来自芝加哥大学、北京大学的研究人员在新研究中,揭示出了拟南芥m6A甲基化组(methylome)的独特特征。他们的研究结果发表在11月28日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。
芝加哥大学的何川(Chuan He)教授、Joy Bergelson教授以及北京大学的贾桂芳(Guifang Jia)副教授是这篇论文的共同通讯作者。
N6-甲基腺苷(N6-methyl-adenosine(m6A))是发生在碱基A第六位N原子上的甲基化形式,作为真核生物RNA最常见的一种RNA转录后修饰,其导致了超过80%的RNA碱基甲基化,在各种物种都可以观察到这种RNA修饰。
这种修饰方式是在2012年由来自康奈尔大学维尔医学院的研究人员所发现。当时研究人员发现长期被视作是生成蛋白质的简单蓝图的信使RNA(mRNA),它的一个碱基腺嘌呤上往往会被添加一个甲基而发生化学修饰。过去mRNA被认为只包含4个碱基,这一研究表明第5个碱基——m6A遍布转录组。
随后,科学家们在哺乳动物和酵母中绘制出了m6A甲基化组图谱,揭示出这一RNA修饰具有潜在的调控功能。在植物中,m6A甲基转移酶缺陷可导致胚胎致死性表型,表明了m6A对植物发育也起着至关重要的作用。
在这篇文章中,研究人员报告称他们绘制出了两种拟南芥中的m6A全转录组图谱,揭示出在植物中m6A是高度保守的mRNA修饰形式。不同于哺乳动物中的m6A,拟南芥中m6A不仅富集于终止密码子周围和3'-非翻译区(3'-UTR)内,在起始密码子的周围也有着丰富的m6A。
借助于基因本体学分析(Gene Ontology Analysis),研究人员证实m6A在拟南芥中m6A的独特分布和与叶绿体相关的一些植物特异性信号通路有关联。此外,他们还发现了m6A堆积和mRNA丰度之间存在正相关关系,表明m6A对植物基因的表达起重要的调控作用。
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