新发现朝1000美元/人的宏伟基因组测序计划迈近了坚实一步
美国Helicos BioSciences公司研究人员近日称，他们开发出了一种新型的测序设备——单分子DNA测序仪(single-molecule DNA sequencers)。该仪器能够“阅读”单分子DNA的单个碱基。相关研究文章发表在4月4日的《科学》(Science)上。
图片说明：新方法测序无需进行DNA扩增。
(图片来源：Getty)
传统上，在测序之前，要先对DNA链进行扩增。这一过程往往会引入错误，并且对某些DNA片断来说无法很好地实现，从而使得对整个基因组进行测序变得尤为困难。
Helicos BioSciences公司以病毒M13为实验对象，首先将它的基因组截成小的片断，用一种酶将短小DNA标签附于每个片断的末端，在适当的位置锚定DNA片断。之后加入DNA复制酶和带有荧光标签的碱基或碱基对。当荧光DNA形成链时，就用相机拍下每个新加上的碱基对。
这一新方法称为“合成测序”，原则上与其它一些方法相同。不同之处在于，其它一些方法需要同时测序数千个相同的基因组片断以使信号足够“明亮”，新方法能够侦测到单个碱基的荧光。
新方法避开了繁琐的扩增过程，将能大大降低测序的时间和成本。Helicos BioSciences公司估计，新仪器能够用8周的时间测序一个人的基因组，代价是7万2000美元，而仪器本身则价值135万美元。
美国能源部联合基因组研究所主任Edward Rubin说：“这太酷了!最终，单分子测序将成为通行的方法。”
新的发现无疑又朝着1000美元/人的宏伟基因组测序计划迈近了坚实的一步。论文第一作者Timothy Harris认为，这一目标将会在5年以内实现。
(《科学》(Science)，Vol. 320. no. 5872, pp. 106 – 109，Timothy D. Harris，Zheng Xie)
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