丝氨酸蛋白酶水平的测定在特定疾病的背景下可能有用。
在诊断出血性或血栓性病症时可能需要凝血因子水平。
粪便弹性蛋白酶用于确定胰腺的外分泌活性，例如在囊性纤维化或慢性胰腺炎中。
血清前列腺特异性抗原用于前列腺癌筛查、风险分层和治疗后监测。
由肥大细胞释放的丝氨酸蛋白酶是1型超敏反应（例如过敏反应）的重要诊断标志物。由于更长的半衰期，比组胺更有用，这意味着它在系统中保留临床有用的时间长度。
