为什么新的致命性病毒很难被发现

　　在最近发表的一篇文章中，由MIPT研究人员组成的俄罗斯研究团队是首次系统地描述和总结了目前快速发展的病毒遗传学领域的前沿技术。在过去的几年中，已经开发出许多新的有效的病毒检测方法，包括针对未知病原体的方法。作者将所谓的高通量下一代测序描述为一种有效的新方法。该方法有望彻底改变新的病原病毒的检测和分析方法，但是将其引入主流临床实践至少要花费数年的时间。

　　为了应对COVID-19大流行的迅速蔓延，作者在《Virus》杂志上发表了有关识别和研究新兴病原体（如冠状病毒）的问题的基本综述。

　　MIPT历史遗传学，放射性碳分析和应用物理实验室的研究员，作者之一Kamil Khafizov说：“根据各种统计估计，有超过32万种感染哺乳动物的病毒。但是到目前为止，只有不到1％的物种得到了研究。”

　　（图片来源：cc0 public domain）

　　大多数病毒，包括引起人类呼吸道，消化系统疾病和其他疾病的病毒，仍未得到人类的研究，因此几乎无法检测。其背后的原因是现代测试系统针对的病毒范围较窄。

　　但是，有一些新方法可能潜在地解决了检测和识别新微生物的问题，并且本综述探讨了这些方法。作者认为下一代测序（NGS）是最有前途的，它可以并行分析多个DNA分子，无论是一组样品，同一基因组的不同区域，还是两者都可以。

　　“高效的数学算法是该方法的关键部分，” MIPT博士生兼评论的通讯作者Alina Matsvay说。 “它们使研究人员能够将未知病毒的基因组与所有可用的病毒基因组参考进行比较，并预测其所有可能的特征，包括其致病潜力。”

　　NGS的主要缺点包括运行此类测试所需的设备和试剂的高成本以及冗长的样品制备，测序和数据分析过程。这些限制，再加上对实验室人员资格的高要求，使得该方法无法广泛集成到主流临床实践中。然而，该技术的成本逐年下降，而其速度，准确性和效率却在不断增长。

　　作者指出，冠状病毒大流行已证明NGS方法对于鉴定临床样品中的新病原体和研究病毒从动物向人类传播的分子机制的重要性。该技术可能会在不久的将来获得医疗保健方面的认证。