（1）通过密码子优化，提高外源基因的表达量。（2）序列已知，但难以获得生物样品的基因。（3）表达条件苛刻，表达丰度极低的基因。（4）人工设计的各种基因。（5）人工设计的核酶。（6）用于DNA芯片的大量cDNA。（7）对基因进行各种人工改造。
