中国科学院是国内自然科学的最高学术机构,是科学技术最高咨询机构,也是自然科学与高技术综合研究发展中心。中国科学院具有完整的自然科学学科体系,材料科学、化学、物理、数学、环境与生态学、地球科学等学科的整体水平均已经进入世界先进行列。

目前,中国科学院共拥有全国各地的12个分院、100多家科研院所以及3所直属(共建)的普通高等学校,这三所高校包括中国科学院大学、中国科学技术大学和上海科技大学。
其实,在国内高等教育的发展史上中国科学院曾经直属过很多所高校。比如历史上曾经存在过的中国科学院管理干部学院和中国科学情报大学都被中国科学院直属过,还有长春光学精密机械学院和甘肃科学技术大学建校以来就直属于中国科学院领导。另外浙江大学、成都科学技术大学和哈尔滨科学技术大学曾经在1978年被确定为中国科学院直属高校,不过现在都已经划归教育部或者地方直接管理了。
在1978年第一届全国科学大会后,中国科学院在原有直属高校中国科学技术大学的基础上,将浙江大学、成都工学院、黑龙江工学院划归其管理,后面两所高校更名为成都科学技术大学和哈尔滨科学技术大学。
成都科学技术大学是早期的中国西部地区实力最雄厚的全国重点工科大学之一,学校拥有的国家重点学科、国家重点实验室、科研经费、科技转化、博士点、博士后流动站等均为当时西南地区工科高校第1位,1994年,原四川大学、成都科学技术大学、华西医学大学合并为新的四川大学,如今排名全国前30名以内。
哈尔滨科学技术大学经过发展的隶属关系很快改成了机械工业部领导,在1995年哈尔滨科学技术大学、哈尔滨电工学院和哈尔滨工业高等专科学校合并改名成为哈尔滨理工大学,学校的特色主要是高电压与绝缘技术,成为一所黑龙江省属的办学规模最大的大学之一。但是,由于哈尔滨还有两所曾经的全国顶级高校,一所是哈尔滨工业大学(哈工大),另一所示哈尔滨军事工程学院(哈军工),哈尔滨工业大学和哈尔滨工程大学这两所大学如今都直属于工信部,在全国都是双一流建设高校,所以哈理工与其相比逊色了很多,哈理工排名在全国180名左右。
中国科学技术大学一直都是中国科学院的重中之重建设的高校,位于安徽省合肥市,位列世界一流大学建设高校A类高校,也是211工程、985工程和首批20所学位自主审核重点高校之一,集万千宠爱于一身。学校的创办被称为“中国教育史和科学史上的一项重大事件”,也是唯一参与国家知识创新工程的大学,如今发展成为一所以前沿科学和高新技术为主、兼有特色管理和人文学科的综合性全国重点大学,在全国排名10名以内。
曾经都是中国科学院直属的高校,如今这几所大学发展差距非常大,有些高校成为国内顶尖高校,有些高校却沦落在全国排名200名左右。
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