1、吡喹酮片治疗寄生于组织内的寄生虫如血吸虫、肺吸虫、囊虫等，由于虫体被杀死后释放出大量的抗原物质，可引起发热、嗜酸粒细胞增多、皮疹等，偶可引起过敏性休克，必须注意观察。
2、脑囊虫病患者需住院治疗，并辅以防治脑水肿和降低高颅压（应用地塞米松和脱水剂）或防治癫痫持续状态的治疗措施，以防发生意外。
3、合并眼囊虫病时，须先手术摘除虫体，而后进行药物治疗。
4、严重心、肝、肾患者及有精神病史者慎用吡喹酮片。
5、有明显头昏、嗜睡等神经系统反应者，治疗期间与停药后24小时内勿进行驾驶、机械操作等工作。
6、吡喹酮片在囊虫病驱除带绦虫时，需应将隐性脑囊虫病除外，以免发生意外。