近日,中国科学技术大学袁军华、张榕京课题组在生物分子机器领域取得新进展,发现一类膜蛋白分子机器(鞭毛马达)动力学过程中的一个全新状态:暗态。研究结果以A hidden state in the turnover of a functioning membrane protein complex 为题发表在《科学进展》(Science Advances)上。

膜蛋白分子机器是一类重要的分子机器,以往一般采用荧光技术对其活体动力学进行研究。由于荧光漂白效应,对单机器的动力学很难做长时间观测,有可能会忽略其动力学过程的某些重要信息,这些技术难点让相关研究面临很大的挑战。细菌鞭毛马达是一种典型的膜蛋白分子机器,袁军华、张榕京团队以其为例,发展了对单马达动力学进行长时间精确观测且对大量单马达数据进行统计物理分析的方法,从而发现了其动力学过程的暗态(hidden state)。
细菌鞭毛马达由多个定子产生力矩,近年来人们发现每个定子都随机地与马达结合与脱离,且其脱离概率取决于马达负载,所以定子与马达的结合是个典型的逆锁结合(Catch bond)。依靠这个机制,马达能适应不同的负载来调节其定子数。一直以来,大家认为定子与马达结合/脱离这个随机过程可由一个简单的双态模型来描述,每个定子可处于两种可能的状态:结合态与脱离态。该团队通过对大量单马达稳态下定子数目的长时间精确观测,统计出特定定子数的驻留时间分布,从而发现其分布形状是典型的双指数形式,而非双态模型预言的单指数形式。通过这些实验测量,结合对这个随机过程的理论分析,该团队发现了定子结合/脱离马达这个随机过程中的一个全新状态(称之为暗态),提出了三态模型来描述这个随机过程,并进一步运用分子生物学结合统计物理分析,确定了暗态的存在及其特征。暗态的发现将进一步加深对马达动力学的理解。
暗态与结合态、脱离态相比,寿命短了2个数量级。这种巨大的时间尺度上的差异,使得以往传统的荧光或生物化学技术都很难发现该态。该团队此次提出的对生物动力学过程进行单分子/单马达/单过程的长时间精确观测,并结合驻留时间分布的统计物理分析,对其它生物马达、生物动力学过程的研究也有普遍意义。
中国科学院南海海洋研究所研究员高贝乐团队针对细菌鞭毛马达中E环展开系统研究,全面梳理了其研究进展,并指出E环是一类在细菌界分布广泛且具有古老起源的鞭毛结构组件,为理解细菌运动纳米机器的起源与结构演化提......
浙江大学近日发布消息称,其科研团队以《DenovoDesignofGPCRExoframeModulators(GPCR外骨骼蛋白的从头设计)》为题,在《自然》期刊发表重要成果,利用人工智能设计出可精......
鞭毛是驱动细菌细胞运动的重要纳米机器,在海洋等多种环境中协助细菌实现空间迁移与环境响应。不同细菌的鞭毛结构差异明显,以往研究主要集中于结构简单的模式菌株大肠杆菌和沙门氏菌的马达。然而,自然界中大多数细......
鞭毛是驱动细菌细胞运动的重要纳米机器,在海洋等多种环境中协助细菌实现空间迁移与环境响应。不同细菌的鞭毛结构差异明显,以往研究主要集中于结构简单的模式菌株大肠杆菌和沙门氏菌的马达。然而,自然界中大多数细......
1月9日,《自然-微生物》在线发表于中国科学院南海海洋研究所研究员高贝乐团队与美国耶鲁大学教授刘骏团队、山东大学教授高翔团队合作最新成果。他们成功揭示了细菌复杂鞭毛马达的精细结构、组装时序与演化路径。......
1月9日,《自然-微生物》在线发表于中国科学院南海海洋研究所研究员高贝乐团队与美国耶鲁大学教授刘骏团队、山东大学教授高翔团队合作最新成果。他们成功揭示了细菌复杂鞭毛马达的精细结构、组装时序与演化路径。......
美国加州大学戴维斯分校一项新研究揭示,压力不仅影响大脑,还会在分子层面改变心脏功能。相关论文发表于最新一期《分子与细胞心脏病学杂志》。图片来源:物理学家组织网这项研究聚焦于环境与社会压力因素,如噪音、......
化合物结构测定能够帮助人们认识、利用和改进药物和天然产物中的有效成分。由浙江大学、美国得克萨斯大学奥斯汀分校及浙江师范大学、南京大学学者组成的联合研究团队提出“超分子对接”概念,利用“分子捕手”,特异......
美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室科学家领导的团队首次发现一种含有锫(Berkelium)的有机金属分子——“锫茂”(Berkelocene),为深入理解物质构成的基本原则开辟了新途径。相关研究论文发表......
图(a-c)可级联响应肿瘤微环境的分子组装探针及其研究示意图;(d,e)小鼠模型上原位胰腺癌的荧光成像与信号强度变化在国家自然科学基金项目(批准号:22274074、2137003)等资助下,南京大学......