浦区人民政府、长三角一体化示范区新发展建设有限公司(简称“长新公司”)共同签署战略合作协议,四方共同......

三项第一!同济团队在国际比赛中获“大满贯”

近日,2025年IEEE国际计算机视觉与模式识别会议(CVPR)在美国举行。会上揭晓了超可见光谱感知挑战赛结果,同济大学计算机科学与技术学院教授赵生捷团队在全球300余支队伍中脱颖而出,在多模态视觉方......

7900万,同济大学发布2025政府采购意向

近日,同济大学公布2025采购意向,涵盖生物、医学等多个领域,总预算金额达到7901.3777元。清单显示,核型分析系统、超高效生物惰性液相色谱三重四极杆质谱系统、高性能聚焦超声波样本处理系统等多种科......

同济大学成立五大研究院,围绕“四大创新”发力

5月20日,同济大学举行人工智能赋能学科创新行动发展大会,并宣布学校围绕“工程智能”系统布局的首批五大研究院——工程智能研究院、医学人工智能研究院、极端环境建造研究院、自主智能机器人研究院、航空运输与......

同济大学力学系、航空航天工程系揭牌

11月12日下午,庆祝同济大学航空航天与力学学院成立二十周年大会暨力学系、航空航天工程系揭牌仪式在四平路校区举行。同济大学副校长许学军,原上海航空工业学校校长、同济大学航空航天与力学学院首任党总支书记......

张赫团队在《自然·通讯》上发文揭示DNAlncRNA三链体“招募促癌”新机制

DNA-RNA三链体是双链DNA与单链RNA相互作用形成的异源三链杂交体,在DNA-RNA三链体形成过程中,单链RNA与富含嘌呤的双链DNA通过碱基互补配对,利用Hoogsteen氢键形成并维持三链体......

同济大学成立新学院

同济大学融合原计算机科学与技术系、软件学院,成立计算机科学与技术学院。这是学校优化信息学科布局、提升学科整体创新能力的又一改革探索。今天(9月19日),同济大学计算机科学与技术学院揭牌仪式暨学科发展战......

同济大学成立新学院

同济大学融合原计算机科学与技术系、软件学院,成立计算机科学与技术学院。这是学校优化信息学科布局、提升学科整体创新能力的又一改革探索。今天(9月19日),同济大学计算机科学与技术学院揭牌仪式暨学科发展战......

同济大学校长寄语新生:人在事上练,刀在石上磨

9月1日上午,同济大学2024级新生开学典礼举行。同济大学校长、中国工程院院士郑庆华以《矢志成为崇尚科学、追求卓越的同济人》为题发表讲话,殷切寄语新学子。郑庆华表示,同学们志愿选择成为一名同济人,不仅......

“包高铁”,同济大学专列免费接云贵川渝藏学生来沪

8月18日,同济大学迎来2024级本科新生入学报到日。提前一晚,来自四川、重庆、云南、贵州和西藏五个省份的2024级本科新生和家长,乘坐高铁G2195顺利抵达上海虹桥站。同济大学常务副校长吕培明一行早......