人体解剖学空间图谱(SAHA)项目——探索新细胞类型

　　对宇航员的样本进行测序让威尔康奈尔医学院的克里斯梅森开始从天文学角度思考。 现在，他正在尝试进行与发现新行星相同的生物学研究——发现新的细胞类型。

　　就像通过与其他行星或恒星的引力相互作用发现行星一样，空间组学技术使研究人员能够“第一次看到相互作用以挑选出新型细胞”或功能改变的细胞，这些细胞实际上是新细胞 类型，梅森周一晚上在基因组生物学和技术进展年会上的一次演讲中说。

　　“令人兴奋的是，我们可以看到细胞交流方式的转变，”他说，并补充说这种类型的分析可以“为新生物学打开大门”，例如配体-受体分析、核糖体和其他细胞器生物学以及细胞骨架 转变。

　　近日，Weill Cornell 和 NanoString Technologies 宣布启动人体解剖学空间图谱 (SAHA) 项目，该项目将分析来自不同健康成年人群的 30 个器官样本，以提供亚细胞分辨率的身体图谱。

　　梅森告诉 GenomeWeb，该项目的资金总额约为 150 万美元，来自多个来源，以及来自 NanoString 的实物捐助和试剂折扣，数量不详。 样本处理由内部和 NanoString 完成。 Mason 的实验室已经拥有 GeoMx 数字空间剖面仪，并期望在接下来的几周内启动并运行 CosMx。

　　在演讲中，梅森展示了在 NanoString 的空间平台上分析的前几个前列腺、肝脏和结肠样本的数据。 该项目的目标是从每个器官分析三到五个样本开始。 “越多越好，”他指出。 除了来自健康个体的样本外，SAHA 还将分析大约 10 组肿瘤样本，包括肺癌、结直肠癌和血液癌。

　　至于发现新的细胞类型，他举了一个从分析结肠样本中收集到的例子。 他说，来自结直肠癌患者的一项研究发现，在注释的正常细胞中，这些细胞“非常异常，看起来不像其他任何东西”。

　　不过，进行此类研究的速度仍然是一个挑战。 “数据的深度非同寻常，但吞吐量中等，”梅森指出。